Pseudoalteromonas phenolica: PP2015_1499
Help
Entry
PP2015_1499 CDS
T04165
Name
(GenBank) Sensor protein
Organism
pphe
Pseudoalteromonas phenolica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
PAS_9
HATPase_c
PAS_3
HisKA
PAS
PAS_4
PAS_8
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO42003
UniProt:
A0A0S2K1U0
LinkDB
All DBs
Position
I:1718960..1722244
Genome browser
AA seq
1094 aa
AA seq
DB search
MQLDANKAFIVFVVMSLLLSVLISVMLVGREASSVLNGYKQQASETEAKLSAKYIENFLE
TRILLLKDLSSQPFIINGVMGSGVSEASLNDYLSEFKILGIKEKLWIYNVLGDYVYKNND
EQAVLETPSDWLEDLLNGELSHAVLLDHNQAQSYFKLAVPINYNGFTEGALIVKFQTPID
VLLSEVLESNTHGVKLSGPWLSYSNLSTLNKYDLVLESNLQSSGLKLSYLVDSTLVEKQV
NQVIISIATAIFVSLFLSSLFLFLVGQKLLLNPYRKLELSQQATKLSEERLNLAINGSLD
GIWDWDIKTGKVFCSERFRELLGYEPKDDFPEDYTVLERMVHNDDKEYVKSSLKAHLQQR
AIYDVQHRFMTKKGEFRVYRVKGDALFDKDNRAIRMAGSMTDVTEQIQAQQALKKAKEEN
DLLALSIDASNLGVTISSITDPEFPIVYINQAFTKITGYGEEILGQNCRFLQGEQTSEIA
VNKIRDALKNHDVVKVDLLNYKKNGQPFWNSLQLFPVHNEAGELTAYVGIQQDITDRVAS
EEALKEAKILAEQASIAKSEFLASMSHEIRTPMNGVLGMLNLLLNSDLNAEQQHRINVAM
SSANSLLTLINDILDFSKVDAGKLELEYLEFDLRGLLGDFAESAVIQAHNKRIELILDVT
KIDEAVVIGDPGRLRQILTNLVGNAIKFTSDGEVLIEASLIEFDSDYWRLNCNIKDTGIG
ISPEQQAKLFQSFSQVDASTTRKYGGTGLGLAIVKKLCQLMNGEVSVISQAGKGSCFSFS
VLLGKSNASFHVIPDVDMQALNILLVDDNKTNREVLKAQLEHWGASVFEARSGIEALTIS
EAYFDKRKKCFDIAFLDMQMPGMDGAKLGEHLKANEHLKAMKLIMMTSMCHKGDAKFFAN
LGFDGYFPKPATTFDLFAALSIVAEDGEALKDAKPLVTTHYIKSLKAQSALKPDQVAWGE
GIRILLAEDNRVNQIVAQSMLAKINLTHVDIAANGEEVIQNLLNTTRETKYTVILMDCQM
PEMDGYESSQAVRSGKAGELYKDIPIIAMTANAMVGDKDKCLEAGMDDYISKPIKPEVLF
ERLLQWLPYKEIES
NT seq
3285 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagctagatgcaaataaagcttttatcgtttttgtggtaatgagccttcttttatca
gtgttgattagcgttatgctagttggaagagaagcatcttcggttttaaatggttataaa
caacaagcttcagaaacagaggcaaaattaagtgcaaaatacatagaaaactttttagaa
acaagaattctattacttaaagatttgtcgagccaaccgtttattataaatggtgttatg
ggatctggcgtatctgaagcttctctcaacgactatttgtcagagtttaagattttaggc
attaaagaaaagctttggatatataatgtgcttggtgattatgtttacaaaaacaatgat
gaacaggcagttttagaaaccccaagtgattggctagaagacctactgaacggtgaactg
tcacacgcagtcttattagatcacaaccaagcacaatcgtacttcaaattagcagtacct
attaattataacggtttcactgaaggggctttaattgtaaagtttcaaacccccattgac
gtattattgtccgaagttcttgaatcaaatacccacggagtaaagctttctggcccatgg
ttaagctactcaaatctaagtacgttaaacaagtacgatttagtacttgaatcaaacctt
caaagctcaggtttaaagttgagttacctagttgattctacactggtagaaaaacaagta
aatcaagtgattattagcatcgctacggcaatttttgttagcttgtttttgtcctctcta
tttttatttctagttggtcaaaaactgcttttaaacccttacagaaaactcgaattatct
cagcaggccactaaattaagcgaggaaaggttaaaccttgctattaatggaagtttggat
