KEGG   Pediococcus pentosaceus SL4: T256_09030
Entry
T256_09030        CDS       T02906                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
ppen  Pediococcus pentosaceus SL4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppen00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppen03400]
    T256_09030
Enzymes [BR:ppen01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     T256_09030
DNA repair and recombination proteins [BR:ppen03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     T256_09030
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 DEAD PDDEXK_1 AAA_30 ResIII DUF3605 AAA_12 DUF3638 AAA_16 WXG100
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHA05856
LinkDB
Position
complement(1766750..1770457)
AA seq 1235 aa
MADREYTLSQKQAINSSGHNILVSASAGSGKTSVLVERVIQKIINGEDVDRLLVVTFTEA
AASEMKERIRAAIVKKINEVSDIELQNHFSMQLNKLNNANISTLHAFCMSIIRNYYYIID
LDPTFRIMDPTESELLKESVWADLREELYERDEDGKFALLTRNFSSDRSDEGLQDLILEL
FEFSNANPDPQAWLQQIAKNYEVPSDNVMDMEFIQQLLTEVKTKLMRIYRKDLDLTEQAI
NGGEPLKNAAEKFQNEVDDLKTIIDSLDGSWDDLQQAVSKMKFAQLPRGKKEEVQEFNAY
AKSIRNDFKDEFNTIADKYFKLSSEQMIVAFKDAHDLMMKLIEVQNQFAERFLQEKLTRR
SLDFSDLEHFALQIVLDDSEEGQAIRRDFQQKFNEVIVDEYQDINPLQETILTSVASPDP
GNMFMVGDVKQSIYAFRMADPSLFISKNNQFKDEEQADERIILAENFRSMRNVDDFTNLI
FNQVMDTEVGEIEYDDDAQLQFGAKYYPDEVQNNTEVMIYDDSQTDINDKEATPIISNKN
DGQLQMIAQRIQKLFADHTQIYDKKEQKMRDLEYSDIALLHSTGSNNLEIVDTFKKYGIP
IQVNNAQDYFQTTEVSIMMALLKIIDNPYQDIPLAAVLRSPMVGLKENELAFLRIGKKNG
HYFEALLYFLNEAKLDSNNEFQMQLKTKITHFLEQLDHFSKLARQSTLVDLLWAIYDETG
YLDYVGGMPDGPQRQNNLHALYDRAKGYEESSFKGLFQFVRFVEKMRDKNKDLAENPVVT
DVKAVKLMTIHGSKGLEFPIVFLIDAEHGFNTMDEKGRYVLDRDAGMGITLKDFIHRLEI
DTVQKNWIISIKNQKALAEKLRVLYVALTRAEQKLIITGAVNSADETLNKWAEAVDTDET
LIPAEARSKVSNFLDWIGMAIMRVPSVVEKYADYNTRKLQGTLIPDVELKIINSSELMDQ
QGLTALKSAQIPELQQLNAFDDIADVDKFKQIMNFKYHDEAATTTTAYQSVSEIKRVFDD
PDKFELNFSEVDADQHIKPQNRFVTESLMAPRFMNEATKPKAAEIGTATHLILQQLDLNQ
PINETIIKDKIGELVMNRVLDEQVANRIRISTILDFFDSDLGQLMINHPENVHREEAFSL
LLPAKGLFPKVKGDDDVLIHGIIDAYFEMEDRVILLDYKTDFVLPGSAEQGIEKVIKRYQ
GQVNLYAQALESILKRPVNEKYLYLLSIGRLVEIQ
NT seq 3708 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcagatagagagtataccttaagtcagaagcaagcaattaatagttccggccacaac
attttagtctctgcttcggcaggatcgggtaaaacctctgttttggtggaacgcgtaatc
caaaaaattattaatggtgaagatgttgatcgtctattagtagtaacgtttacggaagct
gctgccagtgaaatgaaggaacgtattcgagcagcgattgtgaaaaaaattaatgaagtg
agtgatattgaacttcaaaatcatttttcaatgcagctcaataagttgaataacgcgaat
atcagtacacttcatgcattttgtatgtcgataattagaaactattattacatcattgat
ctagatcccacgtttagaattatggatccaacagaaagcgagttattgaaagaaagtgtc
tgggcggatctccgggaagaattatacgagagggatgaggatggtaaatttgcgctcctc
acgcgtaatttttcaagcgatcgttcggatgaggggctgcaagatttaattttagaatta
tttgagttttcgaatgctaatccagaccctcaagcttggttacagcagattgctaaaaat
tacgaagttccatctgataatgttatggatatggagtttatccaacagcttttaacagaa
gtaaaaacaaagttgatgagaatttatcgcaaagacctagatcttacagaacaagcaatc
aatggtggagaacctttaaaaaatgcagctgaaaaattccaaaatgaagttgatgattta
aaaactattatcgacagcttagatggtagttgggatgatttacaacaagccgttagcaag
