Pontimicrobium sp. SW4: ABGB03_02200
Help
Entry
ABGB03_02200 CDS
T11291
Name
(GenBank) UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase
Organism
pons Pontimicrobium sp. SW4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mur_ligase_M
Mur_ligase_C
Mur_ligase
YqeC
DUF3440
CbiA
SRP54
IstB_IS21
KTI12
LpxK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBG61723
UniProt:
A0AAU7BUE7
LinkDB
All DBs
Position
471289..472752
Genome browser
AA seq
487 aa
AA seq
DB search
MIELKNILYKVTLDAVVGDTSVSINEIQFDSRKVSKNDAFVAIKGTLVDGHDFIEQVIEK
GVNTIICEQIPDITIEGVTYVKVDNTSKALAIMASNYYGVPSENLRLIGVTGTNGKTTIA
SLLYQLFKKAGYKVGLLSTVKVLVDEKEYHATHTTPDSLTINKYLSEMNDEGVEFCFMEV
SSHGIHQSRTEGLCFEGGIFTNLTHDHLDYHETFAEYRDVKKSFFDNLPKSAFSLVNVDD
KNGSVMLQNTASKKYTYALKSYADYRAQILENQLNGLFLKINDNEIWTKLIGNFNAYNLL
AIYGTADLLGLESVEVLRLMSELDSVSGRFQYLISDEKITAIVDYAHTPDALKNVLETIN
SIRTKNENLITVVGCGGDRDKTKRPKMAHIASALSDKVIFTSDNPRTENPEEIIKDMEVG
VQPQNFKKTMSIVDRNQAIKTACQLANTNDIILIAGKGHETYQEINGVRTNFDDYKIVEE
LLKQLQK
NT seq
1464 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgatagaattaaaaaacatattgtataaagttactctcgatgctgttgtgggtgacaca
agtgtgtctattaatgagattcaatttgattctagaaaagtatctaaaaatgatgcattt
gtagcgataaaaggaactttggtagatggtcacgattttattgaacaagtcatagagaaa
ggagtaaatactattatttgcgaacagattcctgatattactatagaaggtgtaacctat
gttaaggtagataatacatctaaagcattggcaataatggcgtccaattattatggagtg
ccttcagaaaatttaagattaattggtgttactggaaccaatggtaaaacaactattgcg
tctttattgtatcagctttttaagaaagctggttataaggttggattgttatcgacagtt
aaagttttagttgacgaaaaagaatatcatgcaacacataccactccagattcattaact
ataaataagtatttaagtgaaatgaatgatgagggtgttgaattttgcttcatggaagta
agttctcatgggatacatcaatcacgtaccgaagggctttgttttgaaggcggaattttc
acaaatcttacgcacgatcatttagattatcatgaaacattcgcggaatatcgagatgtg
aaaaaatcattcttcgataatcttccaaaatctgcattttcattagtgaatgttgatgat
aagaacggttcggtaatgctacaaaatacagcttccaaaaagtatacttatgctttaaaa
agctatgctgattatagagcgcaaatattggagaaccaattgaatggcttgtttttaaaa
attaacgataatgagatttggactaaattaatagggaactttaacgcttataatttatta
gccatttatgggactgcagatttattgggtttagagagtgttgaggtattacgtttaatg
agtgaattggatagtgttagtggaagatttcaatatttaatttctgatgaaaaaatcact
gctattgtagattatgcgcatacaccagatgctttaaaaaatgtgctagagactattaat
agtattcgcactaaaaacgaaaaccttattactgtagttggttgtggaggagacagagat
aagaccaagcgcccaaaaatggcacatatagcatcggctttaagtgataaagtcattttt
acaagcgataacccacgaactgaaaatcctgaagaaattattaaagacatggaagttggt
gttcaacctcaaaacttcaaaaaaacaatgtcgatagtagatagaaatcaagccattaaa
acagcttgccaactagctaatacaaatgatattattctaatagcgggtaaaggacatgag
acgtatcaagaaataaatggtgtaagaaccaattttgatgattataaaatagtagaagaa
cttttaaaacaattgcaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system