KEGG   Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_074
Entry
C9I82_074         CDS       T05580                                 
Name
(GenBank) Exodeoxyribonuclease V beta chain
  KO
K03582  exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
ppet  Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Pathway
ppet03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ppet00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    C9I82_074
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
    C9I82_074
Enzymes [BR:ppet01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     C9I82_074
DNA repair and recombination proteins [BR:ppet03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     C9I82_074
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 Viral_helicase1 PDDEXK_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXN02052
UniProt: A0A346DZ97
LinkDB
Position
87771..91238
AA seq 1155 aa
MHKLNIFNIPLKGKILIESSAGTGKTFTIIIIYIRLILGINTKYLYKKPLSVKKILILTY
TNYGSLEIKKKIYENINILLRSCIEKKCSNNILLKIFKKIKDFKTSIKILLKAKKQINNA
SIFTIHVFCKKILETYALELNIPFKYKLLKNKSILYEQSVINFWRKYFYKLEFNIVKYIV
YKIKTPKNLLKIISPWLNGKLPNFENIPIKKESILLKKFKEIIEIIKKIKKKWNKNKNKI
ISIILSLKVNKKIYNKKNLLIWFNKITNWVYDKNTIEFIPKILKYFRISIINKNKKITDI
KKYKIFYFIEELFNKKSSLYYHIISFAIIKTREIIKKEKVNKNLISFDDLINVINTSIKN
KNFKKISKKINKKYPVTIIDEFQDTDYNQYKIFDNIYNKKKKFTLLLVGDPKQAIYDFRN
ADIFSYIKITSKISKKFNLITNWRSSPRIVKSINKIFSIKDKPFVLDKIPFTKSKYNKIN
SNLSFILNKKKQPAIKIWYIENNELNYSNNKLSIAQKCAYEICSWLKYSKKNKSYIVNKI
KMSKPLCPSDITILVKNNKEAKIICKTFKKNNLQTFYLSNNNNIYSTNEAKEILLILKAT
INPENINILKNSLITNIINFNIFEISKIEKNKNLYYTFIKKFKSYYQIWKKFGIISLFNI
ILSDFNIIKNYNIIDNNEQKIINILHIGELLHKIYYETNNKNNIINYLEKKINNTEKTKK
NEQIRYNNIHNKIKVMTIHKSKGLEFPIVWIPFITNYNKINRNIYHNRNNFNKVLNLQKN
NKKLIEEEILSENIRKFYVALTRAIYNCNIVVILTNKKKETNINNQNELNYLINNKNELN
FKKYLINFQKIFSKNEINISYFKNKKNINYNEINFIKEKEKIYYLKHTLKNNSQINSFSS
IKKEELKNKKLYIKKNIKKNNILTPHNFPRGKYYGNFLHKLLENIDFNKPLNYNFINKKI
KNIELNKNWTPIIIDWLKNILNKQLNKKNICLSKIKKNKYKKELKFYIKIKKIITKNIFN
KMMCYYDNISLQSPKLKFNKLSGILTGSIDMIFNWQNKYYLIDYKSNWLGYSDKSYSYMK
LKNTIIQYRYDLQYNIYALALHKYLKQKMKNYKFEKNFGGIFYLFIRGINNNNKHGIFFK
KIKFNFVNEFNKFFK
NT seq 3468 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcacaaattaaatatatttaatattccattaaaaggaaaaattttaatagaatcatct
gctggtacgggaaaaacttttacaattattataatatatattagattaattttaggaata
aatacaaaatatttgtataaaaaaccactatcagtaaaaaaaattttaattttaacttat
acaaattatggaagtttagagattaaaaaaaaaatatacgaaaatataaatattttatta
agatcttgtattgaaaaaaaatgttcaaataatatattattaaaaatttttaaaaaaata
aaagattttaaaactagtataaaaatactactaaaagctaaaaaacaaataaataatgca
tcaattttcactatacatgttttttgcaaaaaaatactagaaacatacgcattagagtta
aatataccctttaaatataaattattaaaaaataaatctattctatacgaacaatcagta
ataaatttttggagaaaatatttttataaattggaatttaatatagttaaatatattgta
tacaaaattaagacacctaagaatttattaaaaataatttcaccctggctaaatggaaaa
cttccaaattttgaaaatataccaataaaaaaagaatcaatattattaaaaaaatttaaa
gaaataatagaaattattaaaaaaataaaaaaaaaatggaataaaaataaaaataaaata
