Pelodictyon phaeoclathratiforme: Ppha_0714
Help
Entry
Ppha_0714 CDS
T00731
Name
(GenBank) Cadherin
Organism
pph
Pelodictyon phaeoclathratiforme
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Cadherin
Integrin_beta
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACF43009
UniProt:
B4SE18
LinkDB
All DBs
Position
complement(740063..743467)
Genome browser
AA seq
1134 aa
AA seq
DB search
MVAGSLASWEYLASHTDLMTWLRADGVTDADSATATRHYIEHGISEGRTITFNAWEYLAS
NPDLMNWLRADGVTDADAITAAKHFIGYGYNEERTITFNAWEYLASNPDLMNWLRADGVT
DADAITAAKHFIGYGYDEERTITFDVWEYLASNPDLMNWLGADGITDADAITAAKHFIAY
GYNEGRTMIFDAAAYLASYEDLRNAFGNDTLAATIHYVTYGYREGRAVNNYHPTLTVDNA
IVTMAENHVSGAIIGADADATDADGNTITFSLVNAPANSSGNALFSIDAATGQINLTAAG
AASIDYESSIKSYTLQVMASDGVAAHNEIKTITLNLTNVDEIAPVITTAATQSVAENTIL
VAALTSTDVDSADTPAIFSITGGTNAALFEIVAGNLQFKAAPDYETGAHSYEVTVTATDG
TNSTAKTITVGITDVNDVTPVITTAAAQTVAENTTLVAALTSTDVDTAGTNPAIFSITGG
TDAALFEIVSGNLQFKAAPDYETDAHSYEVTVTATDGTNSTAKTITVNLTDIFENTGLLL
EGDSNDNRLTGGTGNDTLVGGNGNDILRGGAGTDSMDGGAGDDTFVIVGDLSGGGKVGSP
EDTVALGHPLSDLNGQDLNEDNNGAVETIVGGEGNDTLYVYGTADLSHYVISGIEHFEIR
SYVTFSQSFLDNLIATGGVTLTGDGSSTIVLTGGTAADPLIIDLTTTDAAILARIGQISL
GEHVILRINDLDQLGGARILTGSGTIEALSGSLDIPSTYILTDTLQVVNITLDNPEIMSV
INGEHRDLDNNGVFDTIFGTNDNDYIIGTAFDDTLDGLNGDDLLSGKEENDTFKINGSGE
KTIIDSGGDHDTLDLSGSVSGASVNLSDGGTAGSATIILGSGTTAITKQAIDLFLLQDIS
GSYGDDIANLKQIIATPDGLAEDIRNIQPDSFFGLGIFNPPSGTNPYYETLLPLSVDLNL
FKDAVNQLGIWGDEELLTAIRTVVDRAETAEIGYGRNALRILLISTDEPFYEDIPINIPQ
LAADMQAVDIYPVFLVTNDLVSYYEDFVVQLGVGDVVGMASNSSDILSAINSAFVNYKHD
FIENVKGTAYDDTLTGNSLDNHIDGGAGDDILKGLVGNDTIDGGKRSTINYSVI
NT seq
3405 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgctggctctcttgcaagttgggaataccttgcttcccacaccgatttaatgaca
tggcttcgtgctgatggcgtaacagacgctgactcggctacggcaacgaggcattacatt
gagcatggaattagcgaaggacgtaccataacctttaatgcatgggagtatcttgcctcc
aacccggacttgatgaattggcttcgtgctgatggcgtcaccgatgccgatgctatcact
gcggctaagcatttcattggatatggatataatgaggaacgtaccataacctttaatgca
tgggagtatcttgcctccaacccggacttgatgaattggcttcgtgctgatggcgtcacc
gatgccgatgccatcacggcagcgaagcatttcattggatatggatatgatgaagagcgt
accatcacctttgatgtatgggagtatcttgcctctaacccggacctgatgaattggctt
ggagctgatggcataactgatgctgatgccatcacggcagcgaagcatttcattgcatat
ggatataatgagggccgtacaatgattttcgatgctgcggcatatcttgcatcctatgaa
gatttgcggaatgcattcggaaatgatactcttgctgccacaatacattatgtgacatat
ggatatagggaaggtcgtgcagtaaataactaccacccaacacttaccgtcgacaatgcc
atagtcactatggctgaaaaccatgtttccggtgcaattatcggcgctgatgccgatgcg
accgatgcagatggcaacaccatcaccttcagcctggtaaatgcacctgccaatagcagc
ggtaacgcactgttcagcattgatgctgcaacaggccagataaaccttacagcagcagga
gctgcaagtatcgactatgaatcatctattaaaagctatacgttgcaggttatggccagc
