Populus trichocarpa (black cottonwood): 18095136
Help
Entry
18095136 CDS
T01077
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
Pathway
pop03015
mRNA surveillance pathway
pop03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
18095136
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
18095136
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pop03041
]
18095136
Spliceosome [BR:
pop03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
18095136
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18095136
NCBI-ProteinID:
XP_024438452
LinkDB
All DBs
Position
1:29505356..29510429
Genome browser
AA seq
449 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQDGDSGPPSYGGGGGYGGYGGDGGGRGGYGGRGGGGGGGRGGGGGYGGPSQSRG
GGYQGGDRGGRGGGGRGGGRGGSGREGDWPCPKPGCGNLNFARRVACNKCGTPAPAAGQN
DRSDGDGGYRGGSGGGYGGNRGGRGGDSYDGNRSSNYNDGSRGGGYDNRSGNRGGSYSGN
QGRDDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGNYPPAPNSYGGNANYGMEAVPPPTSYTGGPTSYPPS
YGGPASGYGGDATGEVRSGGRGGQPGGYEGGRGGGGSRNQGGSGYGAAPADAPAKIKQCD
DNCGDTCDNARIYISNLPPDVTIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEN
GNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDFRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGGYGG
GGRRRDNYRDGGNSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtatggtcaagacggtgattctggtcctccgtcttacggcggcggaggt
ggatatggaggttacggaggcgatggtggcggacgtggtggatatggtggtcgaggtggt
ggtggaggcgggggaagaggcggaggaggaggatatggtggtccttcgcaaagtcgagga
ggtggataccaaggaggagatcggggaggcagaggaggcggcggaagaggtggtggccga
ggtggaagcggcagggaaggtgattggccttgccctaaaccaggttgtgggaatttgaac
tttgcaagaagagttgcttgtaataaatgcggtactcctgctcctgctgctggccaaaat
gatcgcagtgatggtgatggtggttatagaggaggaagtggtggaggatatggtggtaat
agaggaggaagaggtggtgatagttatgatggtaatagaagtagtaattataacgatgga
agcagaggaggtggttatgataatagaagtgggaatagaggtgggtcttacagtggtaat
caaggaagagatgatagtggatacaatcaagctccaccaccatctctcccttcatatggt
ggtggtggaggtaattatccaccggctccgaactcatatggtgggaatgctaactacgga
atggaagcagttcctccacctacaagctatactggtggacccacatcataccctccatct
tatggtggtcctgctagtggttatgggggtgatgctacaggtgaggtgaggagtggtgga
cgaggtggtcaacctggtgggtatgaaggtggacgtggtggtggtggttctcgaaatcag
ggaggtagtggttatggggctgctcctgctgatgccccggctaaaattaagcagtgcgat
gataattgtggcgatacttgtgacaatgcaagaatatatatatctaatttgccacctgat
gtgaccattgaagaactgagagaactttttggcggcattggacaagttggaaggattaag
cagaagcggggctataaagatcaatggccctggaatataaagatatacactgatgagaat
ggaaacaacaaaggtgatgcctgtttggcatatgaagacccatctgctgctcactctgct
ggcggtttttacaacaattatgatttcaggggctataaaatcaatgttgcaatggcagaa
aagtcagctccgaggcaacctgcacatgaccatggtggtggtagaggtggctatggtggt
ggaggtcgacgcagggataattaccgagatggtgggaattctggtccagacaggcatcaa
catggtggaaatcgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
