KEGG   Populus trichocarpa (black cottonwood): 7487970
Entry
7487970           CDS       T01077                                 
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1
  KO
K17943  pumilio RNA-binding family
Organism
pop  Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Motif
Pfam: NABP PUF PUF_NOP9
Other DBs
NCBI-GeneID: 7487970
NCBI-ProteinID: XP_002311179
UniProt: B9HMK2
LinkDB
Position
8:3470002..3477700
AA seq 999 aa
MITDTYSKVLPDISKRSMLKNEDLSKLIREQRLQQEATSEIEKELNIYRSGSAPPTVEGS
LSSIGGLFDGTGIPGIKNSNRGGFSSEEVLRSDPAYVNYYYSNVNLNPRLPPPSLSKEDW
RFAQRLHGSGGGSNSVVGDRRRGSRGGENEGHRSLFAVQPGFGGGMEENGNENGVEWGGD
GLIGLPGLGLGSRQKSIAEIIQNDMGHANPISRHPSRPASRNAFDDDMETSEAQFSQLHG
DLASLDALRSSSNKQGMSAVQNIGASASHTYASALGATLSRSTTPDPQLVARAPSPRIPP
IGGGRTNSMDKRDVSGSHSFNGISTSFNDSELVAALSGLKMSTNGLVDEENHSQSRSQHE
IDDRHNLFNLQGDQNYVKQQSYLNKSSASSNLKLPSTLTLSGRGGSPSNHQNADNMNSPY
ANYGFSGYPVNPSSPSMIGSALANGSLPPLFGNAAAAAMAGSGLDSQALGAIGPNLMASA
AELQNLSRFGNQTAGVPLVDPLYLQYLRSDEYAAAQLATAQLAALNEPMLDREYVGNAYD
LLQKLQLETLLSSQNSQYGVPYLGKSGSLNHNYYGNTGFGLGMSYSGSPLGGPVLPNLLA
GSGGPVRHSERNMRFSPGMRNLSGGVMGSWHSEAGSNLDESFPSSLLDEFKSNKTKCFEL
SEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATAEENNMVFDEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFF
EHGSASQIRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTKMVTELNGHILRCVR
DQNGNHVIQKCIECVPEDAIQFIVSTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDTKTQRIM
MDEILQSVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKKLTGQIVQMSQQKFASNVIEKC
LTFGTPAERQALVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLGLILSRIKV
HLNALKKYTYGKHIVLRVEKLVAAGERRISFLTLNPATA
NT seq 3000 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcactgacacatattcaaaggttttgcctgatatctcaaagcgatcaatgctgaaa
aacgaggatttgagcaagctaattagagagcaaaggttgcaacaagaggcaacaagtgaa
atagagaaagaactcaatatttatcgaagtggttcagccccgcctacagtagaaggttct
ttaagttctattggaggcttatttgatggtacagggattcctggtatcaaaaatagcaat
agaggtggtttttcgagtgaagaggtcctaaggtctgacccagcttatgttaattattat
tattcgaatgtgaacttgaatccaagattgcctcctccatcattgtcaaaggaggattgg
agatttgcacagagattacatggaagtggcggtggttctaattctgtggttggggataga
aggaggggaagtagaggcggcgaaaatgaagggcataggtcactttttgcagtgcagcca
gggtttggaggaggaatggaggagaatgggaatgagaatggagtggagtggggaggagat
gggcttattgggttgccgggattggggctgggaagtaggcaaaagagcattgcagagatc
attcagaatgatatgggtcatgcaaacccgatctcaaggcacccttcacgtcctgctagc
cgcaatgcattcgatgatgatatggaaacttctgaagctcagtttagtcagctgcatggt
gatttggcatcccttgatgctctacgctccagttcaaacaaacagggcatgtctgcagtt
caaaacattggtgcatcagcttctcatacctacgcttctgctttaggtgccaccttgtct
cgaagcaccacacctgaccctcagcttgtagcgagggctcctagccctcgcattccaccc
attggaggaggtaggaccaattccatggataaaagagatgtgagtggttcacactcattt
aatggcatctcaacaagcttcaatgattctgagctcgtagctgcattgtctgggttgaag
atgtcaacaaatggtttagttgatgaagagaaccactcacagtcacgaagccaacatgaa
attgatgatcgccataacctgttcaatttgcaaggtgatcaaaactatgtcaagcaacaa
tcatatttaaacaagtcatctgctagctcaaaccttaaattaccctcaactctgactctg
agtggtcgaggaggctctccttctaatcaccagaatgcagataacatgaattccccatat
gctaactatggcttcagtgggtatcctgtgaatccttcatcgccgtccatgataggaagt
gctcttgcgaatgggagtctgccacctttgtttggaaatgctgctgctgctgcaatggct
ggaagtgggttggattctcaagcactaggtgcaatagggccgaacttaatggcttcagca
gcagaattgcaaaatcttagtagatttgggaatcaaactgcaggtgtgcctcttgtggac
ccattatatcttcagtacttgagatcagatgagtatgcagctgcccagcttgcaactgcc
cagcttgcagctctcaatgaacccatgctggacagggagtatgttggtaatgcatatgat
ctcctccaaaagcttcaattagagacattgctgtcctctcaaaattcacagtatggtgtt
ccataccttggcaaatctggtagcttgaaccataattactatggaaacacaggatttggt
cttggcatgtcctattctggaagcccattaggggggcccgttcttccaaatttgcttgct
ggatctggtggtcctgtgaggcacagtgaacggaatatgcgtttttctcctgggatgagg
aatctgtctgggggtgtcatgggatcatggcattcagaagctggtagtaacctggatgaa
agttttccttcctctttactggatgagttcaaaagcaataaaactaaatgttttgaactg
tcagaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgctgatcagtatgggagccgattcatt
caacagaagcttgagactgccacggcagaagagaataacatggtttttgatgaaattatg
ccccaagccctttcactaatgactgatgtttttggtaattatgtgattcagaagtttttt
gagcatggatctgcatcccaaataagagaactggctgatcagctaactggccatgtgctg
acccttagccttcaaatgtatggctgtcgtgttatccaaaaggctatagaagtggttgaa
ctggaccagcagactaaaatggtcacagagcttaatggtcatatcttgcgatgtgtacgt
gatcagaatggaaaccatgtcattcagaagtgtattgaatgtgtacctgaagatgccata
cagtttattgtttctacattttatgatcaagttgtgacgctgtccactcatccatatggg
tgccgtgtgatacagagagtgctggagcactgccatgacaccaaaacccagcgtataatg
atggatgagattttgcagtctgtttgcatgttggcacaagaccaatatggaaattatgtt
gtacagcatgtcctggagcatgggaaaccacatgagcgttcagcaataataaagaaatta
actgggcagatagttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgtaatagagaaatgc
ttaacttttggcactcctgcagaacgtcaggccctggtggatgagatgcttggcaccact
gatgagaatgagcctctacaggccatgatgaaagatcagtttgcaaattatgttgtacag
aaagtgctggaaacttgtgatgaccagcaacttggactcatactcagtcgaataaaagtt
cacttaaatgctctgaagaagtatacttatgggaaacatatagttctgcgtgtagagaaa
cttgttgcagctggagagaggagaattagcttccttactctgaatccagctactgcatag

DBGET integrated database retrieval system