Pontimicrobium sp. SW4: ABGB03_08790
Help
Entry
ABGB03_08790 CDS
T11291
Name
(GenBank) DUF559 domain-containing protein
Organism
pons Pontimicrobium sp. SW4
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF559
RecG_dom3_C
Helicase_C
DEAD
RecG_wedge
tRNA_anti-codon
ResIII
MTES_1575
Cas3-like_C_2
DUF2726
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBG59958
UniProt:
A0AAU7BPA3
LinkDB
All DBs
Position
1877337..1879874
Genome browser
AA seq
845 aa
AA seq
DB search
MNTNIQTPIDYLKGVGPNRADLLRKELGIHTYQDLVNLFPNRYIDRTQYYKINQLQQNSA
EVQIIGQITSLKEIAQKRGKRLVGNFTDDTGSMELVWFRGHKWIRESIKLNTTYVVFGKI
NWFNGKFSMPHPEMELLEDHEKNLSSAMQAVYPSTEKLSNKGITNRVIIKIMQQLFLETK
GKFTETLSENLIKEQKLLSKSKALFNVHFPESQKLLAHAQFRLKFEELFYIQLQLILKNL
IHKSKIKGFPFTKVGDYFNTFFKEHLPFKLTNAQKRVIKEIRQDLGSNAQMNRLLQGDVG
SGKTIVALMSMFIAIDNGFQACLMAPTEILSVQHYNSLNSYCKNLNIRIKLLTGSTKTLE
RKKIHESLKNGDLNILIGTHALLEDKVEFKNLGLAIIDEQHRFGVAQRSKLWKKGPPLSS
QREDAKTVLDRYKTARPSTYKLMKDLQQENKKNSTEAEGILWECLRAKKIDYKFRRQHII
DEFIVDFVNIEKKLVVEIDGGYHNAQQQKQIDEIRTLILKELGFNVICFTNEQVIGDTEN
VLIKIENQLKSLPSREVGEASLPPHILVMTATPIPRTLAMSVYGDLDISVIDELPPGRKD
IKTVHRFDKNRLQVFGFIRDEIKKGRQVYIVYPLIQESSAMDYKDLMDGYESISRDFPLP
EYQISIVHGKMKAADKDYEMQRFAKGETQIMVATTVIEVGVNVPNASVMVIESAERFGLS
QLHQLRGRVGRGAEQSYCILMTGYKLSNDSRTRLETMVRTNDGFEIAEVDLKLRGPGDLM
GTQQSGVLNLKIADIIKDKNILQQARFYAKRILSSDPTLSNPENKEILHTYKQLSKFKNI
WNYIS
NT seq
2538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacaaacatccaaacaccaatagattatttaaaaggcgttggtcctaatcgtgca
gatttactgcgtaaggagcttggtattcatacatatcaagatttagttaacctatttcca
aacagatatattgatagaacacagtattacaaaatcaatcagctacaacaaaactcagcc
gaagttcaaataataggtcaaattacaagtcttaaagaaatagcacaaaaacgcggaaaa
cgcctcgtaggaaactttacagacgatacaggcagcatggaattggtttggtttagaggt
cacaaatggattcgagagagcattaaactaaacacgacatatgtggtttttgggaagatt
aactggtttaatggaaaattcagcatgcctcatcctgaaatggaacttttagaagatcat
gaaaaaaacttaagctcagcaatgcaagctgtatacccttctactgaaaaattatccaat
aagggaattaccaatcgcgtaattataaaaataatgcagcaattgtttttggagaccaaa
ggaaaattcacagaaacattatcagaaaacttaattaaagaacaaaaattattatcaaaa
tcgaaagcgctttttaatgtgcactttccagaatctcaaaagctattagcacatgcacaa
tttcgattaaaatttgaagaattgttttacattcaattacaattaattttaaaaaacctc
atccataaatcaaaaataaaagggtttccatttacaaaagtcggtgactattttaacact
ttttttaaagagcatttacccttcaaattaaccaacgctcaaaagcgagttattaaagaa
attcggcaagatttaggaagcaacgcacaaatgaaccggttactacaaggtgatgtgggt
tctggaaaaacaatagtagcactaatgtcaatgttcatagctattgacaacggttttcaa
gcatgtttaatggctcctactgaaattttgtcagtacaacactataacagtttaaattca
tattgtaaaaatctgaatatcagaataaaactattaactggttcaactaaaactttagaa
agaaaaaaaatccatgaatctttaaaaaatggcgatttaaacatcttaattggcactcat
gcgctccttgaagataaggtggaattcaagaatttaggcctcgcaattattgatgaacaa
catcgttttggagtagcacaaagaagtaaactttggaagaaaggccctcctctttcctcc
cagagggaggacgcaaaaactgtactcgatagatataaaactgcacgaccatcaacttat
aaactgatgaaagatttacaacaggaaaacaaaaaaaacagtactgaagctgaaggtatt
ttatgggagtgtttgagggcaaaaaaaatcgattataaatttagacgacaacatattatt
gatgagtttattgttgattttgttaatatcgaaaaaaaattagtggttgaaatagatggt
ggttaccataacgctcaacaacaaaaacagatagatgaaataaggacactcattttaaaa
gagctgggttttaatgttatctgttttaccaatgagcaggttattggagatacagaaaat
gtacttataaaaattgagaatcaattaaaaagcctcccctctagggaggttggtgaggct
tcccttcctccacacatcttagtaatgactgctacaccaattccgagaaccttagcaatg
tctgtttatggcgacttagacatatccgtaattgacgaattaccaccaggcagaaaagac
ataaaaactgtccatagatttgataaaaatcgcttacaagtttttggatttattcgagat
gaaataaaaaaagggaggcaagtatatattgtctatccattaattcaagaaagttctgct
atggattataaagatttaatggatggctacgaaagtatatcgagagatttccctttacct
gaatatcaaatttcaattgttcatggaaaaatgaaagctgccgataaggattacgaaatg
caacgttttgcaaaaggcgaaacacaaattatggttgctaccacagttattgaagttggg
gtaaatgtacctaacgcatcggttatggttattgaaagtgccgaacgctttggtttatcg
caattacatcaattacgtggtcgcgttggtcgtggtgccgaacaaagctattgcatatta
atgactggctataaattgagtaacgacagtcgaacacgactagaaaccatggtaagaacc
aacgatggttttgaaattgccgaagtcgatttaaaacttcgtggccctggggatcttatg
ggaacacaacaaagcggtgtattgaaccttaaaatagccgatattataaaagataaaaat
attttacaacaagcacgtttttatgcaaagcgtattttaagtagtgatccaacattatca
aatccagaaaataaggagatattacacacatacaaacagctaagtaaattcaagaatatt
tggaactatattagttaa
DBGET
integrated database retrieval system