Entry |
|
Name |
(RefSeq) ABC transporter C family member 13 isoform X1
|
KO |
K05674 | ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 |
|
Organism |
pop Populus trichocarpa (black cottonwood)
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:pop00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
7493232
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:pop02000]
7493232
Transporters [BR:pop02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC1, 2, 3, 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13 subgroups
7493232
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
3:complement(18786866..18801771)
|
AA seq |
1449 aa
MEFKKSLYCPNSPFVWEGNTFSECFDNLVPGFGANVVTIVIILVLAITRSTASRVPRISC
TEKTVFRFLPFLGALVSFMDLILLVNKELHGNFIAYHEWLFRSSQLIVWTVIIISSMCAC
LHDVFCNRFLCFWWIMKSLLGILHLHRAFGSMEVVKCLKDSCVVLLDVMFGISINIIRIK
RASPKSSSMEDPLLSVDTDIEEGFHGDSGNAKSYWDHMTFRTITSVMNHGVIKQLGFDDL
LSLPNDMEPSTCHDKLSSCWRVQLSSPNPFFFKAIFCAYGWPYLCLGLLKVFNDFIGFAG
PLLLNKLIRFLQQDSMRWDGYLLALSLGLTSILKSFFDTQYSFHLGKLKLKLRSSIMTVI
YQKVLCVTQSERSKFSEGEIQTFMSIDADRTVNLCNSFHDMWSLPLQIGVALYLLYTQVK
FAFLSGLAITILLIPVNKWISELIASATEKMMKQKDERIRRTGEILTHIRTLKMYGWEHL
FSSWLMETRSSEVKHLATRKYLDAWCVFFWATTPTLFSVFTFGLFTLMGHQLDAATVFTC
LALFNNLISPLNSFPWVINGLIDAFISTRRLSRFLCCSEYKHVLKCKAECEDMAVIVDDA
SCTWSSSEEKQPNLVLNHVNLCLSKGSLVAIIGEVGSGKSSLLSAMLGEMTLIHGSVHSS
GSVAYVPQVPWIMSGTIRDNILFGKNYDSRRYSDTIRVCALDVDISLMAGGDMAHIGSKG
INLSGGQRARLALARAIYQGLDTYMLDDVLSAVDAQVARWILHNAILGPFMDQKTRILCT
HNVQAISSADMVVVMDKGQVTWVGSSVDLAVSSYPAFSPQNEFDALSDVQGKELSMADSI
QVSHSHLPERESNHVSEEVQEIVEAESRKEGRVELAVYKNYAAFSGWFITVVIFLSAILM
QASRNGNDLWLSFWVDTAGSSQIEYSISFYLVVLCIFCIINSALTLVRAFSFAFGGLRAA
VQVHNTLLNKLIDAPVQFFDQTPGGRILNRFSSDLYTIDDSLPFILNILLANFVGLLGIA
VILSYVQVFFLLLLLPFWFIYSKLQFFYRSTSRELRRLDSVSRSPIYATFTETLDGASTI
RAFKSEDFFMEKFIEHVTLYQRTSYSEIIASLWLSLRLQLLAAVIISFVAMMAVIGSHDY
LPISFGTPGLVGLALSYAAPIVSLLGSFLTSFTETEKEMVSVERALQYMDIPQEELRGSQ
SLNLDWPFQGTIEFQNVTMRYMPSLPPALRGISFTVPGGMKVGVVGRTGAGKSSILNALF
RLTPICSGCIVVDGLDITDVPVRDLRPRFAVVPQSPFLFEGSLRDNLDPFQMNNDLKIWD
ILEKCHVKEEVESAGGLDIHVKESGSSFSVGQRQLLCLARALLKLSKVLCLDECTANVDT
KTASILQSTIFSECRAMTVITIAHRISTVLNMDNILVLDRGNLVEQGNPKALLQDESSIF
SSFAKASTM |
NT seq |
4350 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggagttcaagaagtccctctattgccctaattctccctttgtatgggagggaaacaca
ttctcggagtgttttgataatttagttccaggattcggtgcgaacgtggtgaccattgtt
ataattttggtgcttgcaattactcgaagcactgccagtcgagttcccaggataagttgt
acagaaaagactgtttttcgttttcttcctttcctgggagcacttgtctcatttatggac
ttgattttgcttgtgaataaagaacttcatggaaactttattgcatatcatgagtggctt
ttcagaagttctcaattgatagtctggacagttatcataatatcatctatgtgtgcctgc
ttacatgatgttttttgcaaccggttcctatgtttctggtggatcatgaaatcactatta
ggaatccttcatctgcatagagcatttggttcaatggaggtcgtgaaatgccttaaagac
agttgtgttgttttgttagatgtcatgtttggcatatccatcaacattatcaggataaaa
cgggcatctcccaagagcagttcaatggaagatccacttctttctgtggacacagacatc
gaggagggttttcatggagactctggaaatgctaagagctattgggatcacatgacattc
agaactatcacttctgtgatgaatcatggagtcataaagcagcttggatttgatgattta
ctttcgctacctaatgacatggagccttctacctgtcatgataaattgtcaagctgctgg
agagttcagctgagcagtcctaaccctttcttctttaaagcaatcttttgtgcatatgga
tggccgtatctttgtcttggtctgcttaaggtgttcaatgactttattggttttgcggga
ccactgcttcttaataagctcattcggtttcttcagcaagattctatgcgatgggacggc
tatcttcttgcattatctttgggcctcacctctatcttaaaatccttttttgatacacaa
tactcgtttcatcttggaaaattgaagctaaagctacgatctagtatcatgacagtaatt
