KEGG   Polaribacter sp. MED152: MED152_03360
Entry
MED152_03360      CDS       T02533                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
pom  Polaribacter sp. MED152
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pom00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pom02000]
    MED152_03360
Transporters [BR:pom02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   MED152_03360
SSDB
Motif
Pfam: pAdhesive_15 PKD_4 PKD Por_Secre_tail TSP_3 MAM DUF5382 Ig_7
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ41720
UniProt: A2U1F5
LinkDB
Position
complement(721080..726776)
AA seq 1898 aa
MKLTSKHYLALLLVFACSLYNPVFSATQTDPCTVGAVVGVITANDADGDGINNDCDLDDD
NDGILDTEECTVLIGETPFEVENGASVNFSLTPVGTGFVLDITKMDNSFNLTINGTPLTT
QEIQFQQNGTTTGQNIRFKDGSLWGKNGIPQIYQFQYYGTVQPETPLVRFVVDENLDVKM
YASKVSNGPLFELELFNGNAFNNFTWNATSSNNFIVSQEVAGPTYIFGRVYGTFTDCDVD
NDGIDNNLDLDSDGDGCFDVVESGGLDANNDGIADGSGFTNDGLVSGSSGTYDGLTGFET
TAHSFNVSNLPSDKTIAYGNSTSFTIEATSEEATSYTNGNPVYANAGNANDKIQYQWYLG
DPNNGGTILTDSGVYSNTTSKTLNITNTAGLYNNTYYVKVTHSDNACVNEVASAQLLANP
CDALASGNLDTDLDGVADLCDSDDDNDGIKDDLEGCAETNTIFEENFGFGTTRESNSNVA
NHTYDTEGAIPDGSYAVVSSLSPGLAHYNRTDRNGDVDADGDSNGRFLSININSPAVSEI
YRQNDITVNSANKHRFRVDFSGLCFGCNDTPIFTLLIEDENGNELVSITSTQIGVLNDDQ
WKRVTLEFTPTTSKVNIVIKNSQPNGNAGNDVGVDNILLTEITCDLDTDNDGIPNSKDLD
SDGDGCLDVVESGGLDANNDGIIDGTGFDNEGLVEGSTGGYDGSNGNEVNAHQLAVVSSP
VDKSIKVGEATSFTVAVSAEQATSYTNGSPNYATAGNSNNDVVYQWYLGDPNNGGTAISN
SGVYSGATSATLNIADVTGLDNTTYFAEISHANNACILETVNATLTEDTCSESPTSAALG
FNVFTLNGLELSTNETEGAVATGGDLTISGNYQITTNDAGSFEVNNVPVGLVVGGKVNYN
SGNALQLNQNTYLKIGESNGAVVWYQDQNSAFAPIRVTSNSNYNSSPRIALQANANQLGV
SSTNNPVFESNVIDFASAFQSLKNNSVSISQKTNNAVLTNPNGQSISNTGLPNQVKINLQ
DGVNYLNITGTDLNNVSVFTYNNKPSASKVLVINVDASGTFEWNVWNQAGVGQQDAPYIM
YNFYNTTTLNIKGNSTIEGTVLAPNADVVKTVNQANIEGQVIANSFKHAGGEVHSANFTP
TIGGCSVNNGVAPTADFSVNNETQCLAGNSFEFTNNSNTGNTVQPGNPITYVWDFGDNTS
STLMSPTKVYNTTGTYTITLEATNSFGTDVFTKQIVVKQEATISLTTSTITNSDNSVIKN
FTIDNANDFTSFTWSFLDQNKYEIQNLGTDVSATTTISNAGLYYVEVSAVDVNGCSVTQQ
FPVTVTSDEVSGGNGGGVESESLGDAISKIYVARKKNSVPTNFVKSSANLYNKAKLKQAQ
PYQGKGQTLLDMFPTELIAGNVANVTSPTDILDYTIADEVLSVDFSVDGKTKGVVLGIKT
SDKIYNHTKASCDRLRGAEILNIQKVHLEGYNFLMQAIKQRNGVVEYAISFATAKNNNDA
NYTIQTNWYVNNYIKFNDVYNFQVWSTNPTDTQKLVKDVLHNLNTFMPVKQTEIQKVPKT
FAAKISREKSELLILLRSTQKGLNTEISMEEIYSETANNVKHRYNPVNTELEQTLRVDIA
DGYEYDGLVKVDGEIEDAFYHADGNWGLDYDKNYTEIENYFVWNNFNREYKDDEHAINRS
VEIKAKSEYDYLTIYKSLLPGTLSADYSEYNYVAFTAKGSGLMELGLIKSSIEDWKAQYR
VMVDLSEDEQTYYVPFEIFASSASENTITADDLTTLTFTFLPVEAQTKELDLVISDVRFT
KVAVESETVNKIEKFENEFMAYPNPSKGNVNVMLFSEHDTEATVTLTDINGKTIYRGTAN
LTVGKNELDYNFNVKPGVLFLKVTSQESDYGTSKILFR
NT seq 5697 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacttacctctaaacattacctagccctattattagtttttgcttgtagtttatat
aacccagttttttcagcaacacaaacagatccttgcactgttggtgcagttgtaggtgtt
attactgctaacgatgctgatggagatggaataaataacgactgtgatctagatgatgat
