Pediococcus pentosaceus ATCC 25745: PEPE_1790
Help
Entry
PEPE_1790 CDS
T00409
Name
(GenBank) Signal transduction diguanylate cyclase
Organism
ppe
Pediococcus pentosaceus ATCC 25745
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABJ68811
UniProt:
Q03DB1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1766854..1768056)
Genome browser
AA seq
400 aa
AA seq
DB search
MENTVMNTIIYWAKGFFSFNTVVIAAITVGVLFMLAAGTYVVEMNMDKTKTSSTLIEELL
WGVGLTIAMVFLQNVFTHLYSTIASSELGWEYSTAQFVVLFYCLYIVHRKVVLWFNIILP
MYVYGLGIVRGQIGFDIAPILAILVIILISYTIYQQNDTLIDENVKYYSTLIMFGLAWWF
VLKDIHHLTIVDIICLTLEFLIAMSIVHFGNKKVRMIMKQYLNLMQEVDTDALTGVYNRN
SFNKVVKGVFEFYSNNDAPLTMVMFDIDHFKQFNDQYGHQVGDKVLRLVADRFSYELVDR
KAHGQLFRVGGEEFAIIFRGRTADDCEKIVRAIRDDLVKETIRVNNHDRIGIKVSIGISQ
LRDDDFDFQTFYKRVDDYLYQSKRNKRNSITVEGKVASLN
NT seq
1203 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatactgtaatgaatacaatcatatattgggcaaaaggtttttttagttttaat
acggtagttattgcggcaattacggtcggagtattattcatgttagctgcaggtacctac
gtagttgagatgaatatggataaaacaaaaacaagttcaacactcattgaagaactacta
tggggtgttggtctaacaatcgcgatggttttcttacaaaacgtgtttactcatttgtac
tcaacaattgctagtagtgagttaggttgggaatactcaactgctcagtttgtggtgcta
ttctactgcctatatattgttcatagaaaagtcgtactgtggtttaatattattttaccc
atgtatgtatacgggttagggatagtacgtggacaaattggatttgatattgctcctatt
ttagcaatcttggtaattatcttaatttcatacacaatctaccagcaaaatgacactttg
attgatgagaatgttaaatattacagtacgttaattatgtttggattagcttggtggttt
gtacttaaggatattcatcatctaactatcgtcgatattatatgcttgaccctggaattt
ttaatcgcaatgtcaatcgtccattttggtaacaaaaaagtcagaatgatcatgaagcag
tatttaaacttgatgcaggaagtagatactgatgcgttaacaggggtttataaccgtaat
agcttcaataaggttgtgaaaggcgtattcgaattttattctaataatgatgcaccatta
accatggtaatgtttgatattgatcattttaaacaatttaatgaccaatacggtcatcaa
gttggagataaagttttaaggttggttgcggatcgtttttcatatgaacttgtagatcgt
aaagctcatggtcaactattccgggttggcggggaagaattcgccattatttttcgaggc
cgtactgcggatgattgtgaaaaaattgtaagagccatccgcgatgatttggtaaaagaa
acaattagggttaataatcatgatcgaattggaattaaagtttcaatcggtatttctcaa
ttaagagatgatgattttgatttccaaacattctacaaacgtgtggatgattatttgtat
caatctaagagaaacaaacgtaatagtattacggttgagggaaaggtggcctcgctaaat
tga
DBGET
integrated database retrieval system
