Polaribacter pectinis: H9W90_12110
Help
Entry
H9W90_12110 CDS
T08187
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ppec
Polaribacter pectinis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppec02000
]
H9W90_12110
Transporters [BR:
ppec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
H9W90_12110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
DUF7151
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNM84930
UniProt:
A0A7G9L8I1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2704554..2707328)
Genome browser
AA seq
924 aa
AA seq
DB search
MKQKYLLRLCTITFMFMLPLGLLAQTIKGKVTDSSGAGLPYMNIVEKGTSNGVVSDDNGE
FSITVKNLPTTLVVSSMGFKTKNVKVTQPSYLTISVSEDNALDEVVITGSRAPARSNTKS
PLPIDIVSAKDLVSTGQTTFDKALQFKIPSFNTVQTPVNDATSLLDPYEIRNMGPSRTLI
LINGKRKNLSALLYTQTSPGRGETGSDISGIPVDAIKSVEVLRDGASAQYGSDAIAGVIN
IILKDNKNGGSATLRTGMTSEGDGEMFGVSVNNGSAIGDDKGFINYTLDFSKTSLANRPG
TVNAEGEAADFGANIADVQEFLSRRPDAGNINGSPETAAAKFLVNGSYSLSDETNLYFNA
AFINKKVNSFANYRTPYWRTVGDFPYLADFFPGNHPTNAGGYDGYVPTFEGDLNDYNATI
GFKSVINDWNVDASFTTGGNSQTYKVNNSHNRNFVYSPSTWVDANNNGVIDQGEVSEGAQ
LYRENSKKSFDPGGTGFYHNVGNLDVSKILSDDLSIAFGTEFRYETFEVIEGELGSYDGG
GADSFAGNSPENSGEFTRYNFGGYASLNWSPTDNLTLDGTIRSENYSDFGNAFVWKVSSA
YTISDKYTLRGSLSTGFRAPTLHQIYTQKAQYSFVPGQGIQVGGLVNNVSSQAGLLGIPK
LKQETSTNFTLGLGGKVNRNLSFTVDYYSINVEDRIVLSTEITPPNLPAFAGLSDLSFFV
NALDTKTSGLDVVIGYNKIEAGSGTLGFNLSGNYTIKNERDGEVKNPASVAATGQSVVND
TQEALFFTSRPKTKWILGTTYDVGKFGLSLNNTYFGKTTFKQQGMSKDLRTEFTPKIVTD
LGINFNATEKLTLALNINNLLNVLPEWSFKAENAAGTAILANPAQVQNQSNLITFNQRYS
QMTYDGYHFSQLGTMFNLSLNYQF
NT seq
2775 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaagtatttattaagattatgtacaattacttttatgtttatgctgcctcta
gggttacttgcacaaacaattaaaggaaaagtaacagattcatcaggcgcaggattgcct
tatatgaatatagttgaaaaaggaacatctaatggtgtagtttccgacgataatggagaa
ttttctattacagttaaaaatttacctacaactctagtagtttcttctatgggttttaaa
actaaaaacgtaaaagtaactcaaccttcttatttaacaatttctgttagtgaagataat
gctttagacgaagtagttattacaggttctagagctccagcaagaagtaatactaaaagt
cctttaccaatagatattgtatctgcaaaagatttagtttctacaggtcaaacaactttt
gataaagctttacaatttaagattccttcatttaacacggttcaaacacctgtaaatgat
gcaacttctttattagatccgtatgaaattagaaatatggggccaagtagaacgttaatt
ttaatcaacggaaaacgtaaaaacttatctgcattattatacacgcaaacatctccaggt
agaggtgaaacagggtcagatatttctggaataccagtagatgctattaaatctgttgag
gttttaagagatggagcttctgcacagtatggctcagatgcaattgcaggcgtaataaac
attattttaaaagataataaaaacggaggttctgcaactttaagaacaggaatgacttct
gaaggtgatggagaaatgtttggtgtttctgttaacaatggttctgctattggagacgat
aaaggatttatcaattatacattagatttttctaaaactagtcttgcaaacagaccagga
acagtgaacgctgaaggagaagctgcagattttggagcaaatattgctgatgttcaagag
tttttatctagaagaccagatgctggtaacattaatggatcaccagaaacggctgctgct
aaatttttagtaaatggttcttacagcttaagtgatgaaacgaatctttattttaacgca
gcttttatcaataaaaaagtaaatagttttgcgaactatagaactccttactggagaact
gttggagattttccatatttagcagacttttttccaggaaaccatcctactaatgcaggt
ggttatgatggttatgtaccaacgttcgaaggagatttaaatgattacaatgctacaata
ggttttaaatctgttataaatgattggaatgtagatgctagttttacaactggtggaaac
tcacaaacttacaaagtaaataattctcacaatagaaactttgtatactctccttcaact
tgggtagatgcaaataataatggagttattgatcaaggagaagtttcagaaggtgctcaa
ttgtatagagaaaatagtaagaaatcttttgatccaggaggaacaggattttatcataat
gtaggaaatttagatgtttctaaaattctttcagatgatttaagtatcgcttttggtaca
gagtttagatatgaaacttttgaggttattgaaggtgaattaggttcttatgatggtggt
ggtgcagattcttttgcaggaaatagcccagaaaattcaggagaatttactcgttacaat
tttggtggttatgcttctttaaactggagtcctacagataacttaactttagacggaaca
attagatctgaaaactattctgatttcggtaacgcatttgtttggaaagtaagttctgct
tacacaatttcagataaatatactttaagaggttctttatctacagggtttagagcacca
acattacaccaaatttatacgcaaaaagcacaatatagttttgttcctggacaaggaata
caagttggtggtttggtaaataatgtgtcttctcaagcaggtttattaggtattccaaaa
ttaaagcaagaaacgtctactaactttacccttggtttaggtggtaaagtaaatagaaat
ttaagttttactgtagattactatagtataaatgttgaagatagaattgtattaagtaca
gagattactcctccgaatttaccagcttttgcaggtttatcagatttaagtttctttgta
aacgctttagatactaaaacatctggtttagatgttgtaattggttataataaaattgaa
gcaggtagtggaacattaggttttaatttatctggtaactatacaattaagaacgaaaga
gatggggaagttaaaaacccagcttctgttgctgcaactggtcaatctgttgtaaatgac
acacaagaagctttattctttacttctagaccaaaaacaaaatggattttaggaactact
tacgatgttggtaaattcggtctttctttaaataacacttattttggaaaaactacattt
aaacaacaaggtatgagtaaagatttaagaacagaatttactcctaaaattgttacagat
ttaggtattaactttaatgctacagaaaaattaacacttgcattaaacattaataactta
ttaaatgtattaccagaatggagctttaaagcagaaaatgcagcgggtacagctatatta
gcaaaccctgctcaagttcaaaaccaatctaatttaattacattcaatcaacgttattct
caaatgacgtatgatggttaccactttagtcaattaggaacgatgtttaatttatcttta
aactatcagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