aatgatggaattttagatactgaagaatgtactgtattaattggtgaaactccttttgaa
gtggagaatggtgcttcagtaaatttttctttaacaccagttggaactggttttgtttta
gatattactaaaatggacaatagttttaatttaactattaacggcactcctttaacaaca
caagaaattcagtttcagcaaaatggaacaactacaggacaaaatattagatttaaagac
ggtagtttatgggggaaaaatggtattcctcaaatttatcagtttcagtattatggaact
gtacaaccagaaactcctctagttcgttttgtagtagatgagaatttagacgttaaaatg
tatgcaagtaaagtttctaatgggcctttatttgaattagaattatttaatggtaatgct
tttaataattttacttggaacgcaacttcatctaacaattttattgtttcacaagaagta
gcaggaccaacctatatttttggtagagtatatggaacttttacagattgtgatgttgat
aatgatggtatagataataacttagatttagattctgatggagatggatgttttgatgtt
gtagagtctggagggttagatgctaataacgatggtattgcagacggttctggttttaca
aatgatggtttagtttctggttcttcaggaacttacgatggcttaactggttttgaaaca
actgcacacagttttaatgtatcaaatttgccatcagataaaactattgcctatggtaat
tcaacatcatttacaattgaagctacatcagaagaagcaacaagttacactaatggaaac
cctgtttatgctaatgcaggaaatgcgaatgataaaattcaataccaatggtatttagga
gatccaaataatggaggaactatattaactgattctggtgtttattctaacacaacatca
aaaaccttaaatattacaaatacagctggtttatataataacacatactatgttaaagta
actcattcagataatgcttgcgtaaacgaggttgcaagtgcacaattattggctaatcct
tgtgatgctttggcttcaggaaatttagatacagatttagatggagtagcagatttatgt
gattcagatgatgataatgatggtataaaagatgacttagaaggatgtgcagaaacaaat
acaatttttgaagaaaattttggtttcggaactactagagaatctaactcaaatgttgcc
aatcatacttatgatactgaaggcgcaattcctgatggttcttatgcagtagtttcttct
ttaagtccaggtttggcacactataatagaacagatagaaatggcgatgttgatgcagat
ggtgattctaatggtagatttttatcaataaatatcaattcacctgcagtttcagaaata
tatcgtcaaaatgatattacagtaaactcagcaaacaagcatagatttagagtagatttt
tctggcttatgttttggttgtaatgataccccaatttttactttattaattgaagatgaa
aatggtaatgaattggtttctataacatcaactcaaataggagtattgaatgacgatcaa
tggaaacgtgtaaccttagagtttacaccaactacttctaaagtaaatattgtaattaaa
aattctcagcctaatggaaatgcgggtaatgatgttggtgtagataatattttattaact
gaaattacttgtgatttagatacagataatgatggtattcctaacagcaaagatttagat
tcagatggagatggttgtttagatgttgttgaatctggaggattagatgccaataatgat
ggtattattgacggaactggttttgataatgaaggattggttgaaggttctactggagga
tatgatggttctaatggaaatgaggtaaacgcacatcaattagctgtagtttcaagtcct
gtggataaatcaattaaagttggagaagctacttcttttacagtagcagtttctgctgag
caagcaacaagctatacaaacggatctccaaattatgcaactgcaggtaattctaataat
gatgttgtttatcaatggtatttaggagaccctaacaatggaggtactgcaatttcaaat
tctggtgtgtattcaggtgcaacttctgcaaccttaaatatagcagatgtaactggttta
gataatacaacttattttgctgagatttctcatgcaaacaatgcatgtatattagaaact
gtaaatgcaactttaacagaagatacttgtagcgaaagtcctacaagtgcagctttaggt
tttaatgtgtttacattaaacggtttagaattaagtactaacgaaactgaaggtgctgtt
gcaactggaggagatttaaccatttctggtaactatcaaattacaacaaatgatgctggt
agttttgaggtgaacaacgttcctgtaggtttagttgttggtggtaaagtaaattacaat
tcaggaaacgcattacaacttaatcaaaatacttatttaaagataggagaaagtaatgga
gctgttgtttggtatcaagatcagaatagtgcatttgcacctataagagttactagtaat
tcaaactataactcaagtccaagaattgctttacaagcaaatgcaaatcaattgggagtt
tcaagtactaataatccagtttttgaaagcaacgttatagattttgctagtgcttttcaa
