Pediococcus pentosaceus SL4: T256_06600
Help
Entry
T256_06600 CDS
T02906
Name
(GenBank) multidrug ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18887
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
ppen
Pediococcus pentosaceus SL4
Pathway
ppen02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppen00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
T256_06600
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppen02000
]
T256_06600
Transporters [BR:
ppen02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
T256_06600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_21
AAA_29
AAA_24
AAA_19
Zeta_toxin
AAA_16
AAA_28
T2SSE
AAA_22
DUF4536
DUF87
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA05414
LinkDB
All DBs
Position
complement(1291302..1293041)
Genome browser
AA seq
579 aa
AA seq
DB search
MWKLLKSRFTWWAVLVGTVFLMVQIAGDLLLPNITSDIINNGIAKNNIGYIWNSGLKMLL
VSLVGLIGAGVNVFFAATQAQKVGNKLRSDLFRKISFMSNYEFEKFGEASLITRTTNDVI
QIQNVIVMILRMMLMSPIMLVGAGFMAYQKQSELTAVFLVALPLLAVFVGIIMFFAVPLF
KGLQKKIDRINLVFREGLTGVRVIRAFNQDQFEQDRFADANHDYMKTGIKVFTIVSFMIP
VMTLLMSGTNIGIVWYGAHLIANQTMQVGNLVAFMTYATQILMSFMMLLMVFVSIPRASA
SAARINEVLNSENSVKDQANVENMIEDSTATLAYNNVKFRYPGAERLSIDNANFEAKAGD
TVAVIGGTGSGKTTLISLLPRLFDPESGSIELNGVDIKKLSQFNLHEQVAFAQQKAVLYK
GTIRENMRYGNENATDEEIWHALEVAQSTEFIKRDGDGLDTFVEQNGDNFSGGQKQRLSI
ARTLVKKAKVYVFDDSFSALDFKTDANLRKALREDPEIQKSIVIIVAQRIATVADADLIL
VLENGKVVGQGTHAELKQTNKTYREIIESQIKEGDQTNG
NT seq
1740 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggaaactactaaagtctcgatttacgtggtgggcggtattagttgggacagttttc
ttgatggttcaaattgcgggtgatttgcttttacctaatattacttcagatatcattaat
aatggtatcgccaaaaataacattggatacatttggaactcgggtttaaaaatgttatta
gtttcactagtaggattaattggtgcgggagttaacgtgttttttgctgcaactcaagcc
cagaaagttggtaataaactacgcagtgatctcttcagaaaaatatcgttcatgtccaat
tatgaatttgaaaaatttggagaagcttcgttaattactcgtacaactaatgatgttatt
caaattcaaaacgtgattgttatgattttacgcatgatgttaatgtcgccgattatgtta
gtcggagcaggatttatggcttatcaaaaacaatccgagttaaccgcagttttcttagtt
gcattaccattactggcagtttttgtgggaattattatgttttttgcggtccctttgttt
aagggccttcagaaaaagattgaccggatcaacttggttttccgtgagggattaactggg
gtacgtgtcatccgagcattcaatcaagatcaatttgaacaagatcgttttgctgatgca
aaccatgattatatgaaaactggtattaaggtatttacaatcgtttccttcatgatccca
gtaatgactcttttgatgagtggaactaatattggaatcgtctggtatggagctcattta
attgccaaccaaacgatgcaagttggtaatttggtagcctttatgacgtatgccactcaa
attttaatgagttttatgatgcttttgatggtcttcgtaagtatcccgagagcttcagct
tcggcagctcgtattaatgaagtattgaattctgaaaatagtgttaaagaccaagcaaac
gtggaaaacatgattgaagattcgactgctacattggcttataataatgttaaattcaga
tatcctggtgctgaacgtctttcaattgataacgctaattttgaagctaaggcgggagac
accgttgccgtaattggcggaactgggtctggtaaaactactttgattagtttgttacca
cgtttatttgatcccgaatctggttcaattgaattgaatggcgttgatattaaaaagtta
agccaattcaatctacatgaacaagtagcctttgcgcaacaaaaagcagttctttataag
ggtacgattcgtgaaaatatgcgttatgggaatgaaaatgctactgatgaagaaatttgg
catgctttagaagtagcacagtcgacagaatttattaaacgtgatggcgatggactagat
acttttgttgaacagaatggggataatttctcaggtggacaaaagcaacgtttatcaatt
gctagaacgttagttaaaaaagctaaggtatatgtttttgatgattcgttttcagccctt
gattttaagacagatgctaatttaagaaaagctcttcgtgaagatcccgaaattcaaaag
agtattgttattatcgttgctcaacgaattgccacggttgctgatgcagatttaattcta
gtattagaaaatggaaaagtggttgggcaaggaacgcatgcagaattaaaacaaacaaat
aaaacttatcgagaaattattgaatcacaaattaaggaaggagatcaaacaaatggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
