Populus trichocarpa (black cottonwood): 7487970
Help
Entry
7487970 CDS
T01077
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7487970
NCBI-ProteinID:
XP_002311179
UniProt:
B9HMK2
LinkDB
All DBs
Position
8:3470002..3477700
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MITDTYSKVLPDISKRSMLKNEDLSKLIREQRLQQEATSEIEKELNIYRSGSAPPTVEGS
LSSIGGLFDGTGIPGIKNSNRGGFSSEEVLRSDPAYVNYYYSNVNLNPRLPPPSLSKEDW
RFAQRLHGSGGGSNSVVGDRRRGSRGGENEGHRSLFAVQPGFGGGMEENGNENGVEWGGD
GLIGLPGLGLGSRQKSIAEIIQNDMGHANPISRHPSRPASRNAFDDDMETSEAQFSQLHG
DLASLDALRSSSNKQGMSAVQNIGASASHTYASALGATLSRSTTPDPQLVARAPSPRIPP
IGGGRTNSMDKRDVSGSHSFNGISTSFNDSELVAALSGLKMSTNGLVDEENHSQSRSQHE
IDDRHNLFNLQGDQNYVKQQSYLNKSSASSNLKLPSTLTLSGRGGSPSNHQNADNMNSPY
ANYGFSGYPVNPSSPSMIGSALANGSLPPLFGNAAAAAMAGSGLDSQALGAIGPNLMASA
AELQNLSRFGNQTAGVPLVDPLYLQYLRSDEYAAAQLATAQLAALNEPMLDREYVGNAYD
LLQKLQLETLLSSQNSQYGVPYLGKSGSLNHNYYGNTGFGLGMSYSGSPLGGPVLPNLLA
GSGGPVRHSERNMRFSPGMRNLSGGVMGSWHSEAGSNLDESFPSSLLDEFKSNKTKCFEL
SEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATAEENNMVFDEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFF
EHGSASQIRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTKMVTELNGHILRCVR
DQNGNHVIQKCIECVPEDAIQFIVSTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDTKTQRIM
MDEILQSVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKKLTGQIVQMSQQKFASNVIEKC
LTFGTPAERQALVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLGLILSRIKV
HLNALKKYTYGKHIVLRVEKLVAAGERRISFLTLNPATA
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcactgacacatattcaaaggttttgcctgatatctcaaagcgatcaatgctgaaa
aacgaggatttgagcaagctaattagagagcaaaggttgcaacaagaggcaacaagtgaa
atagagaaagaactcaatatttatcgaagtggttcagccccgcctacagtagaaggttct
ttaagttctattggaggcttatttgatggtacagggattcctggtatcaaaaatagcaat
agaggtggtttttcgagtgaagaggtcctaaggtctgacccagcttatgttaattattat
tattcgaatgtgaacttgaatccaagattgcctcctccatcattgtcaaaggaggattgg
agatttgcacagagattacatggaagtggcggtggttctaattctgtggttggggataga
aggaggggaagtagaggcggcgaaaatgaagggcataggtcactttttgcagtgcagcca
gggtttggaggaggaatggaggagaatgggaatgagaatggagtggagtggggaggagat
gggcttattgggttgccgggattggggctgggaagtaggcaaaagagcattgcagagatc
attcagaatgatatgggtcatgcaaacccgatctcaaggcacccttcacgtcctgctagc
cgcaatgcattcgatgatgatatggaaacttctgaagctcagtttagtcagctgcatggt
gatttggcatcccttgatgctctacgctccagttcaaacaaacagggcatgtctgcagtt
caaaacattggtgcatcagcttctcatacctacgcttctgctttaggtgccaccttgtct
cgaagcaccacacctgaccctcagcttgtagcgagggctcctagccctcgcattccaccc
attggaggaggtaggaccaattccatggataaaagagatgtgagtggttcacactcattt
aatggcatctcaacaagcttcaatgattctgagctcgtagctgcattgtctgggttgaag
atgtcaacaaatggtttagttgatgaagagaaccactcacagtcacgaagccaacatgaa
attgatgatcgccataacctgttcaatttgcaaggtgatcaaaactatgtcaagcaacaa
tcatatttaaacaagtcatctgctagctcaaaccttaaattaccctcaactctgactctg
agtggtcgaggaggctctccttctaatcaccagaatgcagataacatgaattccccatat
gctaactatggcttcagtgggtatcctgtgaatccttcatcgccgtccatgataggaagt
gctcttgcgaatgggagtctgccacctttgtttggaaatgctgctgctgctgcaatggct
ggaagtgggttggattctcaagcactaggtgcaatagggccgaacttaatggcttcagca
gcagaattgcaaaatcttagtagatttgggaatcaaactgcaggtgtgcctcttgtggac
ccattatatcttcagtacttgagatcagatgagtatgcagctgcccagcttgcaactgcc
cagcttgcagctctcaatgaacccatgctggacagggagtatgttggtaatgcatatgat
ctcctccaaaagcttcaattagagacattgctgtcctctcaaaattcacagtatggtgtt
ccataccttggcaaatctggtagcttgaaccataattactatggaaacacaggatttggt
cttggcatgtcctattctggaagcccattaggggggcccgttcttccaaatttgcttgct
ggatctggtggtcctgtgaggcacagtgaacggaatatgcgtttttctcctgggatgagg
aatctgtctgggggtgtcatgggatcatggcattcagaagctggtagtaacctggatgaa
agttttccttcctctttactggatgagttcaaaagcaataaaactaaatgttttgaactg
tcagaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgctgatcagtatgggagccgattcatt
caacagaagcttgagactgccacggcagaagagaataacatggtttttgatgaaattatg
ccccaagccctttcactaatgactgatgtttttggtaattatgtgattcagaagtttttt
gagcatggatctgcatcccaaataagagaactggctgatcagctaactggccatgtgctg
acccttagccttcaaatgtatggctgtcgtgttatccaaaaggctatagaagtggttgaa
ctggaccagcagactaaaatggtcacagagcttaatggtcatatcttgcgatgtgtacgt
gatcagaatggaaaccatgtcattcagaagtgtattgaatgtgtacctgaagatgccata
cagtttattgtttctacattttatgatcaagttgtgacgctgtccactcatccatatggg
tgccgtgtgatacagagagtgctggagcactgccatgacaccaaaacccagcgtataatg
atggatgagattttgcagtctgtttgcatgttggcacaagaccaatatggaaattatgtt
gtacagcatgtcctggagcatgggaaaccacatgagcgttcagcaataataaagaaatta
actgggcagatagttcaaatgagccagcagaagtttgcctccaatgtaatagagaaatgc
ttaacttttggcactcctgcagaacgtcaggccctggtggatgagatgcttggcaccact
gatgagaatgagcctctacaggccatgatgaaagatcagtttgcaaattatgttgtacag
aaagtgctggaaacttgtgatgaccagcaacttggactcatactcagtcgaataaaagtt
cacttaaatgctctgaagaagtatacttatgggaaacatatagttctgcgtgtagagaaa
cttgttgcagctggagagaggagaattagcttccttactctgaatccagctactgcatag
DBGET
integrated database retrieval system