Prunus persica (peach): 18772520
Help
Entry
18772520 CDS
T03092
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC18772520 isoform X1
KO
K19026
spatacsin
Organism
pper
Prunus persica (peach)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pper00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pper03400
]
18772520
DNA repair and recombination proteins [BR:
pper03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
18772520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spatacsin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18772520
NCBI-ProteinID:
XP_020422597
LinkDB
All DBs
Position
G6:complement(17326203..17349915)
Genome browser
AA seq
3212 aa
AA seq
DB search
MDLSLGDKGPAILQLHKWGSSQAQLNLSEFREAFISPTRQLLLLLSYQCEALLIPLITGN
STASNNLESNSDESLQSPGSSAFCSQDLTAPGGSDSGRGDMPCTSGSTLDFDNDFTFQRE
ISRSKTYPFVGDVNSLAWGICEDTYNQHKDALFSEILFVSGKQGVMVHAFVESTGNTAGT
RNALEGRWVEWGPSVSLVDNMDIEEPSSLSCEATGNIDLNRANGNSVASKRWLQSFLTKV
ENVEYNGSMLTRFPEKSLFPCSAKVVSFALFNSNLPILDFLSNTGSVPSMGCGQERGHTS
ESDKSVNLHLTSSGQHFKSEILSNIFGVGMNTSYKCSRVFSSNSHYFIGFVFTQTDPASD
ESERSNNKNVLLVARLDRWGIQWVSSVKLDEGPKIRSVVEWIDFHFSDNLLVCLNASGLI
VFYAVMSGEYVAHLDILQTLGLYPQLDFQKQETVSVGSEKHSLQVDGVDYKPVLQCGDYS
GRRIFKRLIAASHTSLIAAVDDFGVIYVISAGDYIPDKYYTNEKLLPHGQHLGLGMLAAW
EVGGSDIGHQRVYSNISASQKSIIPSMKNERSSFLDDCGNNVLKQEGKGSSCLSGFSASS
KVTDQKCYDSEKKSHLMRKIFLPTYRFSEDDSICFSPLGITRLIKNHNLKDPRGSQIVHL
NLHAEPAVHDDNFLNSGCEMVHLQGKEESFIGEAVGCTFQGCFYLVTEGGLSVVLPSVSV
SSNFLPVEVIGCRQLCIDSGIGYPVKNAREIKESKQPWSPWNVEILDRVLLYESAEEADR
LCLENGWNLKISRMRRLQLALDYLKFDEIERSLEMLVGVNFAEEGVLRLLFAAVYLMIHK
VGNDNEISAASRLLALATCFSTKMIRKYWLLEHKTDAYEYARTQMLLLPPVVPQKVQDEI
SNSRRLREMAHFLEIIRNLQSRLGSKYKRPGQEFVESGEESTVVDNDLSQDESQLSIISV
DPKSLETSKQHEAYFPVSTSGFNYSEKLALTPVDPSVHLDSEDLSEVSALVPQGVLPLEN
PKEMIARWKIDNLDLKAVVNDALLSGRLPLAVLQLHLHRSRDSFSGKEPHDTFTEVRDIG
RAIAYDLFLKGESGLAVATLQRLGEDVEASLKQLLFGTVRRSLRMQITEEMSRYGYLGPY
EWKILDRISLIERLYPSSSFWKTLHGRQKELMRFPASSSLPKRYNLHLLDSHAFNNFSIE
CDDIDGVVFGSWTNVNENPSVPMVDEDNAYAGYWAAAAVWFSFYDQRIIDRIVLDQSSFM
GVHVLWESQLEYHVCHNDWEEVSRLLDLIPPHILVVGSLQVSLDGLQPASNFGCSRGPDY
GDYLCSLEELDAVCTDVPEIKVFRFSCNIMCSMWLRMLMEEKLARKLIFLKEYWEGTLDI
LPLLARSGFITSKYEMPSKDDKIESLSEPQFPDDSGTFNVSTMQALHKLLIHHCARYNLP
YLLDLYLDQHELVLDNDSLSSLQEAAGDCEWARWLLLSRVKGCEYKASFSNARAIMSCNL
VPGSNLSVPEMDEIIRTVDDIAEGGGELAALATLMYASVPIQSCLSSGSVKRNSSTSAQC
