Populus trichocarpa (black cottonwood): 18102461
Help
Entry
18102461 CDS
T01077
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
Pathway
pop03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
18102461
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
18102461
Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
18102461
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18102461
NCBI-ProteinID:
XP_006378320
UniProt:
U5G3V3
LinkDB
All DBs
Position
10:9532722..9564789
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLRDYFGQYGDVLQAVVMKDKTTGRPRGFGFVVFADPAVL
DMVLQDKHTIDGRMVEAKRALSREEQQTNARAGNLNPARNTSGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAFGFVADVVIMYDQSTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLQRSFHDLNGKQV
EVKRALPKEANPGGGGRSMGGSYQNYGASGGNTSSYDGRMERYMQPQGTGGGFPPYGSSG
YSTAGYGYGPATNGVGYGGYSGYTGAGAGYGGPAGAAYGNPNVPNAGYVSGAPGAPRSSW
NSQGSSGYGAMGYGNAGSWGAQNAGAGSGGPGSVPAGQSPGGAAGYGNQGYGYSSYGGND
GSYGNPAGYGAVGGRSGGTPNSNVGGPGGAELQGSGGGYMGSGYGDANGNSGYGNAAWRS
EQSQASGNYGAPQANGPHGGQVGYGGGYGSSQARKAQQQ
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggagggatttcgtgggagacatcagaggag
aagctcagagactactttgggcaatacggggacgttttgcaggctgtcgttatgaaagat
aagactactggtagacctagaggctttggctttgtcgtctttgcagatcctgccgtgctt
gatatggttcttcaagataagcacaccattgatggtagaatggttgaggcaaagagggcc
ttatcaagagaggagcagcaaaccaatgccagggccggaaacctgaatcctgctagaaac
accagcggtggtggaaatattcggaccaagaagatatttgttggaggattgcctcccact
ctaactgaagatggatttcgtcagtattttgaagcctttggctttgttgctgatgtagta
ataatgtatgaccagagcacccagcgacctcgtggatttggctttatttcttttgacact
gaagatgcagttgaccgggtgttacagagatcgttccatgatttgaacggtaagcaagtt
gaagtgaaacgggctcttcctaaagaggccaatcctggtgggggtggccgctccatgggt
ggcagttaccagaactatggtgcatctggtggcaacacaagctcatatgatggtagaatg
gagaggtatatgcagcctcaaggtactggaggtggttttcctccttatggctcatctggc
tatagcacagctggatatggatatggtcctgccactaatggtgttggttatggtggttat
agcggctatactggagctggagctggttatgggggacctgcaggtgcagcttatgggaat
cctaatgttccaaatgctggctatgtaagtggtgcacctggtgcacccagaagttcatgg
aacagtcaaggttcatctggctatggtgctatgggttatgggaatgctggttcttggggc
gctcaaaatgctggggctggcagtggtggccctggttcagtacctgctggtcaatctcct
ggtggagccgctgggtatgggaatcaaggttatgggtacagtagttacggtggaaatgat
ggatcatatgggaatccagctgggtatggtgctgttggaggacgttctgggggcactcca
aacagtaatgttggtggtcctggtggagcagaactacaggggagtggcggtggctacatg
gggagtggatatggtgatgcaaatggaaattctgggtatggaaatgcagcgtggagatct
gagcaatcacaagcttctggaaattatggggctcctcaagcaaatggtcctcatggtgga
caggttggatatggtggtggttatggtagttctcaggctcgaaaagcccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
