KEGG   Polaribacter sp. MED152: MED152_11514
Entry
MED152_11514      CDS       T02533                                 
Name
(GenBank) ABC transporter, ATP-binding and permease protein
  KO
K18890  ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
pom  Polaribacter sp. MED152
Pathway
pom02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pom00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    MED152_11514
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pom02000]
    MED152_11514
Transporters [BR:pom02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    MED152_11514
SSDB
Motif
Pfam: ABC_membrane ABC_tran SMC_N AAA_21 RsgA_GTPase AAA_22 AAA_29 AAA_30 AAA_16 AAA_23 DEAD MMR_HSR1 DUF5906 FtsK_SpoIIIE DUF87 Zeta_toxin
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ40659
UniProt: A2U3X0
LinkDB
Position
2566039..2567805
AA seq 588 aa
MADNSGNAFDMKIFKRLMSFAKRYKLYFFIASSSTILLALFSVLSPYILINTVDDYILTK
DKEGLLNYTMLMLGVLLIEVLLQFTFIYFANWVGQHIIRDIRAKIFRHILQFKMSYFDKN
SVGKLVTRVVSDIETIAAFFSNGVFTILSDILKMFAVTVIMLILNWKLALITLLILPILI
YATKLFQVAIKVTFQEVRNQVANLNGFVQERVTGMKIVQLFNREKIEYQNFKEINQKHKK
AYIKAIWYYSVFFPIAEILSSIGIGLIVWFGGGQAIQDTGITVGMIMGFIQFAQMLFRPL
RQIADKFNQLQMGIVAGERVFKVIDTESTIDKNGTVVAENLEGTISFDKVRFSYIENEEV
LKGISLEVKSGQTIAIVGATGAGKSTIINLINRFYEIDSGTISVDGVSVADYDLESLRDQ
VAIVLQDVFLFSDSILNNITLKNKSITEEEVEEAAKQIGIHDFIKSLPGGYHYNVKERGA
MLSSGQRQLIAFLRAYVSKPSILILDEATSSVDSHSEQMIQYATETITKGRTSIVIAHRL
ATIKQADKIIVMDKGLIVEEGSHSELLQKQDGYYKNLYDKQFSLDKAS
NT seq 1767 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggcagataattcaggtaatgcttttgatatgaaaatttttaaaagactaatgtctttt
gcaaaacgttacaagttatatttttttattgcttcatcttcaaccatattattagcctta
ttttcagttttatcaccttatattttaatcaatactgtagatgattatatcctaactaaa
gataaagaaggtttattgaattataccatgcttatgcttggtgttttactaatagaggta
ttgttacagttcacttttatttactttgcaaactgggttggtcagcatattattagagat
attagagctaaaatatttagacatattttacagtttaaaatgtcttatttcgataaaaat
tcggtgggaaaactggttactagagtagtatcagacatagaaacaatagctgcttttttt
agcaatggagtgtttacaattttaagtgatattctaaaaatgtttgcagtaactgtaatc
atgttaattctaaactggaaactggctttaattactttattaatcttgccaattttaatt
tatgctactaaattatttcaagtggctattaaagtaactttccaagaagtaagaaatcaa
gtagcaaatttaaatggttttgtgcaagagcgagttacaggaatgaaaattgtacagcta
tttaatagagaaaaaatagaatatcaaaactttaaagaaatcaatcagaagcataaaaaa
gcttatataaaagccatttggtattattctgtgttttttcctattgccgaaattttatca
tcaataggtattggtttaattgtttggtttggtggtggtcaggctatacaagatactggc
ataactgtaggtatgataatgggtttcatacaatttgctcaaatgttgtttagaccttta
cgtcaaattgcagataagtttaaccaattgcaaatgggtattgttgctggtgaaagagtt
tttaaagtaatagatactgagagcactattgataaaaacggaacagtcgtcgcagaaaat
ttagaaggtactatttcttttgataaagttagattcagttatattgaaaatgaagaagtt
ttaaaaggcatttctttagaggttaaaagtggtcaaactattgccatagttggtgcaaca
ggagcaggtaagtctacaattatcaacctaatcaatcgtttttatgaaatagattctggt
acaatttcggttgatggtgtatctgtggctgattacgatttagagagtttaagagatcaa
gttgcaattgttttacaagatgtgtttctgttttcggattcaatcttaaataacatcaca
ctaaaaaataaaagtataacagaagaagaggtagaagaagctgccaagcaaataggaatt
catgattttataaaatcgcttcctggtggttatcattacaatgttaaagaaagaggagcc
atgttatcttctggtcaaagacaattaattgcgtttttgagagcatatgttagtaaacct
agcattttaattttagatgaagcaacttcttctgtagattctcattcagaacaaatgatt
caatatgctacagaaacaattactaaaggtcgtacttctattgtaattgctcatagattg
gcaactattaagcaagctgataaaattattgtaatggataaaggtttaattgtggaagaa
ggttcgcattctgaattattacagaaacaagatggatattataagaacttatatgataaa
caatttagtttagataaagcttcatag

DBGET integrated database retrieval system