KEGG   Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_054
Entry
C9I82_054         CDS       T05580                                 
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
  KO
K03555  DNA mismatch repair protein MutS
Organism
ppet  Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Pathway
ppet03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppet00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    C9I82_054
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
    C9I82_054
DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     C9I82_054
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_I MutS_II MutS_IV Rad17 AAA_14 RNA_helicase nSTAND3 AAA_27
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXN02032
UniProt: A0A346DZ77
LinkDB
Position
complement(56403..58793)
AA seq 796 aa
MNKKLNIHIPIIQQYLSIKEKYFDILLFYQMGDFYELFYDDAKKISGLLGITLTNKGVSC
GKIVPMAGIPCRTVNNYLHKLISLGESIALCNQTDNICKHNGLIERKVIKVYTPGTIIEE
GLVEDKENNILAAIWQNEDFYFGYSTIDIGSGDFFVYELFNFKSMADIIEKTNPVELIYP
DNFKSMDLIKKINCTKCVRYWEFDLDTAIKQLNLQFSTNDLSGFGLNITNFSLRSAGCLL
QYIKNTQCTILRHIKNIKIKYENENIMIDASTRKSLEITKSLSNIKTNTLSYILDKTVTP
MGSRMIKRWLHSPIKDINLIKNRQKSILSLMDVYQKLQPILSQVGDFERILARIFLKTAI
PRDFIHVRNIFNIIPKIKYILIKRKNPYLKKIYRKIDDFNNLNLILKKAIYDSPSISIKD
GGVIATGYNKKLDKLRELNSWMNKYINNLEKSEREKLNLNSLKINFNLITGYYIQISKTH
KHLVPVHYILKQSLKNVERYITPELKKYENRVFFSKIKILSLEKKIYNELFDIFLPYINL
LKKSSKYLAELDVLLNMSERAITLNYCCPILSYNQEINIDDGRHPIIEYSMNKPFITNSL
KINKNKRMLIITGPNMGGKSTYMRQIALIVLMAWSSSFVPANYAEIGWFDQIFTRIGSID
DISSNRSTFMVEMSEMSNILNNATSKSLILIDEIGRGTSPQEGLAIAFACANYLINKIKA
ITLFATHYFELTKIKKNNKNVCNVSFNAIIKNKNIVYLYELKNKPSNKSLGFYVAKLAGF
PNRVIDNAIDIFKKNK
NT seq 2391 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaaaattaaatatacacatccctattatacaacaatatttatctattaaagaa
aagtattttgatattttattattttatcaaatgggtgatttttatgaattattttatgat
gatgctaaaaaaatctctggtctattaggtattacattgacaaataagggtgtatcatgt
ggtaaaatagttcccatggctggaataccatgtagaacagtaaataattatttacataaa
ttaatttctttaggagaatcaatagcattatgtaatcaaacagataatatttgtaaacat
aatggcttaatagaaagaaaagttatcaaagtttatactccaggtactattattgaggaa
ggtcttgtagaagataaagaaaataatattttagcagctatatggcaaaatgaagatttt
tattttggttattcaactatagatattggttccggagatttttttgtttatgaattattt
aattttaaatctatggctgatataatagaaaaaacaaatcctgtagaattaatttatcca
gataattttaaatcaatggatttaattaaaaaaataaattgtacaaaatgtgtacgttat
tgggaatttgatttggatacggcaataaaacaactaaatttacaattttctacaaatgat
ttgtcaggttttggtttgaatattacaaatttttctttaagatccgctggttgtttatta
caatatatcaaaaatactcaatgtactattttacgtcatattaaaaatattaaaattaaa
tatgaaaatgaaaatattatgatagatgcttcaacacgtaaatctttagaaatcactaaa
agtttatctaatataaaaaccaatacattatcttatatattagataaaactgtaactcct
atgggaagtagaatgataaaaagatggttacattctcctattaaagatattaatttgatt
aaaaataggcaaaaaagtatattatcattaatggatgtatatcaaaaattacaaccaata
ttatctcaagttggtgattttgaaagaattttagctagaatttttttaaaaacagctatt
cctagagattttattcatgttagaaacatatttaatattatacctaaaattaaatatata
ttgattaaaagaaaaaatccgtatttaaaaaaaatatatagaaaaatagatgattttaat
aaccttaatttaattttaaaaaaagctatatatgatagtccttctatatctattaaagat
ggtggagttattgcaactggttataataaaaaattagataagttaagagaattaaactct
tggatgaataaatacataaataatttagaaaaatctgaacgtgaaaaattaaatttaaat
tctttaaaaataaatttcaatttaataaccgggtattatatacagatcagtaaaacacat
aagcatttagtacctgttcattatatacttaaacaatctttaaaaaatgtggaacgatat
attacaccagaattgaaaaaatatgaaaatagagtttttttttcaaagataaaaatttta
tctttagaaaaaaaaatatataatgaattatttgatatatttttgccatatattaatctt
ttaaaaaaatcttccaaatatcttgctgaattagatgtattattaaatatgtccgaaaga
gcaataactttaaattattgttgtcctattttaagttataatcaagaaataaatattgat
gatggtagacatcctattattgaatatagtatgaataaaccgtttattacaaattcttta
aaaattaataaaaataagcgtatgttaataataacaggtccaaatatgggaggtaagagt
acttatatgagacaaatagcattaatagtacttatggcatggagtagtagttttgttcca
gctaattatgctgaaataggttggtttgatcagatattcactagaattggttctattgat
gatatttcatctaatcgttccacttttatggttgaaatgtcagaaatgtccaatatttta
aataatgctacatctaaaagtttaatattaatagatgaaataggtagaggaacatcacct
caagaaggattagctatagcatttgcatgcgctaattatttgataaataaaattaaagcc
attactttatttgcaacacattattttgaattaactaaaataaaaaaaaataataaaaat
gtatgtaatgtcagttttaatgctattataaaaaataaaaatatagtttatttatatgaa
ttaaaaaataaaccgtctaataaaagtttaggtttttatgtcgctaaattagcaggattt
ccaaatagagttatagataatgcaattgacatatttaaaaaaaataaataa

DBGET integrated database retrieval system