Pectobacterium peruviense: DUT67_05100
Help
Entry
DUT67_05100 CDS
T10302
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
ppeu Pectobacterium peruviense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDF55772
LinkDB
All DBs
Position
1142467..1147356
Genome browser
AA seq
1629 aa
AA seq
DB search
MSQDKQDSLHQSSAAAEKKFSTDKIIQGGCKECECETFVQYVYSSGDPVPNAPFVLTDSK
GNKTDGQTDGSGYFKIQNMACNAYQLDIKEGSDDFDSPDTVENNPVLQANPAHAALAGEY
FTLYLLLHEKGIVEYDAEDSERYDEVNVDDSTLSGRFFSNVEDKYQLAYDRFQTLKKQIN
AGDREFKRAINKIHHSLSAEVADQTTETAVLLLCQIILGFIPVVGQAPDVYFIGEWCWAA
YKKPDNLEDNYFLAEGALNVVGVIPGPGHALKIAGKSVVRAMKALEKSALDNQAVQLAVR
EIRNLSNGNIVRWLMDFAEKINKEAKEAISLLNKIITAIELMVKNATSSAKSWIVAFAKD
SFSAICGVIKKLINKFKEIVDEIIQKVNTFIGKIITRKSGSAVGKGEATKPEIKVADKTP
LDVDGTPGHTSSTAGTADGKTCSTSNKCQGEGEPVDMATGYMVEWRTDFQLAGILPLAMK
RYYRSGGERKPGLLGSLWRSNWDMSLTLKEGVVTLIDGEFNQAIFVLPVEGECTRSPSNP
QWRLTRQQGRLILQDAGGLHYRFEHARGRELCLTSIEDRQDNQISLIWEFGVLRWVALPD
KRLIHVETRRQRITCLTLCDAHRNPLKKLANYIYDSRGHLLSVRADEGRNFDYRYSPEGW
LLRWSDLALTWVEHDYDKKGRVIRDRTSEGYWPGHFEYDDDTLTSRYYSGFGGVISYVRD
ERNNILLKRTPDGGETHFEWVDNQLVAETDPLGGRTTYQRNDWGLVTEVILPDGATHQCA
YDDNGDLLAYTDPLGSEWYYQRNATGQVMEVNDPEGREWLYSYGETGQLSTVIGPDGVLQ
RYHYNRRGLLSSLERDNAPPVTFRYDDLDRLTERHIGHEMGVQVRRWEYDGVRESPSKVV
YEDGSETQFGYDVEGNLTAVTDALGQRHQFRYGAFDNLLEATDPLGATVRYHYNAEAEFA
GVTNSQGRDWTYGFDHSGRLSEERHYDGRIYRYHYDVADRLVQRMAPDGSALHYEHDASG
RITRITARRADGETDGITELAYDVAGRLTKAVSPDAVVEYAYNRAGQVTSETVNGEAVQS
GYDAGGQRAIVDGILAPLQLAWQSGRLSSLGIGSHQPLQFSHTAAGEEQRRSNGSGFALR
HEWSPTGLLQRQALEGADGRVNDVLERRYQYDVLDRLTGITDSHWGEQAFRLNGAGQVTA
ERRDEGRRRQARLFGYDSEQNLCEVSQIAPGLGETLKVQDAVVQSSARYDAAGRVIERGH
TQYRYDDCGRLAMKRETRPGFRPKETYFDWDVQDRLVRVSLPDGARWRYRYDAFGRRVNK
VREGQVPSAQAVARVAYRWDGDQLIGQQQYRADGSAAREVQWVYEPGSFRPLAQVEAQGD
STQLHYIVTDLTGTARELCSEEGEIRWRGEQGLWGAHREERRPIPLRRYLGDAANEEVYC
ELRYQGQLYDAETGLYYNRHRYYDAESGQYLSPDPIGLRGGIHPQAYVHNPLEWIDPLGL
SKYPGVDFSGTDALYQGGENTVKIKMTGGRYGDFKAANDLAGYNGPSGKATGKAHPAGYT
WHHLDDYDPVTNESTMQLVKTEAHEKTFPHSGSVSQFEKHHGVEYESPEAKRIAKEMNKP
KPPKVCKQK
NT seq
4890 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaggacaagcaggattcattacaccaaagtagtgccgctgcggaaaaaaagttt
tcaacggataaaatcattcaaggggggtgtaaagaatgtgagtgtgaaacctttgttcaa
tatgtctactcgtcaggggatcctgtaccaaatgctccttttgttttaaccgatagcaaa
gggaataaaacggatgggcaaacggatggaagtgggtactttaaaatccaaaatatggcg
tgcaatgcttatcaacttgatattaaggaaggttcagatgattttgattcccctgatacc
