Candidatus Purcelliella pentastirinorum: C9I82_264
Help
Entry
C9I82_264 CDS
T05580
Name
(GenBank) Small-conductance mechanosensitive channel
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
ppet
Candidatus Purcelliella pentastirinorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ppet02000
]
C9I82_264
Transporters [BR:
ppet02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C9I82_264
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MS_channel_2nd
MscS_porin
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXN02230
UniProt:
A0A346DZS5
LinkDB
All DBs
Position
complement(272866..276135)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MFLNFLLFFIIFINVSVFADCTPNISYIKQKLEFVKISNNLPYKNELILTLQMTLNFLNE
RQYSIERINRYHQIITDFPNLKKILYRKIINISDINFFDNYTNLNDLNREIIQTNQQLLK
ENSIMERAQQKIQNINEFLLLFPKQLSKAKLFINKFDFYYHLDDQKVSFLSEAKNFANCA
KYSAQKALVNELDMAQLSANNRQELIHIKFELHKKKFDKLHGHLKILYSKLNKFIVFEIK
KVFSKIIKLIDDYNDKLSNFIKDYFVLNKKLFVSLNNQFKKLNIIFINQDVIHDKLFESR
QILFTIKEQSQWSNFSNVFNETLRSQVANLSKFFKLSQFDNELGEVRVQRLLYENLLNQS
KQDYNKNSKFFLKRYHDIFEIQFKIRKKILNYLIAGCDNYIIEIIKLKIITAKLQDISEE
IKESVHKYFYWTADANPIGINYFIDIYHSFIEFISADTFIQLVSAFLLMLSNIKTLFPIL
ISLLFILIKIINNKNYDKFLNYSSMCIDKVTKDHFSLTLYVTFLSILSALPTLCFCISLG
LGFQYAWSYPIAVALGNGIITMIPLLSVFMISAKFARFNGLFIVHFKWPLSRVNSAMKYY
FLTIGIMIPLMILLFTFNNLNEHFYYVTLGRFCFVLFCMILSFITYTLQRAGIFLYLNKK
GTGKSLFNKILWNIMICIPLLASLASCIGYFTTAQDLLIRVEISVFIWFLLLIIYYIIRR
WMLIQRRRIAFDRAKQRRTEILLHRIRNDEDTGEISSDNLEIDESLIDLDTISAQSLRLV
RSLLTLIALLSIIAIWFKIHSAFSFLENIKLWDISTSIQGIENLKPITLESLLIAILIFV
ITMQLVYNLPSLLELVILQHLNLTPGTSYAITTLTKYFILFVGGIIGFFIIGIEWSKFQW
LIAALGVGLGFGLQEIFANLISGLIILFEKPIRIGDTVTIRNLTGNVTCINTRATTITDW
DRKEIIMPNKAFVTEQFINWSLSDSVTRIVLYITVDVISNTKLVIDILKRSAFKCSYVIN
IPKPEAYLVDLQYGVQLFELRVHVAEMGHRMPLRNMLNYLILEEFKKNNISVPFVIFHIK
SYNFDMHYS
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtttttaaattttttattattttttattatttttattaatgtttcagtttttgctgat
tgtactccgaatatttcttatattaagcaaaaattagaatttgtaaaaatatctaataat
ttaccttataaaaatgaattaattttaacattacagatgacccttaatttcttaaatgaa
cgtcaatattctattgagcgtataaatagatatcatcaaataattactgattttcctaat
ttaaaaaaaatattatatcgtaaaattattaatatttctgatataaatttttttgataat
tatactaatttaaatgatttgaatcgtgaaattattcaaacaaaccaacagttgttaaaa
gaaaatagtattatggaacgtgcacagcaaaaaattcaaaatattaatgaatttttatta
ttatttcctaaacagttatctaaagcaaaattatttattaataagtttgatttttattat
catttggatgatcaaaaagttagttttttaagtgaggctaaaaattttgctaattgtgct
aagtattcggcacaaaaagctcttgtcaatgaattagatatggcacaattatctgctaat
aatcgtcaggaattaatacatattaaatttgaattacataaaaaaaaatttgataaatta
catggtcatttaaagatattatatagtaaacttaataagtttatagtatttgaaataaaa
aaagtatttagtaaaataataaaattaattgacgattataatgataaattatctaatttt
