Populus trichocarpa (black cottonwood): 7461497
Help
Entry
7461497 CDS
T01077
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
Pathway
pop03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
7461497
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
7461497
Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
7461497
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7461497
NCBI-ProteinID:
XP_024451623
LinkDB
All DBs
Position
2:24690430..24692824
Genome browser
AA seq
417 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFVGGIAWDTTEDTLRDHFNQYGEVSQVVIMRDKTTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DPVLHDKHTIDGRTVEAKRALSREEQHTSSRTGSFNGGRGSGGAGDFRTKKIFVGGLPST
VTEDGFRQYFQSYGHVNDVVVMYDQQTQRPRGFGFITFDSEDAVDNVLQKTFHELNGKLV
EVKRALPKDANPGSEGRGSGYRSYGSAGANVNAADGRMDGNRYMQPQTSVGGYPPYSGYA
AHGYGYGAANSGVGYYGSYGVSGYGGGNGGYGTGVYGMSAAVKNSWGSQAPSSYGASGYG
ANAGYGAAFPWSASGSGGSASAPMGQYPTGASGYGNQGYGYGNYGGSDGPYSGGYGATGG
RAGNAPNGSASNGAGGGEQQGSGSYYGDSNGNSGYANEAWRSDPSQASGGYGGAHSR
NT seq
1254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggacgaaggaaagctgttcgtaggaggaatagcatgggacacaaccgaagac
acgctaagagaccacttcaaccagtacggtgaggtctctcaggttgtcataatgcgtgac
aagaccactggtcgtcctcgtggctttggttttgtcgttttctccgatccctctgttcta
gatcctgttcttcacgataaacacaccatcgatggccgtactgtggaggcgaaaagggct
ttatcgagagaagaacagcatacatcatctagaaccgggagttttaatggtggtagaggc
tctggtggtgcaggggattttaggacgaaaaagatttttgttggtggcttgccttccacc
gtgacagaagatggattccgtcagtattttcaaagttatggtcatgtaaatgatgttgta
gtaatgtatgaccagcagactcaaaggcctcgtggatttggatttatcaccttcgattct
gaagatgcagttgataatgtactccagaagacctttcatgagttgaatggtaaacttgta
gaggtaaaacgagcactcccaaaagatgcaaatccaggtagtgaggggcgtggtagtggc
tatcgtagttatggctccgctggagccaatgtaaatgcagctgatggtcgaatggatgga
aaccggtatatgcagccccaaacttctgtaggtggttacccaccttattctggatatgct
gctcatggttatggttacggagcagcaaacagtggagttggttattatggcagttatggt
gttagtggttatggtggtggaaatggcggatatggtacgggagtgtatggcatgtctgct
gctgtaaaaaatagttggggcagccaagctccttcgagttatggtgcttccggctatggt
gcaaatgcaggctatggggctgcatttccctggagtgcttctggtagcggtggttctgct
tctgctcctatgggtcaatatccaactggagcgtctgggtatggaaatcaaggctatggt
tatggtaattatggtggaagtgatggtccttattctggtggctatggagctactggaggg
cgtgctgggaatgctccaaatggcagtgccagcaatggagctggtgggggagagcaacag
gggagtgggagctactatggtgacagtaatgggaattcaggatatgcaaatgaagcctgg
aggtctgatccttcgcaagcctctggtggttacggtggtgctcattcaagatag
DBGET
integrated database retrieval system
