Polaribacter sp. MED152: MED152_12119
Help
Entry
MED152_12119 CDS
T02533
Symbol
secD
Name
(GenBank) protein-export membrane protein SecD
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
pom
Polaribacter sp. MED152
Pathway
pom02024
Quorum sensing
pom03060
Protein export
pom03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pom00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
MED152_12119 (secD)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
MED152_12119 (secD)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
MED152_12119 (secD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pom02044
]
MED152_12119 (secD)
Secretion system [BR:
pom02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
MED152_12119 (secD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
ACR_tran
bPH_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAQ40780
UniProt:
A2U3J8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2676991..2679963)
Genome browser
AA seq
990 aa
AA seq
DB search
MQNKGLIKLFAILFGLVSLYQLSFTFLANKVEDDAVEYSNERGANSDARAKAKFERTYLD
SVASKEIIDLGIAQYTYNDVKDKEMNLGLDLKGGINAILQVSVKEVLKSLSNDSKNVAFN
TALENADERQKESNLNYLDLFFEEFQKVAGDTKLSDPSIFGTKALSEKISFDEANITVRE
TLQEEINSSIGTAFEVLRSRIDKFGVTQPNIQRIGNSGRIQIELPGAKDIERVTKLITSK
AELQFWGVYTNAEIQNFFFAANSKVAEMLKDDSVLEQEQDSAKQDDIDDLLGEEADSTKV
QKSLFTYLYPNVAQSQQQLSSVVASARVLDTAMVNDLLSKKEVRALLPNEIKYAKFLWDY
KAVEGADGAEIISLYAIKGNRNDKPTIEGDVILDAAQVFDQLNKPEVSMTMNSSGTKQWA
KMTADNVGNFVAVVLDDYVYTAPSVNQVISGGRTSISGGSMTVAEAEDISTVLKAGKLPA
TARIIQIEVVGPSLGQEAIDASFLSFGLAIILVLLWMILYYGKAGAFANVALIVNILFIF
GVLASFNAVLTLPGIAGIILTIGMSVDANVIIFERIKEGLFKKKGLKQSVEEGFSIKGAL
SAIIDANITTLLTGIILYVFGTGPIKGFALTLMIGIATSLFTAVFITRLLIDSSVNKGSN
LTFNTSFSKGWFQNINVEFLKKRKIAYIISGTIIIGGLISIFSIGLKQGVDFKGGRSYVV
RFDQDMNATEVAGTLKDAFGSAPEVKTYGQANQLKITTVYKIEEEGTEVDEEVQNTLFTG
LKPYLGDTTYENFKPGFEKQGAGVMSFMKVEPTIADDIKTSALYAVFGSLIVVFLYILLR
FRKVSFSLGAVIAVFHDVLIVLGVFSITYSFMPFDMEIGQSFIAAILTVVGYSLNDTVVI
FDRIREFAGSYPNWKYSKVVDSALSSTLGRTINTSLTTLLVMLAIFLFGGDSIKGFMFAL
IVGVVVGTYSSLFVATPIMYDSSKKELKKK
NT seq
2973 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaacaaaggattaataaaattattcgctattctttttggattggtgagtttatac
caattatcattcacttttttagcaaataaagtagaagatgatgctgttgagtactcaaat
gaaagaggtgcaaatagtgatgctagagcaaaagctaaattcgaaagaacgtatttagat
agtgtagcaagtaaagaaattatagatttaggtatagcacaatacacctataatgatgta
aaagacaaggaaatgaatcttggtcttgacttaaaaggaggtattaatgcaattttacaa
gtatctgtaaaagaagttttaaaaagcttatctaacgattctaaaaacgtggcttttaat
actgctttagaaaatgcagatgaaagacaaaaagaaagtaacttaaattatttagactta
ttttttgaagaatttcaaaaagtagctggtgatactaaattgagtgatccttcaattttt
