KEGG   Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_065
Entry
C9I82_065         CDS       T05580                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
ppet  Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Pathway
ppet03030  DNA replication
ppet03430  Mismatch repair
ppet03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppet00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    C9I82_065
   03430 Mismatch repair
    C9I82_065
   03440 Homologous recombination
    C9I82_065
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:ppet03032]
    C9I82_065
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
    C9I82_065
Enzymes [BR:ppet01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     C9I82_065
DNA replication proteins [BR:ppet03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     C9I82_065
DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     C9I82_065
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXN02043
UniProt: A0A346DZ88
LinkDB
Position
complement(73086..76583)
AA seq 1165 aa
MFNSKFIHLSVHTDYSIIDGLIKINSLVNKIFTLCMSAVAVTDFNNIFGLVKFYNLSHKI
GIKPIIGADFIIKSLTNGINKLTILAKNNIGYKNLIFLISLAYKNKINNSIPAITYELLI
KYKDGLIILSGGIHGDIGKSLLDNNDMLIKKNINFYKKYFNNNYYLELSRIGKINEENYI
NLAIDLSYKENIPVVATNKVRFLKKDDFYIHEIRVAINNGNKLNDLKYSSKYSNLQYLRS
EQEMCKLFIDIPEALINTVEISKRCNVFLDWNKYHLPKFKLKNISEEDYLFLQANKGMKK
RLLFLYSEKNKKNIKYENYYERLNHELNIIKQVGFSGYFLIVMEFVKWAKSNFIPVGPGR
GSGAGSLVAYALGITDIDPLDFNLIFERFLNCEKISLPDFDIDFCMEKRDLIIEHVIKKY
GYNNVSQIITFGTMTAKVVIRDVGRVLGYPYGFVNKISKLIPFDPGITINNALFLSPQLL
IYYKTDNSIKELIDLSIKLEGIIRNVGKHAGGVVISPKKITNFLPLYYDKDSKNSLTQFD
KNDIERIGLIKFDFLGLRTLTIIDNTLKIINIKRKKLGKKIIDINKITLNDKKSFLILKT
AKTTAVFQLESYGIKNLIRRLQPDTFEELIALIALYRPGPLQSGMVDNFINRKHGKELIA
YPDKYWQHKSLKPILESTYGIILYQEQVMQISQILSDYSLGQADILRRAMTKKKKSVMLK
QRILFKKGAIKKGININLAMKIFDLMEKFAAYGFNKSHSAAYALISYRTLWLKANYPVEF
LVSVLNAEINNTDKLSFLINECKYLQINICSPNINLSMYNFFIDKFGNIVYGLGAIKGLN
KDLIYLIVNNRIKNGKYNSLLDFCIRIKSKKLNISMLKKLIFSGALDTIDSSRYNLLKNL
ENSFKVTEQYLGSQSVGQIDMFNLLKEKFSYTNVFNTKYLLNWSEEYESNKEKESLGFYL
IKHPITKYFKEIRKYTNNNNTLKDLLSIDINNKTNNFVVFGLVTSVKFSKTKYNNKVIIF
TLDDSFGNIEIVLLEKYINKYKHLILCNNILIVNIRVKFNFFSRYLNVLANNIIDIIEAR
NKYLSKVIIYIPKKKIKNSILKLLCYYLKTLLQGNLTLYLYKLKNNIYKNEKKLIRKMKH
IVPSNDFINKVESLLGKEYIELKFK
NT seq 3498 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaattctaaatttatacatctaagtgttcatactgattattctataatagatgga
ttaataaaaataaatagtcttgtaaataaaatttttactttatgtatgtcagctgttgca
gttactgattttaataatatttttggtttagtaaaattttacaatttatctcataaaatt
ggtattaaaccaattataggtgctgattttataattaaatctttaacgaatggaattaat
aaactaactattttagcaaaaaataatataggttataaaaatttaatatttttaatatcc
ctggcatataaaaataaaattaataattcaatacctgcaattacttatgaattattaatt
aaatataaagatggattaatcatattgtctggagggatacatggtgacataggtaaatca
ttattagataataatgatatgttaattaaaaaaaatattaacttttataagaaatatttt
aataataattattatttggaattatcaagaattgggaaaataaatgaagaaaattatatt
aatttagcaatagatttatcatataaagaaaatataccagtagttgcaactaataaagtt
cgttttttaaaaaaagatgatttttatatacatgaaattagagtggctattaataatgga