TLENLRPTLQRFPTLWQAFVSACFGQDATSNFLGPKAKNALSDYLNWRDNIFFSSVRDTS
LLQMLPCWFPKAVRRLIQLYAQGPLGWQSVSGLPVGEGLLHRDIDFVMNVDEDAEISAIS
LEATIQKHIEEELYNSALEENSLGLEHHLHRGRALAAFNHLLTVRVQKLKSEAQTHGQTN
VQADVQTLLGPITESEKSLLSSVMPLAIINFEDSVLVASCALFLELCGFSASMLRIDIAA
LRRMSSFYKSSENIESLKQLSTKGSAFHAVSHGSDLTESLARALADEHLHQDNSSTAKQK
GASNLAAGKQPSRALMLVLQHLEKASLPPMVDGKTCGSWLLSGNGDGIELRSQQKAASHH
WNLVTIFCQMHHLPLSTKYLSVLARDNDWVGFLSEAQIGGYPFDTVVQVASKEFSDPRLR
IHISTVLKGMQLRRKASSSSYSDTTEKKNEASFPDENFCVPVELFRILAECEKQKFPGEA
VLMKAKELSWSILAMIASCFSDVSPISCLTVWLEITAARETSSIKVNDIASRIANNVGAA
VEATNSLPSGTKALTFHYNRQNSKRRRLLEPISRDPSAVAISDISNSPVDAQIFDSQDPS
SKGERNVESGESINVSSDSDEGPALLSKMVAVLCEQHLFLPLLRAFEMFLPSCSLLPFIR
ALQAFSQMRLSEASAHLGSFSARFKEESTRLQSNVGREVQIGTSWISSTAIKAADAMLLT
CPSPYEKRCLLQLLAATDFGDGGSAAACYRRLFWKINLAEPLLRKDDILHLGSETLDDVS
LATALEDNRHWEQARNWARQLEASGGPWKSAVHHVTETQAESMVAEWKEFLWDVPEERIA
LWGHCQTLFIRYSFPALQAGLFFLKHAEALEKDLPARELHELLLLSLQWLSGMITLASPV
YPLHLIREIETKVWLLAVESEAHVKSEGDFNLSSSSRDPALKNSSSIIDRTASIITKMDN
HIGTFKNRTIEKHDPREHSLAYHKNQVLDASFPLTTGGVQRQTEGKGYMPLRRPPLDSAE
KNTDLDNGSNSLNTVNELQSQDENLKMELSFSRWEERVGPAELERAVLSLLEFGQIAAAK
QLQHKLSPVKVPSEFVLVDAALKLAAMSTPSKKVSILMLDEEVHSIIQSYNILTDQHQVD
PIQVLESLATNFTEGCGRGLCKRIIAVAKAAAILGISFSEAFDKQPIELLQLLSLKAQES
FEEAHLLVRTHSMPAASIAQILSESFLKGLLAAHRGGYMDSQKEEGPAPLLWRFSDFLKW
AELCPSEQEIGHSLMRLVITGQEVPHACEVELLILSHHFYKLSSCLDGVDVLVALAATRV
EAYVSEGDFSCLARLITGVGNFHALNFILGILIENGQLDLLLQKYSAAADANAGTAEAVR
GFRMAVLTSLKHFNPNDLDAFAMVYNHFDMKHETAALLESRAEQSSEQWFSHYDKDQNED
LLDSMRYYIEAAEVHKSIDAGNKTRRACAQASLVSLQIRMPDFHWLYRSETNARRALVEQ
SRFQEALIVAEAYGLNQPSEWALVLWNQMLKPEVLEEFVAEFVAVLPLQPSMLADLARFY
RAEVAARGDQSQFSVWLTGGGLPAEWAKYLGRSFRCLLKRTRDLKLRLQLATVATGFGDV
MDACMKSLDRVPDNVGPLVLRKGHGGAYLPLM
NT seq
9639 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttgtctttgggtgataagggacctgctatactgcagctgcacaaatggggctct
tctcaggcccagctaaacctgtcagaatttcgtgaagcttttatttctccgacaagacag
ctattattattgctttcgtatcagtgtgaagctttgttgattcctctaattacagggaac
tctacagctagtaataatttggagagtaactctgatgaaagtcttcagagtccaggttca
tctgctttctgctcacaagacttgacagcacctggcgggtcagattcaggaaggggtgat
atgccatgtacctctggatcaacactagattttgataatgatttcacttttcaaagagaa
atttcaagatccaaaacttacccttttgttggtgatgttaactctctggcttggggtatc
tgtgaggatacttataatcagcacaaggatgctttgtttagtgaaattttgtttgtatct
ggcaagcaaggtgtgatggtccatgcttttgttgaatccactggaaacactgcaggtacc
agaaacgcactggaaggcaggtgggtggagtgggggccctctgtctctttagttgataat