ggtacaaaagcgttaagtgaaaaaatctcttttgatgaagctaacattacagtaagagaa
actttacaagaagaaattaatagttctattggtactgcttttgaagttttaagaagtaga
attgataaatttggtgttacacaaccaaacattcaaagaattggtaattctggtagaatt
caaattgaattaccaggagctaaagatatagagcgtgttacaaagttaattaccagtaaa
gctgagttacaattttggggtgtttacacaaatgcagaaattcagaactttttcttcgct
gcaaactctaaagtagcagaaatgttaaaagatgattctgttttagagcaagaacaagac
tctgcaaaacaagatgatattgatgatttattaggtgaagaagcagattctactaaagtt
cagaaaagcttatttacttacttatatccaaacgttgcgcaatctcaacaacaattaagt
tcggttgtagcaagtgctagagttttagatactgcaatggttaatgatttactttctaag
aaagaagtaagagcattattaccaaatgaaattaaatatgctaaatttttatgggattat
aaagctgtagaaggtgctgatggtgcagaaattattagtttatatgccattaaagggaac
agaaatgacaaacctactattgaaggtgatgttattttagatgctgctcaagtttttgac
caactaaacaagcctgaagtttctatgacaatgaatagttcaggaacaaaacaatgggct
aaaatgactgctgataacgtaggtaattttgttgctgtagttttagatgattatgtatat
acagctccttctgtaaaccaggtaattagtggtggtagaacttctatttctggtggaagt
atgacagttgctgaagcagaagatatttctacagtattaaaagcgggtaaattaccagca
actgcaagaataattcaaattgaagtagttgggccatctttaggacaagaagcaattgat
gcaagtttcctatcatttggtttagcaattattttagttttattatggatgattttatat
tatggtaaagcaggtgcatttgctaatgttgcattaatagtaaatattttattcatcttt
ggtgtattagcttcgtttaatgcagtgttaactttacctggtattgctggtattatctta
acaataggtatgtctgtagatgccaacgtaattatttttgaaagaattaaagaaggccta
ttcaagaaaaaaggtttaaaacaatctgtagaagaaggtttctctattaaaggagcttta
tctgcaattatagatgcaaacattacaacattattaacaggtataattctttatgttttt
ggtacaggaccaattaaaggttttgccttaaccttaatgattggtattgcaacttcatta
tttacggccgtatttattacgcgtttattaattgatagttcagtaaataaaggatctaac
cttacctttaacacctctttttctaaaggatggttccaaaacattaatgtagaattctta
aagaaacgtaagattgcttacattatttctggtacaattattattggtggtttaatttct
atattctctattggtttaaaacaaggtgtagattttaaaggaggaagatcttatgttgta
cgttttgatcaagatatgaatgctacagaagtagcaggtactttaaaagatgcctttggt
tctgctcctgaggtaaaaacttacggacaagcaaatcaattaaaaattacaactgtttac
aagattgaagaagaaggtacagaagtagatgaagaagtacaaaatactttatttacaggt
ttaaaaccttatttaggtgatactacttacgaaaactttaagcctggttttgaaaagcaa
ggtgcaggtgttatgagttttatgaaagtagaacctacaattgctgatgatattaaaaca
tctgctttatatgcagtatttggttcattaattgtagttttcttatacatcttactacgt
tttagaaaagtatcgttctcattaggtgcagtaattgctgtttttcatgatgtattaatt
gtattaggtgtattctctattacttacagttttatgcctttcgatatggaaataggccaa
tcatttatagcagctatacttacagtggtaggttactccttaaatgatacagtggttatc
ttcgatagaattagagagtttgctggttcttatccaaattggaaatacagtaaagttgta
gattctgccttaagttcaaccttgggtagaacaataaacacatctttaacaacattatta
gtaatgttagctatcttcttatttggtggagattctattaaaggatttatgtttgcttta
attgtgggtgttgtagtaggtacatactcatcattatttgtggcaacaccaattatgtat
gattcttctaagaaagagttaaagaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system