atgaagttcgcgcaactaccacgaggtaaaaaagaagaagtccaagagtttaatgcatac
gctaaatcaattcgaaatgattttaaagatgagtttaatacaattgcggataaatacttt
aaattatctagtgagcaaatgattgtggccttcaaggatgctcacgatttaatgatgaag
ttaattgaagtacaaaaccaatttgcggaacgctttttacaggaaaaactaacccgccgt
tctttagattttagtgacttagaacattttgcgttacaaattgttttagatgattctgaa
gaaggtcaagcaatcagacgcgacttccaacaaaaatttaatgaagtcattgttgatgaa
taccaagatattaatccgcttcaggaaacgattctgacgtcagttgccagtccagaccca
ggaaatatgttcatggtgggggatgtaaaacagtctatttacgcattccgaatggccgat
cctagtttgtttattagtaaaaataatcagtttaaagatgaagaacaagcagatgaacgg
attattttagcagaaaacttccgttcgatgcgaaatgtcgatgattttactaacttaatt
tttaaccaagtaatggatactgaagtaggagaaattgagtacgatgatgatgcacaattg
caatttggtgcaaaatactacccagatgaagttcagaataacaccgaggtaatgatttat
gacgacagccaaacagatataaatgataaagaagctactccaattatctcaaacaaaaat
gacggtcagttacagatgattgctcaacgtattcaaaaactatttgcggatcatactcag
atttatgataaaaaagaacaaaaaatgcgggacttagaatatagcgatattgctctgcta
cactcaacgggtagtaataaccttgagattgttgatacatttaagaaatatggaattccc
attcaagttaataatgcccaggattatttccagaccacagaagtttcaatcatgatggcg
ttattgaaaataattgataatccctatcaagatatcccattggcagcagttttaaggtcg
ccaatggtggggctgaaggaaaatgaactagcctttttacgaattggaaagaaaaatggg
cattactttgaggcactactttatttcttgaatgaggccaagctagattctaataatgag
ttccaaatgcagttaaaaacaaaaataactcactttttagagcagttagatcattttagt
aaattagcccgtcaatcaactttggtggacctcttatgggcaatttatgatgagacaggt
tatctagattatgttggtggaatgcccgatgggccacagcgccaaaataatctacatgct
ttgtacgatcgggcgaaagggtatgaggagtctagttttaagggactcttccaatttgtt
cgatttgttgaaaaaatgagagataagaataaggatttagctgaaaatccagtagttact
gatgttaaagctgtgaaattaatgacgattcacggaagtaaagggctagaatttccaatt
gtattcctaattgatgccgaacatggattcaataccatggatgagaaaggacgttacgtt
cttgatcgagacgcaggaatgggaatcacattgaaggactttattcatcggttagagatt
gatacagtccaaaagaattggattatttcaattaagaatcaaaaggcgttggctgaaaaa
ttgagggtactctacgtggccttgacgcgagcagaacaaaagctaattatcactggagca
gttaattctgcggatgagaccttgaacaagtgggccgaagcggtagacacggacgagacg
ttgattcctgcggaagctagatctaaagtaagtaactttttagattggattggaatggca
attatgcgagtaccttctgtggttgaaaaatacgcagattacaatacccgaaaattgcaa
ggtacactgattccggatgtagaattgaaaattattaatagcagtgagttaatggatcag
caaggattaacagctttaaagtcagcgcagatacctgagttacagcagttaaacgctttt
gatgatatagctgatgttgataagtttaaacaaattatgaacttcaaataccatgatgaa
gccgcaacgacgacaaccgcctatcagtcagtatctgaaattaagcgagtttttgacgat
cctgataaattcgaattgaattttagtgaggtcgatgcagatcaacacattaaaccacaa
aatcggtttgtaacggaaagtttaatggctccgcgttttatgaatgaagcgacaaagcct
aaggcagctgaaatagggaccgcaacgcatttaattttgcaacaattagatttgaatcaa
ccgattaatgaaacaattattaaagataaaattggtgagttggtaatgaaccgagtgttg
gatgaacaagttgctaaccggattcgtatttcaacaatattagacttttttgatagtgat
ttaggacagctaatgatcaaccatccagaaaatgtacatcgggaagaagctttttcgcta
ttactaccggctaagggacttttccctaaagttaaaggtgatgacgatgtgttgattcat
ggtattatcgatgcatatttcgaaatggaagatcgagttatcttattagactacaagacc
gattttgttcttccggggagtgccgaacaaggtatagaaaaagtaattaaacgataccaa
gggcaggtcaatttatacgcgcaagccttagagagcattttgaaacgaccagttaatgaa
aaatatctttatttgttatcgattggacgactagtagaaattcaataa

DBGET integrated database retrieval system