Populus trichocarpa (black cottonwood): 7494747
Help
Entry
7494747 CDS
T01077
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
Pathway
pop03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
7494747
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
7494747
Messenger RNA biogenesis [BR:
pop03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
7494747
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7494747
NCBI-ProteinID:
XP_024462733
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(11795206..11799196)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLGEYFTQYGDVLQTVVMKDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDTHTIDGRTVEAKRALSREEQQTNARAGNLNPARNTSSGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTDDGFRQYFEAFGLVTDVVIMYDQSTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQRTFHDLNGKQV
EVKRALPKEANPGGGGRSMGGSYQSYGASGGNTNSYDGRMDSSRYMQPQGTGGGFPPYGS
SGYNAAGYGYGPASNGVGYGGYSSYTGAGAGYGGPAGAVYGNPNVPNPGYASGPPGAPRS
SWNSQGSSGYGAMGYGSAASWGASNASAGSGPGSASAGQSPGGATGYGSQGYGYGSYGGN
DGSYVNPVGYGAVGGRSGGTSNSNAGGPGGAELQGSGGGYMGSGYGDANGNSGYGNASWR
SEQPQTSGNYGGPQANGPGGYGGGYGGSQARQAQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggagggatttcatgggagacgtcagaggag
aagctcggggaatattttacgcaatacggcgacgttttgcagactgtcgttatgaaagat
aagaccactggtaggcctagaggctttggctttgtcgtttttgcagacccttccgttctc
gatagggttcttcaagatacgcacactattgatggtagaacggttgaggcaaagagggca
ttatcaagagaggagcagcaaacgaatgccagggctggaaacttgaatcctgctagaaac
accagcagtggtggaaatattcggaccaaaaagatatttgttggaggattgcctcctact
ctaactgacgatgggtttcgccagtattttgaagcctttggccttgtaactgatgtagta
ataatgtacgaccagagcacccagcgacctcgtggatttggttttatttcctttgattct
gaagatgcagttgaccgggtgttacagagaacattccacgatttgaatggtaagcaagtt
gaagtaaaacgagctcttcctaaagaggccaatcctggtgggggtggccgctctatgggt
ggcagttaccagagctacggtgcatctggtggcaacacaaactcatatgatggtcgaatg
gattcaagtaggtacatgcagcctcaaggcactggaggtggttttcctccttatgggtca
tctggctataatgcagctggatatggatatggtcctgccagtaatggtgttggttatggt
ggctatagcagctatactggagctggtgctggttatgggggacctgcgggtgcggtctat
gggaatcctaatgttccaaatcctggctatgcaagcggtcctcctggggcacccagaagt
tcatggaacagtcaaggttcatctggctatggtgctatgggttatgggagtgctgcttct
tggggtgcttcaaatgctagtgctggcagtggtcctggttcagcgtctgctggtcaatct
cctggtggggccactgggtatgggagtcaaggttatgggtacggtagttatggtggaaat
gatggatcttatgtgaatccagttgggtatggtgctgttggaggacgttctgggggcact
tcaaacagtaatgctggtggtcctggcggggcagaactacagggtagcggcggcggctac
atggggagtggatatggtgatgcaaatggaaattctgggtatggaaatgcatcatggaga
tcagagcaaccacaaacttctggaaattatgggggtcctcaagcaaatggtcctggtggt
tatggtggcggttatggtggttctcaggcccgacaagcccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