gatggcgtcgccgctcacaatgaaataaaaaccatcacgctcaacctgaccaacgttgac
gagatcgcccctgttatcaccactgccgccacacaatctgtggctgaaaacacaatcctg
gtcgccgcactaacatcaaccgacgtcgattctgctgacacacctgcgatattcagcatc
accggtggcacaaacgcagcattgttcgagatcgttgccggaaacctccagttcaaggcc
gctcccgattacgaaaccggcgcccatagctatgaagtaactgtaactgctacagacggg
acaaacagcacagcaaaaaccattacagtcggcattactgacgttaatgacgtaacccct
gtcatcaccacagccgctgcccagacggtagctgaaaacacaactctggttgctgcactg
acatcaaccgacgtcgatactgcaggcacgaacccggcgatattcagcatcaccggtggc
acagacgcagcgttattcgagatcgtttcaggaaacctccagttcaaggccgctcccgat
tacgaaaccgacgcccacagctacgaagtaacggtaactgctaccgacggcacaaacagc
acagcaaaaaccattacagtcaacctgaccgatattttcgaaaatacaggtttactgctt
gaaggagacagtaatgataaccgacttaccggaggcaccggtaacgacacccttgttggc
ggtaatggcaatgatatcttgagaggcggcgccggaacagatagtatggatggtggcgct
ggtgacgatacctttgtcattgttggcgatctttctggcggcggaaaagtgggttcccct
gaagatactgtagcacttgggcaccccctttctgatctgaacggtcaggatctgaatgag
gataacaacggcgctgtggaaacgattgtcggtggagaaggaaacgatacgctttacgtc
tatggtactgccgatctttcccactatgtaatttccggcattgaacattttgagatacgc
tcttacgttacattcagccaaagctttcttgataacctgatcgcaacaggaggagtcacc
ttgaccggtgatggatccagtacgattgtcttgactggtggcactgcagccgatccactg
attattgatttaaccactacagatgcagctattcttgcgcgtatcggccaaatttcattg
ggtgagcatgttattctgagaatcaatgaccttgaccagttgggaggagcaaggattctt
actggatcaggcacaattgaagctctctcaggaagccttgatataccttcgacttatata
ctgacggataccttgcaggttgtgaatatcactcttgataatccggaaataatgtctgtt
atcaatggtgaacatagagacctggataacaatggagtattcgacacaatttttggtaca
aatgacaatgattacataattggtacagcgtttgatgatacccttgatggcttaaacggt
gatgatctattatcaggcaaagaggaaaacgacacattcaaaatcaacggtagtggtgaa
aaaacaattattgacagtggtggtgatcatgatacccttgatctttccgggtctgtttct
ggcgcctcggttaatttaagtgatggaggtactgccggcagtgctaccataattttaggc
agtggaacaaccgccattacaaaacaggcgatagatttattccttcttcaggatatttca
ggttcttatggcgacgatattgcaaatttgaaacaaattattgctactcctgatggattg
gctgaagatattcgcaatatacaaccagacagcttttttggtcttggtatcttcaatcct
ccaagtggaacaaatccatattatgaaacactgttgccgttatcagttgatcttaatcta
tttaaggatgcagtaaatcaacttggaatatggggtgatgaggagttgcttactgcaatc
aggacagttgttgatcgggcagaaactgctgaaataggatatggaagaaacgcactgcgg
attttgttgatttccaccgatgaaccattctatgaagatattccgataaatattccgcag
ttggctgctgatatgcaggcagttgacatctatcctgtttttcttgttacaaatgatttg
gtttcatattacgaagactttgtcgttcaactgggtgtcggtgatgtcgttggcatggca
tcaaacagcagcgatatcttgtcggcaattaacagcgcatttgtaaattacaaacatgac
tttatcgaaaatgtcaaaggcactgcctatgacgacacccttaccggaaacagccttgat
aaccacattgacggtggcgccggtgatgacatattgaaaggtcttgtcggaaatgacacc
attgatggcggtaagcgctcaacaataaattattccgtaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
