Polaribacter pectinis: H9W90_00720
Help
Entry
H9W90_00720 CDS
T08187
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
ppec
Polaribacter pectinis
Pathway
ppec02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppec00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
H9W90_00720
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppec02000
]
H9W90_00720
Transporters [BR:
ppec02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
H9W90_00720
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
AAA_21
AAA_22
DEAD
AAA_30
AAA_29
AAA_23
MMR_HSR1
FtsK_SpoIIIE
AAA_16
DUF87
SbcC_Walker_B
AAA_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNM85680
UniProt:
A0A7G9LAN1
LinkDB
All DBs
Position
142399..144165
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MADKTGKAFDMQIFSRLMSFAKRYKLKFFIASASTILLAFSSMLTPYILSTTVDSYIVEK
DTDGLINCILLMLAVLMLEVILRFTFIFYANWVGQHIIRDIRAKIFRHILQFKMSYFDTN
SVGKLVTRVVSDIETIAAFFSNGVFTIVSDILQMFAVIVLMFFLNWKLAFIALAVLPILI
YATAVFKKAIKATFQEVRNQVANLNGFVQERVTGMKIVQLFNREKIEYVNFMEINNKHKK
AYIKTIWYFSIFFPIAEILSSIGIGLIVWFGSKQIISGEVPGPGTVIAFVQMAQMLFRPL
RQIADKFNQLQMGIVSGERVFKVIDTQSSIAKNGTIKAENLKGDINFKNVKFSYVKDEEV
LKGVSLEVKSGQTIAIVGATGAGKSTIINLINRFYEIDSGEICVDNISINDYTLESLRDQ
IAIVLQDVFLFSDSILNNITLKSTDISQKEVEEAAKQIGIHDFIMTLPGGYQYNVKERGA
MLSSGQRQLIAFLRAYVSKPSILILDEATSSVDANAEQMIQFATETITKGRTSIVIAHRL
ATIKNADKIIVMDKGLIVEEGTHQELLEKEDGYYKNLYDKQFSLDKAS
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcagataaaacaggaaaagctttcgatatgcaaattttttcaagacttatgagtttt
gcaaaacgctataagcttaaattttttatagcatctgcttctaccattttgttggcattt
tcatctatgttaacaccttatattttatctacaacagtagattcttacattgtagaaaaa
gatacagatggtttaattaattgtatactgcttatgctagcagtattaatgttagaagtt
atcttacgttttacattcattttttatgcaaattgggttggtcagcatattattagagat
attagagccaaaattttcagacacattcttcaatttaaaatgtcttattttgatactaat
tctgttggtaaattggtaacaagagtagtgtctgatatagaaaccattgctgcttttttt
agtaatggtgtctttacaattgttagtgatatcttacaaatgtttgctgtaattgtgtta
atgtttttcctaaattggaaattagcatttattgcattagcagtgttaccaattctaatt
tacgctacagcagtctttaaaaaagctattaaagctacgtttcaagaagttagaaatcaa
gtagctaatttaaacggttttgtacaggaaagagtaactggaatgaaaattgtgcaactt
tttaatagagaaaaaatcgagtatgttaattttatggaaattaataacaaacataaaaaa
gcatacataaaaacaatttggtatttctccattttctttccaattgcagaaatattatca
tctataggaattggtttaatagtttggtttggtagcaaacaaattatttctggcgaagtt
ccaggtccaggaaccgtaattgcttttgtacaaatggcgcaaatgttatttagaccttta
cgtcaaattgcagataaattcaatcaattacaaatgggaattgtatctggagaaagagtc
tttaaagtgatagacacacaaagttctattgccaaaaacggtacaataaaagcagaaaat
ttaaaaggagacattaattttaaaaatgtaaagtttagctacgttaaagatgaagaggtt
ttaaaaggagtttctttagaagtaaaaagcggtcaaactattgctattgttggtgcaaca
ggagcagggaaatctactattatcaatttaataaaccgtttttacgaaattgatagtggg
gaaatttgtgtagacaatatttctataaatgattatacattagaaagtttaagagatcaa
atagcaattgttttgcaagatgtatttttgttttcagattctattttaaataatattact
ttaaaatctacagatatttcacaaaaagaagtagaggaagctgcaaaacaaatcggtatt
cacgattttataatgacacttccaggcggttatcaatacaatgttaaagaacgtggagcc
atgttgtcttcaggccaaagacagcttatagcctttttaagagcatatgttagcaaacca
agtattttaattttagatgaagccacatcatctgtagatgcaaatgcagaacaaatgatt
cagtttgcaacagaaacaattacaaaaggtagaacttctatagtaattgctcatagattg
gcaactattaaaaatgctgataaaataattgtaatggataaaggtttaattgttgaagaa
ggaacgcatcaagaattattagaaaaagaagatgggtattataagaatttatacgacaaa
caatttagtttagacaaagcttcatag
DBGET
integrated database retrieval system