tatcagaaggtcctatgtgttacccaatcagagcgatcgaaattttctgagggggaaata
cagacatttatgtcaatagatgctgatcgaactgtcaacttgtgtaacagtttccatgat
atgtggagcttgcctttgcaaattggagtggcactgtatcttttgtatacacaagtcaag
tttgcctttctttctggactggccataaccatccttttgataccagtgaataaatggatt
tctgaattgattgcaagtgctactgagaaaatgatgaagcaaaaagatgagaggattaga
aggacaggagaaatcttgactcatattcgaactttaaagatgtatggctgggagcatctt
ttctctagctggctgatggagactagatcctcagaagtcaagcacttagctacacgaaaa
tatttggatgcctggtgtgtattcttttgggccacaacaccaactcttttctctgtattc
acttttggactttttactttgatggggcatcaacttgatgctgcaacggtcttcacttgt
ctggctctgtttaataatttgatctctcctcttaattcattcccatgggtcattaatgga
ttaattgatgcctttatatcaactagacggttgagcaggttcctctgctgttcagaatac
aaacatgtactcaaatgcaaagctgagtgtgaagatatggctgtcatagtggatgatgct
tcttgtacttggtcaagcagtgaagaaaagcaaccaaacctggtgttgaatcatgtgaat
ctgtgcctttcaaagggttcattggttgcgataattggagaggttggttcaggtaaatca
tccttgttaagtgcaatgctaggagaaatgacgctcatccatggatcagttcattcaagt
ggatctgtagcatatgtaccacaggttccgtggattatgtctggaacaatacgtgacaat
attttgtttgggaaaaattatgattcaagaagatattcagatacaatccgggtctgtgca
ttagatgttgatatttcactaatggctggaggtgacatggctcatattggatctaaagga
attaacttatctggtggacagagagctcgtcttgctttggcaagggccatttatcaaggg
ttggacacatatatgcttgatgatgtgctcagtgcagtcgatgcacaagttgctaggtgg
atcttacacaatgctattcttggtccttttatggaccaaaagactcgtattctttgcacc
cacaatgtacaggcaatttcttctgctgatatggttgttgtaatggataaaggacaagtg
acatgggttggaagttcagttgacttggcagtttcatcatatccagcattttctccccaa
aacgaatttgatgcactctctgatgttcaagggaaagaactgagcatggctgattctatt
caagtcagtcatagtcaccttcctgagagggagtctaatcatgtttcagaggaagtacaa
gagatcgttgaggctgagtcacggaaagagggcagagttgaacttgctgtatacaagaat
tatgcagcattttctggttggttcatcacagttgtaatatttctctcagctattctaatg
caagcttctcgtaatggaaatgatctgtggctgtcattttgggttgacacggcagggagc
agtcagatagagtactcaatttccttttacctggttgtactctgtatattttgcattata
aattctgctctaacattggtaagagcattctcctttgcgtttggtgggttacgtgctgca
gttcaggtgcataatacattgcttaataagcttattgatgcacccgtacaattctttgat
caaacaccaggtggaagaatacttaacaggttttcttcagatctctacacaatagatgat
tctcttcccttcatcctcaacattctccttgccaattttgttggcctgttgggaatagca
gtaattttgtcatatgtgcaggtcttcttcttgcttctgctattgccattttggtttatc
tacagcaagctacagttcttttacagatcaacatcaagggaactgcgaaggctggacagt
gtttcacgttctccaatatatgcaaccttcacagagacactcgatggagcatccaccatt
agggcattcaagtctgaggactttttcatggagaaatttattgagcatgtgactttgtat
cagcgaacatcttactcggagataatagcaagtttgtggctttccctgcgtctccagttg
ttagcagcagttatcatctcatttgttgccatgatggctgttattggatctcatgactat
ttaccaatcagctttggcacccccgggctggtaggtttggctctctcatatgcagctcca
atcgtgtctctattaggaagtttcttaacaagttttactgaaaccgagaaggaaatggta
tctgttgagagagctcttcagtatatggacattccccaagaagaactcaggggatctcag
tctctgaatctagactggccatttcaaggaacgattgagtttcagaatgttacgatgaga
tatatgccgtctttgccacctgcactacgtggaattagttttacagttcctggagggatg
aaggttggagttgttgggagaacaggtgctggcaaatctagtattttgaatgcccttttt
cgcctaactccaatatgcagtggttgtattgtcgtggatggccttgacataactgatgtt
cctgttagagatctccgtccacgctttgctgttgttcctcagagtccattcctatttgaa
gggtcattaagggataacctagatccattccagatgaataatgacttgaaaatctgggat
attctggagaaatgccatgtcaaagaggaagtagaatcagcaggcggactggatatccac
gtaaaggaatctggatcatccttttctgttgggcaaaggcagctcctttgccttgcacgc
gctcttcttaaattgtccaaggtactttgtttggatgagtgcacagccaatgttgacact
aaaacagcttcaatactacaaagtacaatattcagtgaatgcagggccatgacggtgatc
acgattgctcatcgcatttccacagttttgaatatggacaacatccttgttcttgaccga
ggaaacctggttgagcaaggtaacccaaaagctcttctacaagacgaatcctccatattt
tcaagttttgctaaagcttcaacaatgtag |