KEGG   Polaribacter sp. MED152: MED152_09725
Entry
MED152_09725      CDS       T02533                                 
Name
(GenBank) TonB dependent/ligand-gated channel
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pom  Polaribacter sp. MED152
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pom00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pom02000]
    MED152_09725
Transporters [BR:pom02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   MED152_09725
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Plug PEGA DUF5721 CooC_C Big_3_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ42993
LinkDB
Position
complement(2172994..2175345)
AA seq 783 aa
MKKTINFLFLFASILVNAQSYQLSGKVVDQNNEPLANATVYAKNLQRGTTTKADGSYLLN
LPKGEHFIQVTYLGYKSYLQGIVITNENVTANFTLQYENTVLDEVLVNAVRVNADIPVTF
SNLSKKEIAKRNLGQDIPILLNYLPSVISSSDAGAGVGYTYMNVRGSNGERINVTVNGIP
YNDAESHGTFWVNLGDFASSTENLQLQRGVGTSTNGSGAFGASLNILTDAVSEEAYGEIS
NSFGSFGTRKHTVKFSTGKINDHIEFAGRLSDIYSDGYVDRAFTDLKSYYLQGSYSDDNT
LIKAITFGGEERTYQSWFGLDATQLAQDRRQNPYTYENEVDDYGQNHYQLHWNEQLNEKW
STTLGLNYTKGSGFFEQYKPGESAADFNNLIADGSDVIVRRWLDNDFYVANFNTNYKTEK
LNLITGISYSNYTGDHFGEVIWGSDLAPNTEIRDRYYFSDATKNDFSLFAKANFYISEKL
SGYADLQGRFVSYQTQGLTSDRAPIDVDANFDFFNPKFGLTYNVNANNNLYASFAVANRE
PNRNDFENGVSTPETLNDLEVGWRLNNGKVKLNTNVYYMDYKNQLVLTGALDDVGAPVRE
TSGSSYRLGLEIDADIRFSDKFSWKPNAAFSTNKNRDFFITRDGNTTPELLGNTDISFSP
NVIVGNMFIYNPTDNLQLTLLSKYVGEQFLSNLSSAISTNDVLESYFTSDINIVYTITPN
KIFDSITLTALINNIFDTEYVDRGYYFTYDDDFSVPGTVTTVDGAGYYPQATRNFLIGAT
LRF
NT seq 2352 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaactatcaattttttattcttgtttgcaagtatacttgtaaacgcacagtcc
taccaactttcaggaaaagtagtagaccaaaacaacgaacctttagccaatgcaactgtt
tatgcaaaaaatttacagagaggtaccactacaaaagcagatggttcttacctactaaat
ttgccaaaaggtgaacattttattcaagtaacttatctaggttacaaaagctatttacaa
ggcattgtaattaccaatgaaaatgtaactgccaattttaccctgcaatatgaaaatact
gtattagatgaagttcttgtaaatgctgtaagggtaaatgcagatattcctgtaacgttt
tctaatttatctaaaaaggaaatcgcaaagcgtaatttaggacaagacattcctattttg
ttaaactatttaccttctgttatttcatcttcagatgcaggtgcaggtgttggttacact
tacatgaatgtccgtggttctaatggagaaagaattaacgtaaccgtaaatggtatacct
tataatgatgcagaaagtcatggaactttttgggttaatttaggtgattttgcatcgtct
acagaaaacttacaactgcaaagaggtgtaggtacatcaaccaatggttcaggtgctttt
ggtgcaagtttaaatattttaacagatgctgtttctgaagaagcttatggagaaatttcg
aattcttttggttcttttggcacacgtaagcatactgtaaaatttagtacaggtaaaatt
aacgaccatatagaatttgcaggacgtttgtctgacatttattctgatggttatgtagat
agagcttttacagatctaaaatcgtactatttacaaggtagttattcagatgataacact
cttataaaagccataacttttggtggtgaagaaagaacttaccaatcttggtttggttta
gatgctacccagttagcacaagatagaagacaaaacccatatacctatgaaaatgaagta
gatgattatgggcaaaaccattatcaattgcattggaatgagcagttaaatgaaaaatgg
agtactactttaggtttgaattatactaaaggatctggattttttgagcaatacaaacca
ggagaatctgctgcagattttaataatttaattgcagatggcagtgatgttattgtaaga
cgttggttagataatgatttttacgtagctaactttaatacaaattacaaaaccgaaaaa
ttaaatttaattacaggaatctcttactcaaattatactggagatcattttggtgaagtt
atttgggggtctgatttagcgccaaatacagaaattagagatcgttactatttttctgat
gctacaaaaaatgacttttcactttttgcaaaagctaatttttacatctcagaaaaatta
tctggttatgcagatttacaagggcgttttgtgtcttatcaaactcaaggtttaacttca
gacagagctcctatagatgtagatgctaatttcgatttctttaatccaaaatttggttta
acttataatgtaaatgcaaacaacaatttatatgcttcgtttgctgttgcaaatagagaa
cctaatagaaacgattttgagaatggagtttctacaccagaaactttgaacgatttagaa
gtaggttggcgtttaaataatggtaaagttaaattaaatactaacgtttattatatggat
tataagaatcagttagttttaacaggtgccttagatgatgtaggagctcctgtaagagaa
acatctggtagcagttatagattaggtttagaaatagatgctgatattcgattttctgat
aaattttcttggaaaccaaatgccgcttttagcaccaacaaaaacagagacttttttatt
acaagagatgggaatacaactcctgaattattagggaatacagatatttcgttctcacca
aatgtaattgtaggtaatatgtttatctataacccaacagataatttacagttaacatta
ttatcaaaatatgttggtgaacagtttttaagcaacttaagtagcgcaatttctacaaac
gatgttttagaaagctactttacaagcgatataaatattgtgtacacaattacaccaaat
aaaatcttcgattcaattacattaacagcattaattaataatatttttgatactgaatat
gtagatagaggttattattttacttatgatgatgatttttctgtacctggtacagttact
actgttgatggtgcagggtactacccacaagcaactagaaactttttaattggggcaacc
ttaagattttaa

DBGET integrated database retrieval system