gtagaaaataacccagtactccaagctaatcccgctcacgcagcattagctggagagtat
tttaccctttatttactattgcatgaaaaaggaattgtagagtacgacgctgaagacagc
gaacgttatgatgaagtgaatgttgatgatagtacattgagtggacgatttttttctaac
gttgaagataaatatcaactagcctatgaccgttttcaaacattaaaaaaacagattaat
gcgggtgatcgtgaatttaagcgggcaattaataaaattcatcatagcctgtcagcagaa
gttgccgatcagacaacagaaacagcggttttgctactttgtcaaattattctcggcttt
atcccagtggttggtcaggcacccgatgtttattttattggtgagtggtgctgggctgcc
tataaaaaaccagataacctggaggataactatttccttgctgagggtgcactgaatgtc
gtaggcgttattcctggccctggacatgctctaaaaattgcaggtaaatctgttgtccgt
gcaatgaaagcattagaaaaaagtgcgttggataatcaagccgttcaactggctgttcgt
gaaattagaaatctatctaatggtaatattgttcgatggttaatggattttgccgaaaaa
ataaataaagaagctaaagaagctataagtttgctcaataaaataattacggctattgag
ctgatggtaaaaaatgccacaagttcagcaaaaagttggattgttgcatttgcaaaagat
agtttttctgcaatttgtggtgttattaaaaagctcattaataaatttaaagaaattgtt
gatgagattatccagaaagttaatacgtttattgggaagattattaccagaaaatctgga
tcagcggtaggtaaaggggaggcgacaaagcctgaaattaaggtagcggataaaacgcca
ctagatgttgatggcactcccggccatacgtcatctaccgctggcaccgcagatggaaag
acctgctctacatcaaataagtgccaaggtgaaggtgaaccggtcgatatggccacggga
tatatggtggagtggcgtactgatttccaactagcaggtattttaccgctggcgatgaaa
cgctattaccggtctggtggtgagcggaaacctggtttattaggatcattatggcgtagt
aactgggatatgagcctgacacttaaagaaggtgtagtgactctgattgacggtgaattc
aatcaggcgatatttgttttgcctgttgagggagaatgtactcgttcaccgtctaacccg
cagtggagattgacccgccaacaggggcgtttgattctgcaagatgctggtggtttacac
tatcgctttgagcacgccagagggagggaattatgcctaacatccatagaggatcggcag
gataaccagatctcgctgatttgggagtttggcgtgttacgttgggttgctttgcctgac
aagcgcttgattcatgtggaaactcgtcgccaacgtattacttgtttaacgttatgcgat
gctcatcgcaaccctttgaaaaaattggctaactatatctacgacagtcgcgggcattta
ctgagcgtgcgggctgacgaagggcgcaactttgattatcgttattctcctgaaggctgg
ctgctgcgctggtcggatttagcgttgacttgggttgaacacgactacgataaaaaaggt
cgtgtaatacgtgatagaacctcggaaggctactggccggggcactttgaatatgatgat
gataccctaaccagccgttactatagcgggtttggtggagtgatcagctatgtgcgcgat
gagcgtaataatattctgttaaagcgtacaccagatggcggtgagacccatttcgagtgg
gtggacaaccaactggtggcggagaccgacccgctgggtggacgcacgacgtatcagcgc
aatgactggggactggtgactgaggttatcctgcctgatggtgccacgcaccaatgcgcg
tatgacgataacggagatcttctggcctataccgacccgctgggcagtgaatggtactac
cagcgtaatgcgaccgggcaggttatggaggtgaacgaccctgaaggtcgtgagtggctg
tattcttatggagaaacgggacagctatcgacggtgatagggccggacggtgtattgcag
cgttatcactataaccgccgtggcctgctgagcagccttgaacgggataatgcgccaccg
gtaacgttccggtatgacgaccttgaccgcctgacggagcgacatatcgggcatgagatg