attaaagattattttgttttaaataaaaaattatttgtatccttaaataatcagtttaaa
aaattgaatataatttttattaatcaagatgttattcatgataaactttttgaatcacgt
cagatattatttaccataaaagaacaatctcaatggtctaatttttctaatgtatttaat
gaaactttaagaagtcaagttgctaatttatctaaattttttaaattatctcaatttgac
aatgaattaggtgaggtacgtgttcaacgtcttttatatgaaaatttattaaatcaatca
aaacaagattataataaaaatagtaagttttttttaaagagatatcacgatatttttgaa
attcaatttaaaattagaaaaaaaatacttaattatttgattgctggttgtgataattat
attattgaaataattaaattaaagataattacagctaaattacaagatatatcggaagaa
attaaggaatctgtacataaatatttttattggacagcggatgccaatccaattggtatt
aattattttatagatatttatcatagttttattgaatttatatctgctgatacatttatt
caattagttagtgcttttttattaatgttaagtaatattaaaactttatttccaatttta
atatctttattatttattttaataaaaattattaataataaaaattatgataagtttctt
aattattcttctatgtgtattgacaaggtaactaaagatcattttagtttaacattatat
gttacttttttatccatattatcagctttacctactttatgtttttgtatttctttaggg
ttaggttttcaatatgcttggtcatatcctattgcagttgctttaggtaacggtattatt
actatgataccattgttgtctgtttttatgattagtgctaaatttgctagatttaatggt
ttattcatagttcattttaaatggcctttatctagagttaatagtgccatgaaatattat
tttttaacaataggtataatgattcctttgatgattttattatttacctttaataatttg
aatgaacatttttattacgtaactttaggaaggttttgttttgttttattttgtatgatt
ttaagtttcattacttatactttacaacgtgctggtatttttttatatttgaataaaaaa
ggtacaggtaaaagtttatttaataaaatactttggaatatcatgatttgtatacccttg
ttagcttctttagcttcgtgtattggatattttacaacagcacaagatttgttaattaga
gtagagatttctgtttttatttggtttttgttgttaataatttattatattattcgtcgt
tggatgctaatacaaagaagacgaattgcttttgatagagctaaacaacgacgtactgaa
attttattgcatagaataagaaatgatgaagatactggtgagattagtagtgataatctt
gaaatagatgaatctttaatagatttggatacgattagtgctcaatctcttcgtttagtt
agatcattattgactttaattgcattactttctattattgctatttggtttaaaattcat
tcagcttttagttttttagagaatataaagttatgggatataagtacatccattcaaggt
atagagaatttaaagcctattacgttagaatccttattaattgctatattaatattcgtt
attactatgcagttagtttataatttaccttcattattagagttagttattcttcaacat
ttgaatttaactcctggaactagttatgcaattacaacgttaactaaatattttatttta
tttgttggaggaattataggattttttataattggtattgaatggtcgaaatttcaatgg
ttaattgcagctttaggtgtaggtttaggttttggtttacaagaaatatttgctaatctt
atatctggattaattattttatttgaaaaaccaattagaataggtgatactgtgactatt
cgtaatcttacaggaaatgttacttgtattaatactcgtgcaaccactattactgattgg
gatcgtaaagaaataataatgcctaataaagcttttgttacagaacaatttattaattgg
tctctttctgattctgttacaagaatagtcttatatataactgttgatgttatttctaat
actaaattagttatagatattttaaaaagatctgcgtttaagtgtagttatgtgataaat
attcctaaaccagaagcatatttagtggatttacaatatggtgttcagttatttgaatta
cgagtacatgttgctgaaatgggtcatagaatgcctttaagaaatatgttaaattatctt
attttagaagaatttaagaagaataatattagtgttccttttgttatatttcatattaaa
tcatataattttgatatgcattattcataa
DBGET
integrated database retrieval system
