Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_161
Help
Entry
C9I82_161 CDS
T05580
Name
(GenBank) GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
ppet
Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ppet03016
]
C9I82_161
Transfer RNA biogenesis [BR:
ppet03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
C9I82_161
Prokaryotic type
Methyltransferases
C9I82_161
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
RsgA_GTPase
Arf
Ras
Dynamin_N
Fervidolysin_NPro-like
SRPRB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXN02132
UniProt:
A0A346DZH7
LinkDB
All DBs
Position
complement(178988..180376)
Genome browser
AA seq
462 aa
AA seq
DB search
MENIFYIYLFMEFTDTILAQVTPVGKSGVAVLRVSGSYSKEVAFHLLNKIPKIRYAEYLP
FYDSGNKIIDQGIALFFSAPNSLTGEDILELQCHGSLVVIDLLIEHILSLSIVRMAEPGE
FLKRAFLNDKIDLIQAEAISDLINADSIKVARLAMNSFKGLFSNRVNIVMSKLKNIRVYI
EAHIDFLHDDYISLNFIDEINSLIDEINDIKHSSYDGSVLREGIKFVFSGFPNVGKSTLF
NLLSGNDISIVSDIPGTTRDILREYINIDHLSLHIVDTAGLNDSDDEIEKIGIDRAWIEL
KGADHIFFVIDNNIIKNKSLLFDYLSLIKNKTFSSIPITIVNNKIDLLNKSPCIESINSY
PIIYLSALTGNGICLLKKYIKNIIKTSRNIEGNFLARRRHLDILEKSLKYLNNAKYYLSS
NYSLELLAEELRNAYQILGRINGIFTSEELFNNIFSDFCIGK
NT seq
1389 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atagaaaatattttttatatttatttattcatggaatttacggatactattttagcacaa
gttactcctgtaggtaaaagtggtgtagcggtgttacgtgtctctggttcttatagtaag
gaagttgcttttcatttattaaataaaattcctaaaatacgttatgctgaatatttacct
ttttacgattctggaaataaaattattgatcaaggtatagcattatttttttcagctcct
aattctttaactggagaagatattttagaattacagtgtcatggtagtttagttgttata
gatttattgattgaacatatattatctttatctattgttagaatggcagagccaggtgaa
tttttgaaaagagcttttttaaatgataaaatagatttaattcaagctgaagctatttca
gatttaataaatgcagattctattaaagttgctagattagcaatgaattcttttaaaggt
ttattttctaatagagtaaatattgttatgtccaaattaaaaaatataagagtatatatt
gaagctcatattgattttttgcatgatgattatattagtctaaattttatagatgaaata
aatagtttaattgatgaaataaatgatataaaacattcttcgtatgatggtagtgtttta
cgtgaaggaattaaatttgttttttctgggtttccaaatgtaggtaaatctacattgttc
aatttattatcaggaaatgatatttctatagttagtgatattcctggtactactagagat
attttacgtgaatatattaatattgatcatttatcattacatattgttgatactgctggt
ttaaatgattctgatgatgaaatagaaaaaataggtattgatcgtgcttggattgaatta
aaaggtgcagatcatattttttttgttatagataataatatcattaaaaataagtcttta
ctttttgattatttatcactaataaaaaataaaacattttctagtataccaataactatt
gtaaataataaaattgatcttttaaataaatcaccatgtattgaaagtattaattcatat
ccaattatttatttatctgctttaactggtaatggtatttgtttattaaaaaaatatatt
aagaatattattaaaacatctaggaatattgaaggtaattttttagctaggcgtagacat
ttagatattttagaaaaatctcttaaatatttgaataatgcaaaatattatttatcaagt
aattattcattagaattattagctgaagaattacgtaatgcttatcaaatattaggtaga
attaatggtatttttacttctgaagaattatttaataatattttttctgatttttgtatt
ggtaaatag
DBGET
integrated database retrieval system