ggcgtgcaggttcggcgctgggagtatgacggcgtgcgcgagtcaccgtcgaaagtggta
tacgaagacggcagcgagacgcagttcggttatgatgtggaaggtaacctgacggcagtg
acggatgcgctgggccagcgccaccagttccgctacggggcgttcgataacctgctggaa
gcaaccgacccgttgggcgcaaccgttcgctaccactacaatgcggaagcggagttcgcc
ggggtgacgaacagtcagggacgggactggacgtacggctttgaccacagcggacggctg
agtgaggagcggcattacgacggccggatatatcgctatcactacgatgtagcagaccgt
ctggtgcagcgaatggcaccggatggtagtgctcttcattatgaacatgatgcgtcaggg
cggataacgcgtatcacggcgcggagagcggacggggaaacggacggcatcaccgagctg
gcatatgatgttgccggtaggctgaccaaagccgtcagcccggatgcggtggtggaatac
gcctataaccgggcgggtcaggtgacgtcggagacggtcaacggcgaggcggtgcagagc
ggttacgacgcgggcggtcagcgtgccattgtcgacggtattctggcgccactgcagctg
gcatggcagtcggggcggctgtcgtcgctgggcatcggttcacaccagccgttgcagttc
agccacaccgcggcgggcgaagagcagcgacgcagtaacggcagcgggtttgcattacga
cacgagtggagcccgacggggctgctgcagcgtcaggcgctggaaggggcggacgggcgg
gtcaatgacgtgctggagcgtcgttatcagtacgatgtgctggaccgtttgacgggtatc
accgacagccactggggtgagcaggccttccggctgaacggggcgggtcaggtgacggcg
gagcgccgtgatgagggacgtcggcgtcaggcacggctatttggctacgacagcgaacag
aacctgtgcgaggtgtcgcagatagcgccgggtctgggtgagacgctgaaggtgcaggat
gcggtggtgcagtcgtcggcacggtacgatgcggcaggccgggtaatcgagcggggccat
acgcagtaccggtatgatgactgcgggcgtctggcgatgaaacgtgaaacgcgtccgggg
ttcaggccgaaggaaacgtacttcgactgggacgtacaggaccggctggtacgggtgagt
ctgccggacggcgcacggtggcgctaccgttacgatgcgtttggtcgcagagtcaacaag
gtgcgcgaggggcaggtgccgtcggcgcaggcggtagcgcgggtggcgtaccggtgggat
ggtgaccagctgattggtcagcagcagtaccgggcagacggctccgcggcgcgggaagtg
cagtgggtatacgagccgggaagcttccgaccactggcacaggtggaagcgcagggcgac
agcacacaactgcactacatcgtcactgacctgacagggaccgcgagagagctgtgcagc
gaggaaggggaaatccgctggcgcggcgaacagggtttgtggggtgcgcatcgtgaagag
cggcgacccatcccgctgcggcgctacctgggggatgcggcaaacgaggaggtgtactgt
gagctgcgctatcagggacagctgtacgatgcggaaacggggctttactacaaccggcat
cgttactatgatgcggagagcggacagtatctgtcaccggacccgatagggctaagaggt
ggcatccatcctcaagcgtatgtacacaatccgttggagtggatcgatcctttaggatta
tccaaatatcccggcgttgatttctctggtacagatgctctctatcaaggtggagaaaat
accgtcaaaattaaaatgactggcgggaggtatggcgacttcaaagctgcaaatgatctt
gctggatataatggtccttctggaaaagctacgggtaaagctcatcctgctgggtatact
tggcatcatcttgatgattatgatccagtcactaacgaatcaacaatgcaattggtaaaa
actgaagcgcatgaaaaaacattccctcattctggatctgtaagtcaatttgaaaagcat
catggcgtggaatatgaatcaccagaagctaaacgtattgctaaagaaatgaataagcct
aaaccacctaaggtttgcaaacagaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
