KEGG   Populus trichocarpa (black cottonwood): 7487409
Entry
7487409           CDS       T01077                                 
Name
(RefSeq) nicastrin isoform X1
  KO
K06171  nicastrin
Organism
pop  Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Motif
Pfam: Nicastrin Ncstrn_small Peptidase_M28
Other DBs
NCBI-GeneID: 7487409
NCBI-ProteinID: XP_002305230
LinkDB
Position
4:complement(6845363..6855755)
AA seq 670 aa
MATDLPCLLPFLLFLFISHFPLSFSGSVNSMESVPDLTKSMYVDFDGYPCVRLLNLTGEI
GCSNPGRDKVVAPVVRYKNVNEVSKPSAVLVSLDEFLELIGRISNDSSFAKNIGGVLVEQ
GMDSQIKLKGFSPDQKFPGAEYAPYKSINYEWNPIGSGMMWKAYSFPVFLLTEGGAQLVQ
EVAMNNEKKRNDYTADVVEFDSVMQTTKSGTHDSESCLQEQTCFPLGGYSVWSSLPPINN
SSTNHSKPIILTVASMDSASFFRDKNLGAESPISGLIALLAAVDSLSHVNGLDDLGKQLV
FSVFTGEAWGYLGSRRFLFELDLQSEAVNGLNSSLIETVIEIGSVGKGFSQGNSTFFAHT
AAVSLATNETLNALKHARDSLENITVSSASTLNPGIPPSSLMAFLKKNPSTSGMVLEDFD
TSFSDKFYHSHLDDMSNINSSAIVAAASLVARTLYILASDDKNLSSTALDAINVNASLVE
ELMSCLLDCEPGLSCELVKSYIVPTNQCPNHYVGVILGEPSSNPYLGYVDDVSRFMWNFL
ADRTSSSMEDASSDCSKECSNKGGVCIKAEVDGKGVCAISTTRYVPAYSTRLNYESGTWR
VLPSDSSDPMGMVDPVWTESNWDTIMLRVYTVQDAAFDRLVLLAGITITVMAYLAIVLTR
AYIAKALKRD
NT seq 2013 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggccacagaccttccttgtcttcttccatttcttctttttctcttcatttctcacttt
cccctctctttctctggttcagtaaattcaatggagtcagttcctgatctaacaaagtca
atgtatgtggattttgatggatacccttgtgttagattactcaatcttaccggagaaatt
ggctgttcaaatcccggacgagataaggtggttgctccggttgtaagatacaagaatgtt
aatgaagttagtaagccttctgcagttttggtgtccttagatgagtttcttgaacttatt
ggcagaatatcaaatgattcaagttttgccaagaacattggtggtgttttagttgaacaa
gggatggactcacaaatcaaattaaaaggattttctccagaccaaaagttcccaggagct
gaatatgcaccttacaaaagcatcaactatgaatggaacccaattggatctggtatgatg
tggaaagcttacagttttcctgtattcttactcactgagggtggtgcacagttggtgcag
gaggttgccatgaacaatgagaagaaaaggaatgattataccgcagatgtggttgagttt
gattcagtgatgcagacaacaaaatctggtacccatgattcagaatcctgtttacaagaa
cagacttgctttccattaggtggatacagtgtttggtcgtcgcttcctccaattaataat
tcatccacaaatcactccaagccaattatattaactgtcgcatctatggattctgcttca
tttttccgtgataaaaatttaggtgccgaatcccctatttctggactgatagcattgctg
gcagctgttgattcactttctcatgtaaatggtctggatgaccttggtaaacagcttgtc
ttttcagttttcacaggggaggcatggggttaccttggtagcaggagatttttgtttgaa
ctagatttacaatcagaggctgttaatgggctcaacagtagtctgattgaaacggtcata
gaaattggatctgttggaaagggcttcagtcaagggaatagcacattttttgctcacaca
gctgcggtttcactggccaccaatgaaacattgaatgccttaaaacatgctcgagattca
cttgaaaacattacagtttcatcagcaagcactttaaatccagggatacccccatcatcc
ttgatggcatttcttaaaaagaacccttcaacttctgggatggtattggaagattttgat
acttctttctctgataagttttaccacagtcacttggatgatatgtcaaatataaattct
tcagccatagtggcagctgcttctcttgttgcccgcacactttatatccttgcaagtgat
gacaaaaatttaagcagcacagctcttgatgccatcaatgtcaatgcctctctagttgaa
gaactgatgagttgcctattggactgtgaaccaggattgtcttgtgagttggtgaaaagt
tatatagtaccaaccaatcaatgcccaaaccactatgttggagttatccttggggaacct
tcgtcaaatccctatcttggatatgttgatgatgtttccaggtttatgtggaattttcta
gctgatagaacttctagttcgatggaggatgcgagctctgattgttcaaaagagtgcagc
aacaaaggtggtgtgtgcattaaggcagaggtagatgggaagggagtctgtgctatttct
acaaccaggtatgtaccagcgtattcaacacgcttgaactatgaatctggaacttggcgt
gtgttgccttcagattcttctgatcccatgggaatggtggatcctgtctggacggagagc
aactgggacacaatcatgcttcgggtctacactgtgcaggatgcagcttttgatcgttta
gttttgctggcaggtattaccatcacagtcatggcttaccttgcaattgtgcttacaaga
gcctatatagcgaaggccttgaagcgggattga

DBGET integrated database retrieval system