aataaattaaatgatttaaaatattcttctaaatatagtaatttacaatatcttcgtagt
gaacaagaaatgtgtaaattatttattgatatccctgaagcattaataaatactgttgaa
atatctaaaaggtgtaatgtttttttagattggaacaaatatcatttacctaaatttaag
ttaaaaaatattagtgaggaagattatttatttttacaagctaacaaaggaatgaagaaa
cggttattatttttatactctgaaaaaaacaaaaaaaatattaaatatgaaaattattat
gaaagattaaatcatgaattaaatataataaaacaagtaggtttttctggttattttttg
atagttatggaatttgttaaatgggcaaaatctaattttattcctgttggtcctggtaga
ggttcaggtgctggttctttagttgcttatgcattaggaattacggatattgatccgtta
gattttaatttgatttttgaacgttttttgaattgtgaaaaaatttctttacccgatttt
gatattgatttttgtatggaaaaaagagatttgattattgaacatgttattaaaaaatat
ggttataataatgtatcacaaattattacttttggaacaatgacagctaaggttgtgata
cgtgatgtaggacgtgtacttggttatccatatggatttgtaaataaaatttctaaatta
attccatttgatccaggtattactataaataatgctctttttctgtctcctcagttatta
atatattataaaactgataattctatcaaagaattaatagatctttcaattaaattagaa
ggtattatacgtaatgtaggtaaacatgctggtggagttgttatatcacctaaaaaaata
actaatttcttacccttgtattacgataaagattctaaaaattctttgacacaatttgat
aaaaatgatattgaacgtattggtttaataaaatttgattttttaggattacgtacactt
acaattattgataatactttaaaaataattaatattaaaagaaaaaaattaggaaagaaa
ataattgatatcaataaaataactttaaacgataaaaaaagttttcttattttaaaaaca
gctaaaacaactgctgtattccaacttgaatcttatggtattaagaatttaattagacga
ttacaaccggatacatttgaagaattgattgcattaattgcattgtatagacctggtcct
cttcaatctggaatggttgataattttataaacagaaaacatggtaaggaattaatagca
tatcctgataaatattggcaacataaatcattaaaacctatattagaatctacgtatggt
attattctttatcaagaacaagttatgcaaatatcacaaattttatccgattatagttta
ggtcaagctgatatattaagaagagctatgactaaaaaaaaaaaaagtgttatgttaaaa
caaagaattttgtttaaaaagggtgcaataaagaaaggtataaatatcaatttagcaatg
aaaatatttgatttgatggaaaaattcgctgcatatggatttaataaatcacattctgct
gcatatgcattgatatcttatagaacattatggcttaaagctaattatcctgttgaattt
ttagtatctgtattgaatgctgaaattaataatactgataaattatcatttttaattaat
gaatgtaaatatttgcaaataaatatttgtagtcctaatataaatcttagtatgtataat
ttttttattgataaattcgggaatattgtttatggattaggagcaattaaaggtttaaat
aaagatctcatatatttaattgtaaataatagaataaaaaatggtaaatataacagttta
ttagatttttgtatacgaataaaaagtaaaaaattaaatattagtatgttaaaaaaatta
attttttcaggtgctttggatacaatagattcatctagatataatttattaaaaaattta
gaaaattcttttaaagtaactgaacaatatttaggttctcaatctgttggtcaaattgat
atgtttaatcttttaaaagaaaaattttcatatactaatgtttttaatacaaaatattta
ttaaattggtcagaagaatatgaatcaaataaagaaaaagagtctttaggtttttattta
ataaaacaccctattacaaaatattttaaagagattcgtaaatatactaataataataat
acattaaaagatctattatctatagatataaataataaaacaaataattttgttgttttt
ggtttagtaacttctgtaaaattttctaaaactaaatataataataaagttataattttt
acattagatgattcttttggaaatattgaaattgttttattagaaaaatatattaataag
tataaacatttaatattatgtaataatattctaattgtaaatataagagtaaaatttaat
ttttttagtagatatttaaatgttttagctaataatataatagatattatagaagcacgt
aataaatatttatctaaggttattatttatataccaaaaaaaaaaattaaaaatagtata
ttaaaattgttatgttattacttaaaaactttattacagggtaatttaactttatattta
tataaattaaaaaataatatttataaaaatgaaaaaaaattaataagaaaaatgaaacat
attgttcctagtaatgattttattaacaaagtagaatcattattgggaaaagaatatatt
gaattaaaattcaaataa

DBGET integrated database retrieval system