KEGG   Pediococcus pentosaceus SL4: T256_05655
Entry
T256_05655        CDS       T02906                                 
Name
(GenBank) metallo-beta-lactamase
  KO
K02238  competence protein ComEC
Organism
ppen  Pediococcus pentosaceus SL4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppen00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:ppen02044]
    T256_05655
Secretion system [BR:ppen02044]
 Type II secretion system
  Competence-related DNA transformation transporter (DNA-T) core components
   T256_05655
SSDB
Motif
Pfam: Competence Lactamase_B DUF4131 gag_pre-integrs
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHA05245
LinkDB
Position
complement(1112352..1114457)
AA seq 701 aa
MISVCFFIHFSHKANSINTYNQSRSDIEIDLRVYPDEIKPMEDGVSIRAYTNNVNRKGLQ
VFIPVKTVDDLKKISKTQKVVEFKIKGNIEPLERPTNINQFDFRRIMYGKAVYFKVSKAS
LIEYNILTKNSLIAKIHSWRKKLLKRCTKLEEPLQSYCMGIILGEQTDYLKENSTKLRNM
GIIHLFCISGLHVFYFIKLIEIVFTRFKIKRETMEITQIGVLPLYFILGGGSTSLFRAVV
LVLVQLITKKIAIKVSTLDSWCLVLLVNLWLNPFVLLQMGGQLSYLLSFVLIMQQMENSW
TTGIKLFLVELPIILFSTYKIHLLTMVFNLIIVPIFSSVIVPIVIVAFAIPQLMVLLNPI
IMMFEVTLKYLDKLPGLIQVGKPSRLITLFMVILALKIISTKQSKFKKRALTFYSLIWLG
LWSWFKLNPYGEITFFDVGQGDSILIREPFNRTVTLIDTGGKMQFGKKPVAMKHTIAKNS
SINYLQSIGVSKLNNLCLTHQDVDHIGEASEILNNFKVKNLVFPVGVDTTQNYQRKILPF
IRRNTKVIACLAGTKIDHLPMEIKYPFQAGKGENGDSLVLAGNVGGKNLLLTGDLDLAGE
RKLLESGVLNQRVDIFKLGHHGSKTANSEEILKVIMPKLAIVSAGRHNRYGHPNLEVINR
LNSMGIPYASTQDEGMISYRYFLNGMGRWKTGIDEKESIIQ
NT seq 2106 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgattagtgtctgtttttttattcactttagtcataaagcaaattcaattaatacttat
aaccaaagtagaagtgatattgaaattgatttgagagtttatcccgatgaaattaagcca
atggaagacggcgtttcaattcgagcatatactaacaatgttaaccgtaaaggcttgcaa
gtttttattccagttaaaacggttgacgatttaaaaaaaattagtaaaactcaaaaagta
gttgaatttaaaattaaggggaatattgaaccgcttgaacgaccaacgaatataaatcaa
tttgattttcgacggattatgtatggtaaggcagtttattttaaagtgagtaaagctagt
ctgatagaatataatattttaactaaaaatagtttgattgctaagatacatagttggcgt
aaaaaattattgaaaagatgtacaaagttagaggaaccactacagagttattgtatgggg
attatccttggggaacagacggattatctaaaagaaaatagcactaagttacgtaatatg
ggtattattcatttgttttgtatttcaggattacatgtgttttatttcatcaagttaatt
gaaattgtttttactagatttaaaattaaaagggaaacgatggagataacccaaatagga
gttttacccctctattttattttgggtgggggaagtactagcctatttcgcgcggtggta
ttagttttagttcagttgataactaaaaaaatagctataaaagttagtacgcttgatagc
tggtgcttagttttattagtcaatttatggcttaatccgtttgtcttacttcagatgggt
gggcaacttagttatttattatcttttgtcttaattatgcaacaaatggaaaatagctgg
acaacaggaataaaattatttttggtagaattaccaattattttattttcaacatacaaa
atccacttattaacgatggtttttaatttaattattgttccgattttttcgagtgtaatc
gttccaatcgtaattgtagcttttgcaattccccaattaatggtgctattaaatccaatt
attatgatgttcgaagtaactttgaaatatttagataaattaccgggattaattcaagtt
ggtaaaccttcgcggctgatcactttattcatggtgatattagcgctaaaaattatttca
acaaagcaaagtaaatttaagaaaagagcgttaacgttctatagtctgatttggctgggg
ttgtggagttggtttaaattgaacccgtatggtgaaatcaccttttttgatgtaggtcaa
ggcgatagcattttaattcgtgaaccgtttaatcgaacagtaacgttaattgatacaggc
ggtaaaatgcaatttggcaaaaagccggttgcaatgaagcataccatcgctaagaatagt
tcaattaattatttacaaagtataggagtatctaagttaaataatttatgtttgacgcat
caagatgttgatcatattggagaagccagtgaaattttaaacaattttaaagtgaaaaat
ttggtttttccggtgggggttgatacaactcaaaattatcaacgaaaaatattgccattt
atccgacgcaatacaaaggtgattgcgtgcttagcggggacgaaaattgatcacttacca
atggaaattaagtatccgtttcaagctggaaagggtgaaaatggtgattctttagtttta
gctggtaatgtgggtggtaaaaatttactactaacaggtgatctagacctagctggtgaa
cgtaaattgttagaaagtggtgtattaaatcaacgggtggatatttttaaattagggcac
catgggagtaagacggctaattctgaagaaattctaaaagtaattatgcctaaattagct
attgtttcagctgggcgtcataatcggtatggacatccaaatctagaagttataaatcgc
ttgaattcaatggggattccttacgcttcgacacaggatgaaggaatgatttcttataga
tattttttgaatggtatgggaagatggaagacaggaatagatgaaaaggaaagtattatt
caatga

DBGET integrated database retrieval system