Prunus persica (peach): 18792176
Help
Entry
18792176 CDS
T03092
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: pentatricopeptide repeat-containing protein At2g04860
Organism
pper
Prunus persica (peach)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
Alpha-amyl_C2
PPR_3
Alpha-amylase
E_motif
AMT4_dom_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18792176
NCBI-ProteinID:
XP_007222445
LinkDB
All DBs
Position
G1:37191871..37197475
Genome browser
AA seq
1127 aa
AA seq
DB search
MNIRCHPTHPIAHTTSKGNMNFLLSFCFCLCVSRLPSFATPAVLFQGFNWDSSKKGGWYN
SLKTTIPELASSGITHVWLPPPSHSNGTEGYDPGRLYDLDASSYGNKDELKSLIATMHEK
GIKAIADIVLNHRSAVKQDENGIWSIFEGGTEDGRLDFNASLICRDDNDHPFGTGNPDTG
DNFPYTADVDHTNPRLQTELSDWLNWLKTDIGFDGWRLDYVIGYGSSFTKLYMEKTSPEF
AVAEYWRWNISKGQDGKLDKNQDAHRNEIVNWIEAAGGVVTAFDLTTKYILNVAVEGELW
RLKDSNGKPPGLIGIKPESAVTFIDNHDTWSQGLLPFPDDKVLLGYAYILTHPGTPSIFY
DHFFDWGWPKESIRNLTAIRARNGINSRSSVTILAAEADLYMANIDDKIIMKIGPRLGLG
DLDPTKSNFHVATSGQDFAVWEKNXTRKKKASCTSSSSSSSSSALNSVNVKRDANQIHTH
LLKSGVDRFMYVSTALLDLYMKLGCVRNAHRLFDDMPDRDVVSWNALICGFSRNGCDFEA
LKLFVQMCKEGFFPHQTTLVSLVPSCGRQELVSQGKSIHGFGIKAGLYSDSHVKNALTSM
YAKCADLEAAEHLFEEIVEKSVVSWNTMIGAYGQNGFFDEAMLAFKRMQEENVPANLVTM
VSLLSANADPESTHCHATKTGLVNDASVITSLICQYATRRNTESGKLLYKSLPQKNLVSL
TALMSSYTEKGDLFQVMSCFAHLQQLEMKLDAVAMVCILHGMKDPMGFCLGLAFHAYGLK
SGLSADSLVANGLISLYSRFDKIETAFSLLSEIHEKTLISWNSLISGCVQAGRPSDALEV
FFQMKMSGHSPDAITISSLLSGCCQLGYLQFGERLHNYILRNNHEVEDFVGTALIDMYIK
CGRIEHAERVFKSIEEPCLATWNSMISGYSLYGLEHEALACFSEMQNQGIKPDKITFLGV
LAACTHGGLVQEGRKHFQIMREQFNMVPDLQHYACMVGLFGRAGLFEEALMFIRNMEMEP
DFAVWATLLSACCIHQEVKLGEYVARKLFFLDSNNGGFFVLMSNLYAVKGMWDEVARVRE
MMRESGGDGCSGISVIEMTSLEDMNVNLSSSKSSLNANAWQPLLSLY
NT seq
3384 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataagatgccatccaacccatcccattgcacatacaacttcgaaaggcaatatg
aattttctcctttcattctgcttttgcctctgcgtttctcgtttgccctcattcgcaact
ccagctgtgttatttcaggggttcaattgggattcaagtaaaaaaggaggatggtacaac
tccctcaagaccaccattcccgaactcgctagctctggaattacccatgtctggcttcct
cctccttctcactctaatggaactgagggatacgacccgggaaggctatacgatctcgat
gcatcaagctatggaaataaggacgaattgaagtccctgattgctactatgcatgagaag
ggaatcaaagccatcgctgacattgtgttaaaccacagatcagctgtcaaacaagacgag
aatggaatatggagcatctttgaaggtggaacagaagacggacgtcttgacttcaatgcc
tcattgatctgcagagatgacaatgaccatccttttggaactggaaatccagacacaggg
gacaactttccttacactgctgatgtggaccacaccaatccaaggctacaaaccgagctc
tctgattggttgaattggttgaaaactgatatagggtttgatggatggaggttggattat
gtgattggatatggctccagcttcaccaagctctacatggaaaagacttcaccagaattt
gcagttgctgagtattggcgttggaacatttcaaaagggcaggatggcaaacttgacaag
aaccaagatgcacataggaatgaaatagtgaattggatcgaggctgctggtggcgttgtc
acggcgttcgatttgacaaccaagtacatcttgaatgttgctgtggagggtgagctatgg
