KEGG   Candidatus Phytoplasma asiaticum: H7686_0000080
Entry
H7686_0000080     CDS       T09446                                 
Name
(GenBank) PHP domain-containing protein
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
pphy  Candidatus Phytoplasma asiaticum
Pathway
pphy03030  DNA replication
pphy03430  Mismatch repair
pphy03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pphy00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    H7686_0000080
   03430 Mismatch repair
    H7686_0000080
   03440 Homologous recombination
    H7686_0000080
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:pphy03032]
    H7686_0000080
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pphy03400]
    H7686_0000080
Enzymes [BR:pphy01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     H7686_0000080
DNA replication proteins [BR:pphy03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     H7686_0000080
DNA repair and recombination proteins [BR:pphy03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     H7686_0000080
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger Rv2179c-like HHH_6 DEDDh_C RNase_H_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQV27231
LinkDB
Position
18168..23903
AA seq 1911 aa
MKLYSKFIKFIKNKNIPNFPLIEVVVNDKQTNSWDCFFQIEEYPEETTHFECFEKEFQKF
FLKQLSEDLENFVQLQPTINVHFRILNWNLLKDDSIWKKHYQYMLDRFLIDPNIDKELVF
CFRKTPFIYIDRKKCLFVKDKHFYKKINDTKEYYNKLKEFQLKLSQLQDLMMRIYKFEFK
FELISTFEDLKKIEKLISSDCGPIEIKNLLGYVQHHVKYRDLKWNKIGFELVNPKNFLSN
LNFKVDFIVINHWLKTKKSQKLIDLLPEGVLVLITIKIVKKKYYNLEDLETFEILEQIPE
QKYLLSEIPFIDDANKDENEFKKKFELFVNKLRINRILIKCFVQYGEKDPKKTRFYLVDP
NSHQDSISIIEWSNYFNIDKKNFSLSDVPADSLILATISIKENSIKDKGLYFDLVRYCKL
KSKIKLDDYSGTKRIEFHTHTKMSNLDAITSAKDYIELAEKWGHEAIAFTDHDGLYAFPE
ISKYISNKNIKAIVGVELNFVEEKPIFITNQEINLNKFSNFFLKNYNYVVLDIETTGFSK
TRDRIISIAAVKIKNGKIVQYFNELINPGKDIKINDSIQELTNISNEILSKKPHIKEIFP
NFLDFITDFSDCALVAHNASFDIEFLQEVSKKIGLFWPVLPIIDTLALAQKHLNNLLKFF
SLEKIVQSLKIKLDSEGQYHNALFDAKATAFVFLKMLEILEKQQILNFYDLQGALDIKWE
RPYHVNVLVKNKKGYKNLFRLISDALTKDFLKKPRLLKSNFEKYREGLLIGSGCFDSNVF
NIALYKNDDELAQAISYYDYIEVQPPNAYRHIMHELNGSKKFENDNLYGRVIIQDIILKI
IKEAQRQNKIIIATGDVHYLYPYEKVLREVYINAKLIGGGIHRLSKYEDPHCLPDNYFLT
TKEMLNAFDFINDEQLKQDVVINNTHLLNQQIEKFQFFSNQLFNIPDNMFAKSLNISSIR
SEILNIINEKIFNLYGKLLHPSIKYRIEQELSVIAPKDNLEINNIAAIYYLSYLLVKKSN
EDGYPVGSRGSVGASLIANILGITEINPLPPHYRCVICKYTIMKMSITETLTFEYNNYFR
SWPFIVDIQQYQKKIKNIFSGYDLPKEKCPYCNQLFVKDGQDIPFETFLGFDGNKKPDID
LNFSGDYQNKIHNYLREMLGENCVFRVGTIQTVAKQNAYGYIKSFMEEKNVNIRKDEKER
RISMIEGVKRSTGQHPGGIVIIPGGISIYDVTPIQFPANDVSSQWKTTHFDYHALEKNLF
KLDILGHDDPTLIKFLMDDVLQNPSKFPFSRFQDIPVDDQQVYEIFANQDDCKISQAIPE
FGTDFVIKMLKDIYLQEKKFNFSNLVKVSGLSHGTGVWSGNAQKILFFHREYFEDYLKSK
GFGCLERYVPFDIPLDIANLIFQDRYLSIKNIVDDGFNDKMINRINTYFEDHIKQVIPDC
FEYGIYVFREEKISSINRLENTEFIKAFGILENHQDKIKDIIDLNIGYKQILDYHKIVEY
LNKIKNSGEELLNEILKKSNIENESQFLKEILNKLSEDITKSNCFQIEFFLNKNFEEILI