agtttaaaaaataattcagttagtatttctcagaaaacaaacaatgcagtattaactaac
ccaaatggacaatcaatttcaaatacaggtttgccaaatcaagtaaaaattaatttacaa
gatggtgtaaactatttaaatattactggtacagacttaaacaatgtaagtgtatttact
tacaataataagccaagtgcttctaaagttttagtaataaatgtagatgcttcaggtaca
tttgaatggaatgtttggaatcaagcaggagtaggtcagcaagatgcaccatatataatg
tataacttttacaacactacaactttaaatattaaaggaaattctacaatagaaggtaca
gttttagcaccaaatgctgatgttgtaaaaacagtaaatcaagcaaatatagaagggcaa
gtaattgcaaactcatttaaacatgcaggtggagaagtacattcagcaaactttacacct
actattggtggttgttctgtaaataatggagtagctccaactgctgatttttctgtaaac
aacgaaactcaatgtttagctggtaattcatttgaatttacgaataattcaaatacgggt
aacacagttcaaccaggaaatccaattacttatgtttgggattttggagataatacttca
agtactttaatgagtccaacaaaagtttataatactacaggtacgtatacaataacttta
gaggcaactaattcatttggtacagatgtttttactaaacaaattgttgttaagcaagaa
gctactatttctttaactacaagtacaattacaaattctgataatagtgtaattaagaat
tttacaatcgataatgctaatgactttacatcatttacttggtctttcttagatcaaaat
aaatatgaaattcaaaatttaggaacagatgtttcagcaacaactactatttctaatgca
ggtttatattatgtagaggtttcagctgtagatgtaaatggatgttcagtaacacagcaa
tttcctgtaacagttacttcagatgaggtttctggtggaaatggaggaggagtagaatct
gaatctttaggtgatgctatttctaaaatttatgtagcccgaaaaaagaattctgtgcca
actaactttgtaaagtctagtgctaacttatacaacaaagcaaaattaaagcaagctcaa
ccttaccaaggaaaaggacaaactttgttagatatgtttccaacagaattaattgctggt
aatgttgctaatgtaacttcgccaacagatattttagactacactattgcagatgaagtt
ttatcggtagatttttctgtagatggtaaaacaaagggagttgttttaggaattaaaaca
tcagataaaatttacaatcatacaaaagcttcttgtgatagattaagaggagcagagatt
ttaaatattcaaaaagtgcatttagaagggtataatttcttaatgcaagcaattaaacaa
agaaatggagtagtagaatatgcaatttcttttgcaactgcaaagaataataatgatgcg
aattataccattcaaacaaattggtacgtaaacaattacataaaatttaatgatgtttat
aattttcaagtttggtctacaaatccaacagatacgcaaaaattagtgaaagatgtttta
cataacttaaacacttttatgcctgttaaacaaacagaaattcagaaagtacctaaaaca
tttgcagcaaaaatcagtagagaaaaatcagagttattaattcttttaagaagtactcaa
aaaggtttaaatacagagatttctatggaagagatttattctgaaactgctaataatgta
aaacacagatacaacccagtaaatacagaattagagcagacattaagagtagatattgca
gatggttatgagtatgatggtttagtaaaagttgatggtgaaattgaagatgctttttat
catgcagatggtaactggggcttagactatgataaaaactatacagaaattgagaattac
tttgtttggaacaatttcaatagagaatacaaagatgatgagcatgccattaatagaagc
gtagaaattaaagcaaaaagtgagtacgattatttaaccatctacaagtctttattacca
ggaacactaagtgcagattactcagaatacaattatgttgcattcactgccaaaggttct
ggattaatggaacttgggttaattaagtcatctatagaagactggaaggcacaatataga
gtaatggtagatttatctgaagatgaacaaacttactatgttcctttcgaaatatttgct
tctagtgcatcagaaaacacaattactgcagatgacttaacaacattaacttttacattc
ttacctgtagaagcacaaactaaagaattagatttagtaatttctgatgtaagatttact
aaggttgctgtagagagtgaaactgtaaataaaatagagaagttcgaaaatgagtttatg
gcatatccaaatccttctaaaggaaatgtaaatgtgatgttatttagtgagcatgatact
gaagcaacagtaacattaacggatattaatggtaaaacaatctatagaggaactgcgaat
ttaactgtaggtaaaaacgaactagactataattttaatgtaaaacctggtgttttattc
ttaaaggttacaagtcaagagtcagattatggtacttcaaaaatactgtttagataa

DBGET integrated database retrieval system