Candidatus Phytoplasma australasiaticum subsp. australasiaticum: H7685_000520
Help
Entry
H7685_000520 CDS
T09447
Name
(GenBank) PHP domain-containing protein
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pphs
Candidatus Phytoplasma australasiaticum subsp. australasiaticum
Pathway
pphs03030
DNA replication
pphs03430
Mismatch repair
pphs03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pphs00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
H7685_000520
03430 Mismatch repair
H7685_000520
03440 Homologous recombination
H7685_000520
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pphs03032
]
H7685_000520
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pphs03400
]
H7685_000520
Enzymes [BR:
pphs01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
H7685_000520
DNA replication proteins [BR:
pphs03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
H7685_000520
DNA repair and recombination proteins [BR:
pphs03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
H7685_000520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQV26828
LinkDB
All DBs
Position
117863..120592
Genome browser
AA seq
909 aa
AA seq
DB search
MIGVFYLQSFYSIKKSVHSVESLVKKAYESKYDFVALSDVENLYGMIQLMKFCREYKIKP
IIGVQIYIYFDLLKYRDIKISFLIYAFDNDGINNLIKILNFIQLNNKITVTDLQKFQDGI
FCILSNLDFILCDILKDEIMNLTIYENKTLFIFETLRFFQKNIKKLFFGFSLQSFLLQDY
AGFFLNIAKKLNLKVVLVNKTNYLVSEEKLIYQYLYKINDYQNNIKKFINPQQINEQITL
DVEFIDYKQIQERYQFYNINDFELFLDLEKFLPLIKYDISPPSTVCDFKHDLDCDNFKYL
QKKANNFLTYYLQKNINIKKHIFYIQQLQKELILIKKMNYVDFFLIVFDLIQYAKNQKIL
IGPGRGSSVGSLLCFCLGITEIDPVKYNLLFERFLNFQRTTVPDIDIDVPDDQVTRMIKY
LVDKYGIEHIANLITFQKYSKDSFLMDLKLINQNGIEINISHAKAICSRFASIIQGIPRL
VGTHPSGVIITKLDLSKHLPIKKNSNNSVILYRVQFDHKQLEQLGFIKLDLLNLRNLFLI
NKIVTLIEQTNQIKIDLSNIPLNDSNTYNILQKGDTNYIFQLESLSARKVIERLKPKTFE
DLVAVLSFNRPGAIKFVDLYIKNRINQESKFIDIEIVDNILCDTYGVVLYQEQMMRIASE
FAGYNLGQADLFMRQIMAKSSESVKINLKKSFITQSVLYQRTDEMASKVYDYIAKFSNYI
FNKSHGVAYALISYRMAYLKANYLLYFGIVYAEEYPDDYANIRTWLSQIKKYIKIQKPHI
LYSDVSNFRILNNQLFLPLNFIRDISLEICRTLIKERSIKKFENFDDFKIRLKNVLNKES
LQKFIFAGALDNVFALTRIQLLQNCDFNYIEHSQYLTNFRKKEFKDNYDQLILKKNFQNA
FKFKLDIID
NT seq
2730 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataggggttttttatttacaaagtttttatagcattaaaaaaagtgttcattcagtg
gaatctttggttaaaaaagcgtacgaaagtaaatatgattttgtagctttaagtgatgtc
gaaaacttgtacgggatgattcaattaatgaagttttgccgtgaatataaaattaaacct
attataggagtgcaaatttatatttattttgatcttttaaaatatcgtgatattaaaatt
agttttttaatttatgcttttgataatgatggcattaataatttaattaagattttaaac
tttattcaattaaataataaaataactgtaacggatcttcaaaaatttcaagatggtatt
ttttgcattttatctaatttagattttattttatgtgatattttaaaagatgaaattatg
aatttaaccatttatgaaaataaaactctttttatttttgaaactttgcgattttttcaa
aaaaatattaaaaaattattttttggattttcgttacaatcttttttattacaagattat
gcaggtttttttttaaatatagctaaaaaattaaatttaaaagtggttttagttaataaa
actaattatttagtttcggaagaaaaattaatttatcaatatttatataaaataaatgat
tatcaaaataatattaaaaaatttattaatcctcagcaaattaatgaacaaattactttg
gatgttgaatttattgactataaacaaattcaagaacgttatcaattttacaatattaat
gattttgaattatttcttgatttagaaaaatttttaccattaattaaatatgatatttcc
cctccctcaactgtatgcgattttaaacatgatttagattgcgataattttaaatattta
caaaaaaaagctaataattttttaacttattatttgcaaaaaaatataaatataaaaaaa
catattttttatattcaacaactacaaaaagaattaattttgattaaaaaaatgaattat
gttgatttttttttaattgtttttgatttaatacaatatgctaaaaatcaaaaaatttta
atagggcctggaagaggttcttcagttggttctttattatgtttttgtttaggaattact
gagattgatcctgtaaaatataatttgctttttgagagatttttaaattttcaacgaaca
actgttcctgatattgatatagatgtacctgatgatcaggttactagaatgattaaatat
cttgttgataaatatggaattgaacatatcgctaatttaattacttttcagaaatattct
aaagattcttttcttatggatttaaaattaattaaccaaaatggtattgaaatcaatata
tctcatgctaaagcgatttgttctcgatttgcttctattattcaaggtattccaagatta
gttggcactcatccttctggagtcattattactaaattagatttatctaaacatttacct
attaaaaaaaattctaataattctgttatattatatcgtgtgcaatttgatcataaacag
ttagaacaattaggttttattaaattagatttgttaaatttgcgaaatctttttttaatt
aataaaattgttactttaattgaacaaacaaatcaaatcaaaatagatttatcaaatata
ccgttaaatgattctaatacctataatatattacaaaaaggagataccaattatattttt
caattagaatctttatctgctaggaaagttattgaacgccttaaacctaaaacatttgaa
gatttggttgctgttttatcttttaatagacctggtgctataaaatttgtagatctttat
ataaaaaatagaataaatcaagaatcaaaatttattgatatagaaattgtagataatata
ttgtgtgatacttatggtgtggttttgtatcaagaacaaatgatgagaatagcttcagag
tttgcaggttataatttggggcaagcggatttatttatgagacagattatggctaaatct
tccgaatctgttaaaattaatttaaaaaaaagttttattactcaaagtgttttgtatcag
agaacagatgaaatggctagtaaagtttatgattatattgcaaaattttctaattatatt
tttaataaaagtcatggtgtagcatatgctttaataagttatagaatggcttatttaaaa
gctaattatttactttattttggtatagtttatgcagaagaatatccagatgattatgct
aatattcgaacgtggttatcacaaattaaaaaatatattaaaatacaaaaacctcatatt
ttatatagtgatgttagtaattttcgtattttaaataatcaactttttttacctttaaat
tttattagagatattagtttagaaatatgccgtactcttataaaagaacgttctataaaa
aaatttgaaaattttgatgattttaaaataagattaaaaaatgttttaaataaggaatcg
ttgcaaaaatttatttttgctggagcattagataatgtattcgctttaactcgtatacaa
ttattgcaaaattgcgattttaattatatagagcatagtcaatatttgactaattttcgt
aaaaaagaatttaaagataattatgatcaattaattttaaaaaaaaattttcaaaatgct
tttaaatttaaattagatattattgattaa
DBGET
integrated database retrieval system