atttcaataatattatctttaaaagtaaataaaaaaatatataataaaaaaaatctatta
atctggtttaataaaataacaaattgggtttatgataaaaacactatcgaatttatacct
aaaatattaaaatattttaggataagtataataaataaaaataaaaaaataacagatata
aaaaaatacaaaatattttattttattgaagaattatttaataaaaaatcttcattatac
tatcatataatatcatttgcaattataaaaacccgcgaaataataaaaaaagaaaaagta
aataaaaatttaatctcatttgatgatctaataaatgttattaacacatcaataaaaaat
aaaaattttaaaaaaatatcaaaaaaaattaataaaaaatacccagtaaccataattgat
gaatttcaagatactgattataatcaatataaaatatttgataatatatataataaaaaa
aaaaaatttactttattattagtaggtgatccaaaacaagcaatttatgattttagaaat
gcagatatattttcttatataaaaataacatctaaaatatctaaaaaatttaatttaata
acaaattggagatcttctccaagaatagttaaaagtattaataaaatattttcaataaag
gataaaccttttgtattagataaaataccttttacaaaatctaaatataataaaataaat
tcaaatttgtcatttatattaaataaaaagaaacaaccagcaataaaaatttggtatata
gaaaataatgaattaaattattctaataacaaattatcaatagcacaaaaatgtgcatat
gaaatatgctcgtggctaaaatatagtaaaaaaaataaatcctatatagtaaataaaata
aaaatgtccaaaccactatgtccatctgatataacaattttagtaaaaaacaataaagaa
gcaaaaataatatgtaaaacatttaaaaaaaataatttacaaacattttatttatctaat
aataataatatatactcaacaaatgaagctaaagaaatattattaatattaaaagcaaca
ataaatccagaaaacattaatatattaaaaaacagtcttataacaaacataataaatttt
aatatatttgaaataagtaaaatagaaaaaaataaaaatttatattatacgtttattaaa
aaatttaaatcttattatcaaatttggaaaaaattcggaataatatcattatttaacata
atattgtcggattttaatataattaaaaattataacatcattgataataatgaacaaaaa
ataataaatattttacatattggagaattattacataaaatttattatgaaactaataat
aaaaataatataattaattatcttgaaaaaaaaataaataataccgaaaaaacaaaaaaa
aatgaacagattagatataataacatacataataaaatcaaagtaatgactattcataaa
tctaaaggattagaatttccaattgtatggattccatttattacaaattataataaaatt
aatagaaatatttatcacaacagaaataactttaataaagtcttaaatttacaaaaaaat
aacaaaaaattaattgaagaagaaatattatcagaaaatattagaaaattttatgtagca
ttaacaagagctatatataattgtaatatagtagtaatattaacaaataaaaaaaaagaa
acaaatattaataatcaaaatgaattaaactatttaataaataataaaaatgaattaaat
tttaaaaaatatttaattaattttcaaaaaatattttcaaaaaatgaaattaatatttct
tatttcaaaaataaaaaaaatataaattacaatgaaataaactttataaaagaaaaagaa
aaaatatattatttaaaacacacattaaaaaataattcacaaataaatagtttttctagt
ataaaaaaagaagaattaaaaaataaaaaattatacataaaaaaaaatattaaaaaaaat
aatattttaactccccataattttcctagaggtaaatattatggaaattttttacataaa
ttattagaaaatatagattttaataaaccattaaattataatttcattaataaaaaaatt
aaaaacatagaattaaataaaaattggacaccaattattattgattggttaaaaaatata
ttaaataaacaattgaataaaaaaaatatatgtctatcaaaaataaaaaaaaataaatac
aaaaaagaattaaaattttatataaaaattaaaaaaattattacaaaaaatatatttaat
aaaatgatgtgctattacgataacatatctctacaatccccaaaattaaaatttaataaa
ttatcaggaatattaactggttctattgacatgatatttaattggcaaaataaatattac
ttgattgattataaatcaaattggttaggatacagcgataaatcatattcttacatgaaa
ttaaaaaatactattatacaatatagatatgatttacaatacaatatatatgcattagca
ttacataaatatttaaaacaaaaaatgaaaaactataaatttgaaaaaaattttggagga
atattttatttatttatcagaggtataaacaataataataaacatggtatattttttaaa
aaaataaaatttaattttgtaaatgaatttaataaattttttaaataa

DBGET integrated database retrieval system