Populus trichocarpa (black cottonwood): 4929737 Help Entry 4929737           CDS       T01077                                  Symbol ndhF, Poptr_cp077 Name (RefSeq) NADH dehydrogenase subunit 5   KO K05577   NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5 [EC:7.1.1.2] Organism pop  Populus trichocarpa (black cottonwood) Pathway pop00190   Oxidative phosphorylation pop01100   Metabolic pathways Module pop_M00145   NAD(P)H:quinone oxidoreductase, chloroplasts and cyanobacteria Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pop00001]  09100 Metabolism   09102 Energy metabolism    00190 Oxidative phosphorylation     4929737 (ndhF) Enzymes [BR:pop01000]  7. Translocases   7.1  Catalysing the translocation of protons    7.1.1  Linked to oxidoreductase reactions     7.1.1.2  NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)      4929737 (ndhF) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Proton_antipo_C Proton_antipo_M Proton_antipo_N Motif Other DBs NCBI-GeneID:  4929737 NCBI-ProteinID:  YP_001109555 UniProt:  A4GYW4 LinkDB All DBs Position Pltd:complement(112891..115173) Genome browser AA seq 760 aa AA seqDB search MEHTYQYLWIISFVTLPVPMLIGMGLLLFPVSTKKLHRIWAFPSVLLLSIVMVFSIDLFI QQINSSSIYQYVWSWTINNDFSLEFGYLIDPLTSILLILITTVGILVLVYSDSYMSHDQG YLRFFVYMSFFNTSMLGLVTSSNLIQIYIFWELVGMCSYLLIGFWFTRPIVSNACQKAFV TNRVGDFGLLLGILGLYWITGSFEFQDLFEIFNNLIYNNDNEVHFLFVTLCAFLLFSGAI AKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFVVIPYIMKLIALIG IITVLLGATLAFAQKDIKRGLAYSTMSQLGYTMLALGMGSYRAALFHLITHAYSKALLFL GSGSIIHSMEVIVGYSPDKSQNMVLMGGLTKHVPITKIAFLLGTLSLCGIPPLACFWSKD EILNDSWSYSPIFAIIAFSTAGLTAFYMFRVYLLTFEGHLNIYFQNYSGKKNSAFYSISL WGKQGSKILKKKMRLLPLLTINNKNNNERASFFCFFWKKIYQTGGTVRKMTCPFITINHF GTKRIFSYPQESDNTILFPMLVLVLFTLFIGAIGIPFNQFNQEEMNFDILSKLLIPSLSL LHQNQNKSVDWYEFVTNSTFSVSIASFGIFIASSLYKPIYSSLQNLKFLNLVAKKGPKRI LRDKIINVIYDWSYNRGYIDVFYAISLTEGIRRLAELTSFFDRRVIDGITNGVGFTSFFA GEGIKYVGGGRISFYLLLYLFYVLIFLLISSSIFSSFSSL NT seq 2283 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggaacatacatatcaatatttatggattatatctttcgttacacttccagtccctatg ttaataggaatgggactgctactttttccggtgtcaacaaaaaaacttcaccgtatatgg gcttttcccagtgttttattgttaagtatagttatggttttttcgatcgatctgtttatt cagcaaataaatagcagttccatttatcaatatgtatggtcttggaccatcaacaatgat ttttccttagagttcgggtacttgattgacccacttacttctattttgttaatattaatt actacggttggaattttggttcttgtttatagtgacagttatatgtctcatgatcaaggc tatttgagattttttgtttatatgagttttttcaatacttcaatgctgggattagttacc agttcgaatttaatccaaatttatatcttttgggaattggttggaatgtgctcttaccta ttaataggtttttggttcacacgacctattgtgtccaatgcttgtcaaaaagcattcgta actaatcgtgtaggcgattttggtttattattaggaattttaggtctttattggataaca ggcagtttcgaatttcaggatttgtttgaaatattcaataacttgatttataataatgat aatgaggttcattttttatttgttaccttgtgcgctttcctattattttccggtgcaatt gctaaatcggcgcaattcccccttcatgtgtggttaccggatgccatggaaggacctacc cctatttcggctctaatacatgctgctaccatggtagcagcgggaatttttcttgtagct cgacttcttcctcttttcgtagttataccttacataatgaagctaatagctttgataggt ataataacagtactattaggagccactttagcttttgctcaaaaagatattaagagaggt ttagcttattctacaatgtctcaattgggttatacgatgttagctttaggtatgggctcc tatcgagccgctttatttcatttgattactcatgcttattcgaaagcattgttgttttta ggatctggatccattattcattcaatggaagttattgttggctattctccggataagagt caaaatatggttcttatgggtggtttaacaaaacatgttccaattacaaaaattgctttt ttattaggaaccctttctctttgtggtattccacctctcgcctgtttttggtccaaagat gaaattcttaatgatagttggtcgtattcacctattttcgcaataatagctttttccaca gcaggattaactgcattttatatgtttcgggtttatttacttacttttgaagggcattta aatatttattttcaaaattatagtggtaaaaaaaacagcgcattctattcaatatcttta tggggtaaacagggatcaaaaatcttaaaaaaaaaaatgcgtttattacctttattaaca ataaataataaaaataataatgaaagagcttcttttttttgttttttttggaagaaaata tatcaaactggtggtactgtaagaaagatgacgtgtccttttattactattaatcatttt ggtactaaaagaattttttcctatccccaggaatcggataatactatattatttccgatg cttgttttggtactatttaccttgtttattggagctataggaatacctttcaatcaattc aatcaagaagaaatgaattttgatatattatccaaactgttaattccgtctttaagtctt ttacatcaaaatcaaaataagtctgtagattggtatgaatttgtaacaaattcaactttt tcagtcagtatagcttcttttgggatatttatagcgtcttctttatataagccgatttat tcatccttacaaaatttgaaattccttaatttggttgctaaaaaaggtcctaagagaatt cttagggacaaaataataaatgtgatatatgattggtcctataatcgtggttacatagat gttttttatgcaatatctttaacagaaggcataagaagattggcagaattaacttctttt tttgatagacgagtaattgatggaattaccaatggagttggttttacgagtttctttgca ggagaaggcataaaatatgtaggaggtggtcgcatctctttttatctcttattatattta ttttatgtattaatctttttattaatttcttcatccattttttcttctttttcttctttg tga

DBGET integrated database retrieval system