ggtatttgggattgggatattaagacaggcaaagttttttgttctgagaggtttagagag
ctacttggttatgaaccaaaagatgactttcctgaggactatactgttcttgaaaggatg
gttcacaacgatgataaagagtatgtgaaaagtagcttaaaagcacatcttcaacaaaga
gctatttatgatgtacagcataggtttatgacaaagaagggggagtttagagtttatagg
gtgaaaggggatgcgttatttgataaagacaatagggcaatcagaatggccggttcaatg
acagatgtcacagagcagatccaagcacagcaagcattgaaaaaagctaaagaagaaaat
gatttactggctctttcaatcgatgccagtaatttaggtgttaccattagctctattaca
gatccagaatttccaattgtctatataaatcaagctttcacaaagataactggatatggt
gaagaaatattgggtcaaaattgtcgttttttacaaggtgaacaaacttcagagatcgca
gttaataaaatcagagatgctttaaaaaatcatgatgttgtaaaagtagatcttttaaat
tacaaaaaaaatggccagcccttttggaatagtttacagctttttccagtacataatgaa
gcaggagaattaactgcttatgtgggtattcaacaagacataacagacagagttgcatca
gaggaggcattaaaagaagctaaaattttggctgaacaggccagtatagcgaagagtgaa
tttttagcttctatgagtcatgaaattcgtacgcccatgaatggcgttcttggtatgctt
aacttgcttcttaatagtgacttaaatgctgagcaacaacacagaattaatgttgccatg
agcagtgctaattctttattaacgttgataaatgatattcttgatttttcaaaagtagat
gcaggtaagcttgaacttgaatatctagagtttgacttgagagggctgctaggtgatttt
gctgagtctgcagttattcaagctcataacaagcgcattgagcttattttagatgtcacg
aaaatagatgaagcagtggtcattggagatcctgggaggctaaggcagatcttaacaaat
ttagtgggtaatgcgattaaatttacctctgatggcgaagttttgatagaagcatcctta
attgaatttgattctgattactggcgactaaactgtaatattaaagatactggtataggt
atatctcccgagcagcaagctaaattgtttcaatcttttagtcaagttgatgcttcaacg
acgagaaaatacggaggaacagggcttggtcttgcaatcgttaaaaagctttgccagctt
atgaatggtgaggtctcggtcataagtcaagctggtaaagggtcttgttttagtttttct
gtcttacttggaaagagtaatgcatcatttcatgttattccagatgtcgatatgcaagca
ttaaatattttgcttgttgatgataataaaactaatcgagaagtattaaaggcacaatta
gagcattggggtgcctcagtttttgaggcgcgttcaggcattgaagctttgacaatcagt
gaagcttattttgataaaaggaaaaaatgctttgatattgcatttttagatatgcaaatg
ccaggcatggatggggcgaagttaggggagcatctaaaagcaaacgaacacttaaaagca
atgaaattaattatgatgacttcaatgtgtcacaaaggcgatgcgaagttttttgctaat
ttaggcttcgatggctattttccgaaacctgctaccacatttgatttatttgcagcacta
tcaatcgtcgcagaagatggtgaagcacttaaagacgctaagccattagtgacaacgcac
tatataaaatctttgaaagcacaatcagcgttaaagccagatcaagtagcatggggcgaa
ggcattcgtattttgttggctgaagataatcgagtgaatcaaattgtagcgcaaagtatg
ctcgctaaaataaatctgacgcatgtagatattgcagcaaatggtgaagaggtcattcag
aatctgttaaatacgactagagaaacaaaatataccgttatcttgatggattgtcagatg
cctgaaatggacggatatgaatcttcgcaagcggtaagaagcggaaaggctggtgaatta
tataaagatattccaataatcgcgatgacagcgaatgcaatggttggtgataaagataag
tgcttagaagccggtatggatgactatatttcaaaaccaataaagccagaggttttgttt
gaacgtttgttacaatggttgccttacaaagaaatagaatcttga
DBGET
integrated database retrieval system