KNNISGNDPINDFNKFLNCFVKLSKKFLCDRILDIINIINLMKIHIKEFLVNNFQKIKES
LVNEVLKIKTSIKKDQDDIDKCQSKENLNNEYIRLFPFSLSVCKNMVLKGQCVVFDEIIF
CRDDILNYLISKGLEKSMAFEIMELVRKGKQNHDKQKWLYLSKKMRDHNVDDWYIESLQR
IQYLFPKPHAAAYVLMALRIAWFKVHAPLLFYKGYFSTRVSQFDYDNMILACDNLKKIID
EKSKKELTLVQKEKLHTLKIAKEMKDRGYNFLPIDLNKSEANLFVMELSSNSLIMPFITI
DGLGQVGANNIVKARGEKLFTQQDFEKRVKLNKTILKKFHDLNLIKQLPLE
NT seq 5736 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagctttattcaaaatttataaaatttattaaaaataaaaatattccaaattttcca
ttaatagaagttgtggttaatgataaacaaacgaatagttgggattgttttttccaaata
gaagaatatcctgaagaaactacacattttgaatgttttgaaaaagaatttcaaaaattt
tttttaaaacaattaagtgaagatttagaaaattttgtacaattacaacctacaattaat
gtgcattttcgtattctaaattggaatctgttaaaggatgattctatttggaaaaaacat
tatcaatatatgttagatagatttttgattgatccgaatatagataaagaattagtattt
tgttttcgtaaaactccttttatttatattgatcgtaaaaaatgtttatttgttaaagat
aaacatttttataaaaagataaatgatacaaaagaatattataataaattaaaagaattt
caattaaaattatctcaattacaagatttaatgatgcgaatatataaatttgaatttaaa
tttgaattaatttctacttttgaagatcttaaaaagatagaaaaattaatttcaagtgat
tgtggtccgattgaaattaaaaatttgttgggttatgtgcaacatcatgtgaaatatcgt
gatttaaaatggaataaaatcggatttgaattagtcaatcctaaaaattttttatcaaat
ttaaattttaaggtagattttatagtaattaatcactggttaaaaacaaagaaatctcaa
aaattaattgatttgttacccgaaggagttttagtattaattaccattaaaattgttaaa
aaaaaatattataatttagaagatttagaaacatttgaaattttagaacagattcctgaa
caaaaatatttgctttcagaaattccgtttattgatgatgcaaataaagatgaaaatgaa
tttaaaaagaaattcgaattattcgttaataaattgcgtataaatagaatattaataaaa
tgttttgtccaatatggagaaaaagatcctaaaaaaactcgattttatttagtagatcct
aatagtcatcaagattcaatttcgattattgaatggtcaaattattttaatattgataaa
aaaaattttagtttaagcgatgtacccgcggacagtttaatattagctacaatttcgatt
aaagaaaattctataaaagataaaggactttattttgatttagttcgttattgtaaatta
aaatcgaaaataaaattagatgattattcagggactaaacgtattgaatttcatactcat
actaaaatgtccaatttagatgctattactagtgctaaagattatatagaattagctgaa
aaatggggtcatgaagctattgcttttacagatcatgatggtttatatgcttttcccgaa
atttctaaatatatttctaataaaaatattaaagctattgtaggagtagaattgaatttt
gtcgaagaaaaaccaatttttattactaatcaagaaattaatttaaataaattttcgaat
ttttttttaaaaaattataattatgtggttttagatattgaaacaactggtttttctaaa
actagggaccggattatttctatagctgctgtaaaaattaaaaatggtaaaattgtccaa
tattttaatgaattaattaatcccggaaaagatataaagattaatgattctattcaggaa
ttaaccaatatttctaatgaaattttgtcaaaaaaacctcatattaaagaaatttttccg
aattttttagattttattacagatttttcggattgcgcattagtagctcataatgctagt
tttgatattgaatttttgcaagaagtatctaaaaaaattggtttattttggcctgtatta
cctattattgatactttggctttagctcaaaagcatttgaataatttgttaaaatttttt
tctttagaaaaaattgttcaatctttgaaaattaaacttgattcagaaggtcaatatcat
aatgctttattcgatgctaaagctactgcttttgtttttttaaaaatgttagaaatatta
gaaaaacaacaaatattaaatttttatgatttgcaaggtgctttggatattaaatgggaa
agaccttaccatgttaatgttttggtaaaaaataaaaaaggttataaaaatttatttcga
ttaatcagtgatgctttaactaaagattttttgaaaaaacctcgtttattaaaatctaat
tttgaaaaatatagagaaggattattaattggtagtggttgttttgatagtaatgttttt
aatattgctttatataaaaatgatgatgaattagctcaagctatttcatattatgattat