atggatattgaggaacctagcagcttgagttgtgaagccactggaaatattgatttaaac
agagccaatggaaacagtgttgcttctaagagatggttgcaatcttttctgacgaaagtt
gaaaatgttgaatataatggtagcatgttgaccaggttcccggaaaagtcattgtttcct
tgctctgcaaaggttgtttcatttgctttatttaatagtaatttaccgattctggacttc
ctttctaacactggttccgtaccgagtatggggtgcgggcaggaaagaggtcacacgtca
gagagtgataaatctgtaaacttgcatttgacttcatctggtcaacatttcaagtctgag
attttgtctaatatttttggtgttggaatgaacacttcatacaaatgctctagagtgttc
tcaagcaattcacattactttattggattcgttttcacacagactgatcctgctagtgat
gaaagtgaaagaagcaacaacaaaaatgtacttcttgttgctaggttagaccgttgggga
attcagtgggtttcctcagtgaagcttgacgaaggtccaaaaattcgctcagtggtagaa
tggatagactttcacttttctgacaaccttcttgtttgtctaaatgcatctggcttaatt
gttttttatgcagtaatgtcaggtgagtatgttgcacatctagatattttacagactcta
ggactctaccctcagctggattttcagaagcaagaaacagtgtctgtgggttctgagaaa
catagtttgcaagttgatggagttgattacaaaccagttttgcaatgtggtgattattct
ggtagaagaatatttaagaggttaattgctgcttcacatacctccctaatagctgctgtt
gatgattttggtgtaatatatgtgatttctgctggtgactatataccggacaagtattat
acaaatgagaaattacttccacatggtcaacatctaggactaggcatgttggctgcttgg
gaggtgggtggttctgatataggccaccaaagagtatattctaacatatctgcttcacag
aaatctattattccatccatgaagaatgagagatcttctttcctggatgattgtggaaat
aatgtgcttaaacaagaagggaagggcagctcatgcttgagtggtttttctgcttcatca
aaagtaactgatcagaagtgctacgactctgaaaagaaatcacacctgatgcgcaagatc
tttcttcccacttatagatttagtgaggatgattctatctgtttttctccattaggaatt
actcggcttattaagaaccacaatctgaaggacccgaggggttctcagatcgttcatctc
aatctgcatgctgagcctgcagttcacgatgacaactttttgaatagtgggtgtgaaatg
gttcatctccaagggaaggaagaatcctttattggagaggcagtgggttgcacattccag
ggatgtttttatttggtgacagaaggtggtctttcagtggtgcttccttctgtatcagtc
tcatcaaattttcttcccgttgaagttattggatgtcggcagttgtgtatcgattcaggc
attggatatccagtcaaaaacgcaagggaaataaaggaatctaagcagccttggtcacct
tggaatgttgaaattttggacagagtccttctgtacgaaagtgctgaagaggcagatcgc
ttatgtttggaaaatgggtggaacctgaaaatatctcgtatgcgtcggcttcagttggca
ttggactacttgaaatttgatgagatagagcgatcattagaaatgcttgtgggtgtcaat
ttcgccgaagaaggtgtgttaagattgctgtttgctgctgtttatctgatgattcataaa
gttggcaatgataatgagatttctgctgcatcaaggcttcttgcattggccacttgcttt
tcaaccaaaatgattcgtaagtattggttgctagaacataagacagatgcatatgaatat
gccagaacccagatgcttttgcttccaccagttgtaccacaaaaggtacaagatgaaatc
tcaaactcaagaaggcttcgtgagatggctcactttttggagataattcgaaatctgcaa
tctcgacttggttcaaagtacaagaggccaggccaagaattcgtggaaagtggggaagaa
tcaacggtagtggacaatgatttatcacaggatgagtctcagttatcaattatttccgta
