Polaribacter pectinis: H9W90_12115
Help
Entry
H9W90_12115 CDS
T08187
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ppec
Polaribacter pectinis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppec02000
]
H9W90_12115
Transporters [BR:
ppec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
H9W90_12115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
BioG
CooC_C
DUF4377
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNM84931
UniProt:
A0A7G9L8I2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2707484..2710420)
Genome browser
AA seq
978 aa
AA seq
DB search
MFQKLVFIKLIVLVLVIFTPKQIAAQEHKINTIPLATLLDKISAEHKIFFTYSANLLSNK
FIQDKGFVNLSLKKTISLLEKLTPFLYDDLGNNYYVIYPKKESKKKTIQSNKKAISSTFI
DVDSTSKETKIFVKGIVLSSDNEPLNGATLQEKGSSTGITTNTDGTFQFEIKKENLVTIS
FLGCNSKTIQLFPNKFNTITLLSGQELDEVKVVGSRNKNRVANDTPVAIDFIDIEKSATQ
SSQIEVNQFLQYVIPSFNSTKQSGADGADHIDPATIRGLGPDQTLVLINGKRRHQASLIN
LYGTRGRGNSGTDLNAIPISAIKRIELLRDGASAQYGSDAIAGVLNIVLKDTDDELNVSS
TFGFNNADSESVFPNKIDGFTYKLGLNYGVKINKGGFINFSIEALSSDNTLRNGTSAREK
YGQAAMKNVSLFFNSEVPVNRKIKLYANGGFNYKNPESFAFTRTPNSERNVLEIYPNGFN
PLITSNIIDNSLSIGMITEFKEWNVDINNTFGRNNFHYFIKNTLNATLEENSPTEFDAGG
HQLIQNTTSIDFSKYFIKETYGFNMALGLEYRLDKYKIFSGEEASYASYDINGDLADSKT
PNSDYKVHNGEIRPGGSQGFPGYSPINEVDRNRSNFGVYLDTEIDFSKKIMLGAAMRFEY
YSDFGSTLNYKLASRYKLTKKINLRSSYSTGFRAPSLAQGYYNLTFTNFIGSAPSESFLV
ANNSPIARRFNIDKLKEEKARNFSVGLTAKLSSTFNATIDSYYVSIKDRIILSGNFDASS
LGSGIDNVQFFANGVNTKTTGVDLVLNWRKKFNNGELSFDFSGNINHMKITDINNKLLDK
EAFFGEREQQFLLASAPKSKFNLGINYEYKKLKTSINFTRFSEIKLIDWQIGQDITNFNN
SEAERLSAATDIYQPKITTDLHLSYQFNKIINLQIGANNLFNIYPTKQNSFTDSGGLWDA
TQMGTNGSFYYTKLNFRL
NT seq
2937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcaaaaattagtattcataaaacttatagtacttgttcttgtcatttttacacct
aaacaaatagccgctcaagagcacaaaataaatacaatacctttagcaaccttattagac
aaaattagtgcagaacataaaatattctttacgtatagtgctaatttactttccaataaa
tttatacaggataaaggtttcgtaaatttatctttaaaaaaaacgatttctttattagaa
aaattaacaccttttttatatgacgatttaggaaataattactacgtaatttatcctaag
aaagaatcaaaaaagaaaacaattcaatcaaataaaaaagcaatttcttctacttttatt
gatgttgattctacttctaaagaaactaaaatttttgtaaaaggaattgttttaagttca
gataacgaacctcttaatggtgcaactttacaggagaaaggttcgtcaacaggaatcacc
acaaatacagatggaacttttcaatttgaaattaaaaaagagaatttagttactattagt
tttttaggatgtaattctaaaacgatacaactttttccaaataagtttaatacaattact
ttattatctggtcaagaattagatgaggtaaaggttgttggctctagaaataaaaataga
gtagctaatgatacaccagtagctatagattttatagatatagaaaaatcagcaacacaa
agtagtcaaattgaagtaaatcagtttttacagtatgtaattccttcatttaactcaaca
aaacaatctggtgcagatggcgcagatcatatagatcctgcaacaataagaggtttagga
ccagaccaaacattggttttaattaacggaaaaagaagacaccaagcatcattaataaat
ttatacggaacaagaggaaggggaaattctggtacagatttaaatgcaattcctatttct
gccattaaaagaatagaattattaagagatggcgcttctgcacaatatggttcagatgca
attgctggagtcttaaatattgtattaaaagatacggatgacgaattaaatgtaagttct
acttttggttttaataatgcagatagtgaaagtgtttttccaaataaaatagatggtttt
acttacaaattaggattaaattatggagttaaaataaacaaaggaggttttataaatttt
tctattgaagctttatcatctgacaatactttaagaaacggaactagcgctagagaaaaa
tatgggcaagctgccatgaaaaatgtgagtctattttttaattctgaagttcctgtaaat
agaaaaataaaactgtatgcaaatggaggttttaattataaaaatccagagtcttttgcg
tttactagaacaccaaatagcgaaagaaatgtccttgagatttaccctaatggatttaac
ccattaattacttcaaatattatagataactctctatctattggtatgattacagaattt
aaagaatggaatgtagatattaacaatacatttggtagaaataattttcattattttatt
aaaaatactttaaatgctacactagaagaaaattcacctacagagtttgatgctggtgga
catcaattaatacaaaacacaacaagtatcgatttttctaaatattttataaaggaaacg
tatggctttaatatggctttaggtttagaatatagattagataaatacaaaatattttct
ggtgaagaagcttcttatgcttcttatgatattaatggagatttggcagattcgaaaaca
ccaaattcagattataaagtgcataatggagaaattagacctggaggctcacaaggtttt
cctggatattctcccattaacgaagtagacagaaatagatctaattttggagtttattta
gatacagaaatagatttttcaaaaaaaataatgttaggtgctgcaatgcgttttgagtat
tatagcgattttggaagcacattaaattacaagctagcatctagatataaacttacaaaa
aaaatcaatttaagaagttcttacagtactggttttagagcgccgtcattggcacaaggt
tattataatttaacgtttacaaactttataggaagtgcgccttcagagtcttttttggtt
gcaaataatagtccaattgctagaagatttaatattgataaattaaaagaagaaaaagct
agaaactttagtgtaggattaacagcaaaattgagctcaacatttaatgcaacaatagat
tcgtattatgtttctattaaagatagaattattttaagcggaaattttgatgcttcaagt
ttaggctctggaatagataatgtacagttttttgcaaatggtgtaaataccaaaaccaca
ggtgtagatttggttttaaattggagaaaaaagtttaataatggtgagttgtcatttgat
ttttctggaaacatcaatcatatgaaaataacagatattaataataaattgttagataaa
gaagcttttttcggagagagagaacaacagtttttattagcatctgcaccaaaaagtaaa
tttaatttgggtattaattatgaatataaaaaactaaaaacgtccataaattttactaga
tttagtgaaattaaattaattgattggcaaattggtcaagacataactaatttcaataat
tctgaagcagaaagattatctgctgcaacagatatttatcaaccaaaaataactacagac
ttacatttaagctatcaattcaataaaattattaatttacaaataggtgccaataacttg
tttaacatctatccaacaaaacaaaatagttttactgatagtggtggtttgtgggatgct
acacaaatgggaacaaatggctcattttactacactaaattgaattttagactttaa
DBGET
integrated database retrieval system