aggctcaaggattctaatggaaaaccaccaggtttgattgggatcaaaccagaaagtgct
gtaacatttattgacaatcatgacacttggtctcagggacttttgcctttcccagatgac
aaagtcctgcttggatatgcttacattctcacccatcctgggaccccaagcatattctat
gatcacttctttgactgggggtggccaaaggagtctatacgcaatttgactgcaattagg
gcaaggaatggaataaattccaggagcagtgtgactattttagctgcagaggctgatcta
tatatggccaacattgatgacaagattatcatgaagattgggccaagattgggccttgga
gaccttgatcccacaaagtcaaacttccatgttgccaccagtggacaagacttcgctgtt
tgggagaaaaattgaactagaaagaagaaagcttcctgtacttcgtcttcttcttcttcc
tcctcctcagctttaaattccgtgaatgttaaaagggacgcaaatcagattcatacccac
ttgctaaaatcgggtgttgaccgattcatgtatgtgagtactgctcttcttgatttgtat
atgaaactgggatgtgttagaaatgctcataggctgtttgatgatatgcctgacagagac
gttgtctcttggaatgcgttgatttgtgggttttcgcgaaatgggtgtgattttgaagcg
ttgaaactctttgttcaaatgtgtaaagagggattttttcctcatcagacgactttggtt
agtttggttccatcttgcggtaggcaagagttagtttctcaagggaaatctattcatggg
tttggaattaaggcgggcctttattctgattctcatgtgaagaatgctcttacctcaatg
tatgctaaatgtgcagatttggaggcggcagagcatttgtttgaggagatagttgagaag
agtgtagtttcttggaatactatgattggtgcttatggacaaaatggcttctttgatgag
gcaatgcttgcctttaaacgaatgcaagaggaaaatgttccagccaatctggtgaccatg
gtaagccttctgtcagcaaatgccgatccagagtctacccattgtcatgccactaaaact
ggtcttgtcaatgatgcttctgtaattacttcattaatttgccaatatgcaacacgcagg
aacacagaatccggcaaacttctttacaagtcattgcctcagaagaacttggtttcccta
actgcacttatgtcaagctatactgagaaaggtgacctgtttcaggtgatgtcgtgtttt
gctcacttgcagcagttagaaatgaagcttgatgcagttgctatggtttgcatcctccat
gggatgaaagatcccatgggcttttgtcttggacttgcttttcatgcttatgggctaaag
agtgggttgagtgctgattctttggttgcaaatgggttgataagcctgtactcgaggttt
gacaagatagaaactgctttctctttactttctgagatacatgagaaaacattgattagt
tggaattctttgatatcgggctgtgtacaagctggaaggccaagtgatgccctagaggtt
tttttccaaatgaaaatgtctggacacagtccagatgccattaccatctctagcttacta
tcaggttgttgccagcttgggtacttgcaatttggggagaggcttcataactatatccta
agaaacaatcacgaagtggaagattttgttggaactgctcttatagacatgtacatcaag
tgtggaagaatagagcatgctgaaagggtgtttaagagcatcgaagaaccgtgcttggca
acatggaactcaatgatctcgggttatagcttatatgggttagaacatgaagctcttgct
tgcttctcagaaatgcaaaatcaggggataaagcctgataaaataacttttttgggagtt
ttagcggcttgtactcatggaggtcttgttcaggagggaagaaaacatttccaaatcatg
agggaacagttcaacatggtgccagatttgcaacactatgcttgcatggttggtctcttt
ggtcgtgctggcttgttcgaggaggcattaatgttcatcagaaatatggaaatggagccc
gatttcgcagtgtgggcaaccttgctgagtgcttgttgcatccatcaagaggtgaagctt
ggggaatatgttgccagaaagttgtttttcttggacagtaacaatggtggattctttgtg
ttgatgtcaaatctttatgcggttaaaggaatgtgggatgaagtagctagggtgagggag
atgatgagagagagtggaggggatggctgttcaggaattagtgttattgagatgacttca
ttggaagacatgaatgtaaacttaagctcgagcaagtctagtttgaatgcaaatgcttgg
caacctctactctctctatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