gaccccaaatctttggagacatcaaaacagcatgaagcttattttcctgtatctacgtct
ggctttaattattctgagaagcttgctttgacacctgtagatccttcagtccatttggac
tcagaggatttaagtgaagtatctgctcttgtgccacaaggggttcttcccttggaaaat
cccaaagagatgatagcgcgttggaagatagataatttagaccttaaggcagtagtcaat
gatgctttactctccggtcgtctccccttagcagttcttcagctacatcttcatcgttca
agggattcattttctggaaaagagcctcatgatactttcactgaagtccgtgatattgga
agagctattgcttatgacctatttttgaagggtgaatctggacttgctgtggccacgttg
caaaggcttggagaggatgtagaagctagcctcaagcagttattatttggcacagtgaga
agatctcttcgaatgcaaatcactgaggagatgagtagatatggttacctggggccatat
gagtggaagatattggatcggatatccctaattgagaggctttaccctagcagtagtttc
tggaaaacgcttcatggacggcagaaagaattaatgcgatttccagcaagttcaagtttg
cccaagagatataatttgcacctgctggattcacatgcattcaacaatttttccattgag
tgtgatgacattgatggagttgtttttggttcatggacaaatgtcaatgaaaatccctct
gttcctatggtggatgaagataatgcttatgctggatactgggctgctgctgctgtatgg
tttagcttctatgaccaaagaatcattgaccgtatagttttggatcagtcatcttttatg
ggtgtgcatgtactgtgggaatcacagcttgagtaccatgtatgtcacaatgattgggag
gaagtctctagactcctggaccttattcccccacatattttagtagttggaagcctccaa
gtcagcttggatgggttacagcctgcttcaaattttggatgcagtaggggacctgactat
ggcgattacttatgctctcttgaagaattggatgctgtctgcacggatgttccagaaatc
aaagttttcaggttttcatgtaatattatgtgctccatgtggttaaggatgctgatggaa
gagaaacttgctagaaaactaattttcttaaaggaatattgggaaggcaccttagatata
ttacctctgcttgcccgttctggctttattactagcaaatatgaaatgccttccaaagat
gataagattgagagtttatcagagccacaatttccagatgattctggaacatttaatgtc
agtaccatgcaggccttacataaactactgatacatcattgtgcacggtataacttgcca
taccttctggacctttaccttgaccagcatgagttggtactggataatgattcactttct
tcactacaggaagctgcaggagattgtgaatgggcaagatggttgctcctctctagggtt
aaggggtgtgagtacaaagcatcattttccaatgctcgtgcgatcatgtcgtgtaatcta
gttcctggaagtaacctcagtgttccagagatggatgaaataattcgtactgttgatgac
attgcagaaggagggggggaattggcagctttggcaacactgatgtatgcctctgtccca
attcaaagttgcctgagtagtggtagtgtaaaaaggaatagcagcacatcagcccagtgc
acactagagaatctcaggcccactcttcagcgtttccctacattgtggcaagcatttgta
tcagcatgttttgggcaagatgcaacttccaattttttggggcctaaagcaaagaacgct
ctatcagattatttaaattggcgtgacaacatattcttctcttctgtacgtgatacttca
cttctacaaatgctgccgtgctggtttccgaaggctgtacggaggttgattcagctttat
gcccagggtcctcttggatggcaatcagtatcaggtctgccagtgggagaaggtttgcta
catagagatatagattttgtcatgaacgtcgatgaggatgctgagatcagtgcaatctcc
ttggaagcaaccatccaaaaacacattgaggaggaactctataattctgcacttgaggag
aattcacttggcctggagcaccatttgcatcgtggacgtgcactagctgcttttaaccat
