Onion yellows phytoplasma OY-M: PAM_413
Help
Entry
PAM_413 CDS
T00154
Symbol
uvrD
Name
(GenBank) ATP-dependent DNA helicase
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
poy
Onion yellows phytoplasma OY-M
Pathway
poy03420
Nucleotide excision repair
poy03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
poy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PAM_413 (uvrD)
03430 Mismatch repair
PAM_413 (uvrD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
poy03400
]
PAM_413 (uvrD)
Enzymes [BR:
poy01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
PAM_413 (uvrD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
poy03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
PAM_413 (uvrD)
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
PAM_413 (uvrD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD_C
UvrD_C_2
UvrD-helicase
REP_ORF2-G2P
Viral_helicase1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAD04498
UniProt:
Q6YQG0
LinkDB
All DBs
Position
complement(458850..461282)
Genome browser
AA seq
810 aa
AA seq
DB search
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QDIKILNKVECQYWYRYLENNYIQSLQLSP
NT seq
2433 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
