Pontimicrobium sp. SW4: ABGB03_08765
Help
Entry
ABGB03_08765 CDS
T11291
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
Organism
pons Pontimicrobium sp. SW4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PcrA_UvrD_tudor
Viral_helicase1
AAA_30
ResIII
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBG59953
UniProt:
A0AAU7BPE8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1871186..1873519)
Genome browser
AA seq
777 aa
AA seq
DB search
METYLSQLNEAQLAPTLQKDGPMIVIAGAGSGKTRVLTYRIAYLMSQGVDAFNILALTFT
NKAAKEMKGRIAEIVGDGEAKNLWMGTFHSVFAKILRFEGHHLGFPSNFTIYDTQDSQKL
LGSIIKEMGLEKDIYKTKQVYSRISSYKNSLITVKAYFKNPELMEADAATRRPKMGEIYA
EYVDRCFKAGAMDFDDLLLRTNELLTRFPNVLAQYQDKFRYILVDEYQDTNHSQYLIVRA
LADRFQNICVVGDDAQSIYAFRGANINNILNFQKDYDDVKLYRLEQNYRSTKNIVGAANS
VIEHNKTKLDKVVWTSNEEGNKVKVHRSLTDGDEGRYVASTIWEEKMNNQLHNNDFAVLY
RTNAQSRAIEDALRKRDIPYRIYGGLSFYQRKEIKDVTAYLRLVLNPADEEALKRVINFP
ARGIGQTTIDRLVVAANNYKKTIFEVLKNLDTIDISINSGTKNKLKDFVTLIESFQVMNQ
TANAFDLAEHVTKTSGLIREFNKDGTPEGITRLENVQELLNGIKDFVEGQMELADAGDSL
AEFLEDVALATDLDGDKGDPNHVALMTIHLAKGLEFNHVFIVGLEEDLFPSAMSMNTRSE
LEEERRLFYVALTRAEKQAYLTYALSRYRWGKLIDSEPSRFIEEIEDEFLDIIIPIEERR
INPMLSADIFGDVEPNKIRFKPPKKYEPKRKSNIKPKPEGIKINTPKNFKKITSSNENTN
LFDSKLVVGNIVKHLRFGKGEVLKIEGVGSDMKAEINFQNGGIKKLLLRFAKLDIIG
NT seq
2334 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggagacgtatttaagtcaattaaatgaagcgcaattagcaccaactttacaaaaggat
ggtcctatgattgtgattgctggagctggttctggaaaaacaagagtacttacttaccgg
attgcttatctaatgagtcaaggtgttgatgcgtttaatattttggcgttgacttttacc
aataaggcagctaaagaaatgaaaggcagaatcgctgagatagttggtgatggtgaagct
aaaaacctatggatgggaacgtttcactctgtttttgctaaaattttacgttttgaaggg
catcatttagggtttcctagtaatttcactatatacgatacacaagattctcaaaaattg
ttgggctcaataattaaagaaatgggcttagagaaagatatctataaaaccaagcaggtt
tatagcaggatatcttcttataaaaacagcttaataacggttaaagcatattttaaaaac
ccagagctcatggaagctgatgctgcgacaagacgtccaaaaatgggagagatttatgca
gaatatgttgaccgttgttttaaagctggcgccatggattttgatgatttgttgctaaga
actaacgagttgctaacccgctttcctaatgttttagcacagtatcaagataagttccgt
tatattcttgtcgatgagtaccaagatacaaaccactcgcaatatttaatagttcgtgct
ttggcagatcgttttcaaaatatatgtgtggttggtgatgacgcccaaagtatttatgcg
tttcgtggcgctaatattaataatattttgaattttcaaaaggattatgatgatgtgaaa
ctctaccgcctagagcaaaactatcgctcgaccaaaaacattgtaggcgcagcaaactca
gtgattgaacataataaaaccaagttagataaggtagtttggacttctaatgaagaaggt
aataaagttaaagtacatcgttcgttaaccgatggagatgaaggccgttatgtagcaagt
accatttgggaagaaaaaatgaataaccaattgcataataacgattttgcagtgctttat
cgaacaaatgcacaatcacgtgctattgaagatgctttgcgaaaacgagacatcccttat
cgtatttatggaggcttatcattttaccagcgtaaagaaattaaagacgttactgcatat
ttgcgtttggttttaaatcctgcagatgaagaagcactaaaacgtgttattaatttccca
gcacgtggtattgggcaaactactattgatagactagttgttgctgcaaataattataag
aaaaccatttttgaagttttaaagaatcttgatacgatagatattagtattaatagcgga
acaaaaaataaactaaaagattttgtgacgcttattgaaagttttcaagtaatgaatcaa
acggcaaatgcttttgatttagctgaacacgtaactaaaacaagcggattaatacgagaa
tttaacaaagacggtactcccgagggcattacgcgattggaaaatgtacaagagctttta
aatggtatcaaagattttgttgaagggcaaatggagctagctgatgctggagattcttta
gcagaatttttggaagatgtggcattagcaacagatttagatggtgacaaaggagatcca
aatcacgtagctttaatgactattcatttggcaaagggattggaatttaatcatgtgttt
attgttggtttagaggaagatttgtttccaagtgctatgagcatgaatacacgtagcgaa
ttagaagaggagcgacgtttgttttatgtggctttaactagagccgaaaaacaagcctat
ttaacctatgcattgtcacgttaccgttggggaaaattaattgactcagagcctagtaga
tttattgaagaaattgaagatgaatttttagatattattattcctattgaagaacgacgc
atcaacccaatgttgtcagcagatatatttggagatgttgagcctaataaaattaggttt
aagccaccaaaaaagtatgagcctaaaagaaaaagtaatataaaaccaaaacctgagggg
attaaaataaatacacctaagaactttaaaaaaataacgagctctaatgaaaacactaat
ttgtttgacagcaaattagtagtagggaatatagtaaaacatttacgatttggaaaaggt
gaagtccttaaaatagaaggtgtaggttcggatatgaaagcagaaataaacttccaaaat
ggagggataaaaaaattactacttcgctttgctaaattagatattattggatag
DBGET
integrated database retrieval system