ttacttactgttagagttcaaaaattgaagtcagaggcacaaacacatggacaaacaaat
gttcaagctgatgttcaaacacttctcggacctataacagaaagtgaaaagtctcttctt
tcttctgtcatgccacttgcaattattaattttgaggattctgtgttggtggcttcatgt
gctcttttcctggagctttgtggcttttctgcgagcatgctacgcatagacattgctgcc
ttgagacggatgtcttctttctacaaatctagtgaaaatattgagagcttaaagcagctt
tcaaccaagggttctgcatttcatgcagttagccatggaagtgatctaacagaatctcta
gctcgtgctctagcagatgaacatctgcaccaggataattcaagtactgctaagcaaaag
ggtgcttcaaatttagctgctggtaaacaaccttcacgagctctcatgcttgtcttacag
cacttggaaaaggctagccttcctccaatggtggatggaaagacatgtggttcttggctt
ttgagtggcaatggtgatggaattgagttaagatctcaacagaaagctgcaagccatcac
tggaatttagtcacaattttttgtcagatgcatcaccttcccttgagcacaaaatacctt
tctgtattggcaagagacaatgattgggttggatttttgtcagaagctcagattggagga
tatccgtttgacacagtagtccaagtggcatcgaaggagtttagtgatccacgtctcaga
attcatatttcaacagttttgaaaggcatgcagttaagaagaaaagctagctcttcttcg
tattcagatactacagaaaaaaagaatgaagcttcctttccggatgaaaatttttgtgtc
ccagttgaactctttagaatattagcagaatgtgaaaagcagaaatttcctggagaggcc
gttttgatgaaagcgaaggagttgtcctggtcgattttggcaatgattgcatcgtgcttt
tcagatgtgtctccaatatcttgcctaacagtctggctggaaatcactgcagcaagggaa
acttcgtccattaaggtgaatgatattgcttccagaattgcaaataatgttggagcagct
gtggaagctactaattccctgccgtcagggactaaagcccttacttttcattacaatagg
cagaattcaaaacgaaggcggcttctggagcccatctcaagagatccgtcagctgttgca
atttctgatatttcaaattctcctgtggatgcacaaatatttgattcccaggaccctagt
tctaaaggggaaaggaatgtagaaagtggtgaaagtatcaatgtttcaagtgattctgat
gaagggcctgctttgctgtcaaagatggttgcagtgctttgtgagcaacacttgttcctg
cctttgttaagggcttttgaaatgttccttccctcatgttctcttttacctttcatacgt
gctctccaggcattttcacaaatgcgcctatctgaagcatcagctcatttgggttcgttt
tctgcccggtttaaagaagaatcaacccgcttacagtcaaatgtaggaagagaagtgcag
attggtacatcatggataagctccaccgccattaaagctgcggatgcaatgcttttgacg
tgtccatctccttatgaaaaaagatgcttactacaactccttgctgcaactgattttggt
gatggaggatctgcagcagcatgctaccgacggcttttttggaaaattaatttagctgag
ccattattacgcaaggatgacattttacaccttggaagcgagaccttagatgatgtttca
cttgcaacagcattggaggataataggcattgggagcaagcacgcaactgggccagacaa
ttggaggccagtggtggaccttggaaatctgctgttcatcatgtaactgaaactcaggct
gagtcgatggtagctgagtggaaggagtttctttgggacgttccagaagagagaattgct
ttatggggccattgccaaactttgttcatcagatattccttccctgctttacaggctggg
ttatttttcctcaaacatgcagaagctttggaaaaggatcttccagctagggagcttcat
gagctattgctgctttctctacaatggttaagtgggatgataaccctggccagtccagtg
tatccacttcatcttattcgggaaatcgagactaaagtgtggctcttggcggtagaatca
gaagcacatgttaagagtgaaggagacttcaatttaagcagttccagtcgtgaccctgct
cttaaaaatagctccagtattattgaccgaactgcaagtataataacaaaaatggacaat
catattggtacatttaagaacagaactattgagaaacatgatccaagggaacacagcctg
gcatatcacaagaaccaagtattagacgctagctttccactcaccacagggggagtacaa
agacaaacggagggcaaaggttacatgccattgagacggccaccattggactccgcagaa
aaaaacactgatcttgataatggttccaattctctcaatactgtaaatgagttgcagtct
caggacgaaaacttaaaaatggaactgtctttttcacggtgggaagaaagggttggacct
gcagagctggaaagggctgttctttctttattggaatttggacaaatagcagctgcaaag
caactccagcataagctatcaccagtgaaagtaccatctgaatttgtacttgtggatgct
gcattgaagcttgcagctatgtcaactccaagtaagaaagtatccatattaatgcttgac
gaagaggtgcattcaataattcagtcatacaatatactgactgaccagcatcaagttgac
ccaattcaggttttggagagtctggcaaccaattttactgaaggttgtgggcgtggacta
tgcaagaggataatagcagtcgccaaagcagcagccatcttaggtatttcattttcggag
gcatttgataagcagccaattgaattgctacagctgctttcccttaaagcacaagaatca
tttgaggaggcacatctccttgtgagaactcattcaatgccagcagcgagtattgctcaa
attctttcagaatcctttctaaagggcttattggctgctcatcggggaggatatatggat
tctcaaaaggaagaaggacctgctcccttattgtggagattttcagacttcttgaagtgg
gcagagctttgcccttcagaacaagaaattggacattcattaatgcgtttggttattact
ggacaagaagtaccgcatgcctgcgaggttgagctgctaattttgtctcaccacttctac
aaattatcatcttgcctggatggagttgatgttcttgtagcccttgccgctactagggtt
gaggcttatgtgtctgagggtgacttttcatgtttggcccgtctcataactggagtagga
aacttccatgccctcaatttcattcttggaattcttattgaaaatggtcagcttgatctt
cttcttcagaagtattcagctgctgcagatgcaaatgctggcactgctgaggctgtcaga
ggatttcgaatggcggttctcacatcactgaagcattttaatccaaatgaccttgatgcg
tttgctatggtctacaatcatttcgacatgaaacatgaaacggctgctcttttggagtca
cgagcagagcagtcatcggagcagtggttcagccattatgacaaggatcagaatgaagac
cttttagactccatgcgctattacattgaagctgctgaagttcacaaatccattgatgct
ggcaacaaaacacgcagagcgtgcgctcaggcttcccttgtgtctcttcaaattcgaatg
cctgattttcattggctgtaccgatctgaaaccaatgccaggcgggcccttgttgagcag
tctcgtttccaagaggccctaattgttgctgaagcctatggtcttaaccagccgagtgag
tgggctttggtactttggaaccagatgctcaaaccggaagtactggaagagtttgtggct
gaatttgtggctgtgcttcctctccaaccctctatgcttgctgatctagcaagattttat
agggccgaggtggcggctagaggagaccagtctcaattctcagtttggctaactggggga
gggttgccagctgaatgggctaagtatctggggaggtcatttagatgcttgttgaaaagg
actagagatttgaagctgcggttgcagctggctactgtggctactggctttggggatgtc
atggatgcatgcatgaagtcattagatagggtccctgacaatgttggaccacttgtactg
aggaaaggccatggtggtgcttatctcccactaatgtga
DBGET
integrated database retrieval system