attgaggtacaaccacctaacgcatatcgtcatattatgcatgaattgaatggttctaaa
aaatttgaaaatgacaatttatacggtcgtgttataattcaagatattattttgaaaatt
attaaagaagctcaaagacaaaataaaattattattgcaacaggagatgttcattattta
tatccttacgaaaaagttttacgtgaagtttatattaatgcgaaattaattggtggcggt
atacaccgtctttcaaagtatgaagatccgcattgtttacctgataattattttttaact
actaaagaaatgttaaatgcttttgattttattaatgatgaacaattgaaacaagatgtt
gtaattaataatactcatttattaaatcaacaaatcgaaaaatttcaatttttttctaat
caactttttaatattcctgataatatgtttgctaagagtttaaatatttctagcattagg
tcagaaattcttaatatcattaatgaaaaaatttttaatttgtatggaaaattattacat
cctagtatcaaatataggattgaacaagaattatctgtaattgcacctaaagataatttg
gaaattaataatattgcagcaatatattatttatcttatttattggttaaaaaatctaat
gaagatggttatccagtaggctctcgtggttcagttggagcttctttaatagctaatatt
ttaggtattaccgaaattaatccattacctcctcattatcgttgtgttatttgcaaatat
actattatgaaaatgagcataactgaaacgttaacattcgaatataacaattattttcga
tcttggccttttattgtagatatacaacaatatcaaaaaaaaattaaaaatatattttct
ggttatgatttgccaaaagagaaatgtccttattgtaatcaactcttcgtgaaagatggt
caggatattccttttgaaacttttttaggttttgatggtaataaaaaaccagatattgat
ttaaatttttctggtgattatcaaaataaaattcataattatctaagagaaatgttaggg
gaaaattgtgtttttcgggttggaactattcaaacagttgctaaacaaaatgcttatggt
tatattaaatcttttatggaagaaaaaaatgttaatatccgcaaggacgaaaaagaacgt
agaatttcaatgattgaaggagttaaacgttctacaggtcaacatccgggtggaattgtt
attattcctggtggaatatctatatatgatgttactcctatacagtttcctgctaatgat
gtttcttcgcaatggaaaaccactcattttgattatcatgctttagaaaaaaatttattt
aagttggatattttgggccatgatgatcctactttgattaagtttttgatggatgatgtt
cttcaaaatccttctaaattcccttttagtagattccaagatattcctgtcgatgatcaa
caagtttatgaaatttttgctaatcaggatgattgtaaaatttctcaggcaattcctgaa
tttggtacagattttgttatcaagatgttaaaagacatttatttacaagaaaaaaaattt
aatttttctaatttagtgaaagtatcaggtttatcacatggtactggtgtttggtcaggt
aatgctcaaaaaatattgttttttcatcgtgagtattttgaagattatttaaaatccaag
ggttttggttgtttggaaaggtatgtaccttttgatattcctttggacattgctaattta
atttttcaagatcgatatttatctattaaaaatattgttgatgatggttttaatgataaa
atgataaatcgaattaatacttatttcgaagatcacattaaacaagtaattcctgattgt
tttgaatatggaatttatgtttttcgtgaagaaaaaatttcttcaattaatagattagaa
aacacggaatttataaaagcatttggtattttagaaaatcatcaggacaaaattaaagat
attattgatctaaatattggttataaacaaattttagattatcataagattgttgaatat
ttaaataaaattaaaaatagtggcgaggaattgttgaatgaaattttaaaaaaaagtaat
attgaaaatgagtcacaatttttaaaggaaattttaaacaaattaagcgaagatattacg
aaatcaaattgttttcaaatcgaattttttttaaacaaaaattttgaagaaattttaatt
aaaaataatattagcggtaatgatccaataaatgattttaacaaatttttaaattgtttt
gtaaaattatctaaaaaatttttatgtgatagaattttagatattataaatattataaat
ttaatgaaaattcacattaaagaatttttggtgaataattttcagaaaatcaaagagtca
cttgtaaatgaagttttgaaaatcaaaacttcaataaaaaaagatcaagacgatattgat
aaatgtcaatctaaagaaaatttgaataatgaatatattaggttatttcctttttcattg
tctgtttgcaagaatatggttttaaaaggtcaatgtgttgtttttgatgaaattattttt
tgtcgtgatgatattttaaattatttaatttctaaaggtttagaaaaatcaatggctttc
gaaattatggaattggttcgtaagggaaaacaaaatcatgataaacaaaaatggttatat
ttatctaaaaaaatgcgtgatcataatgtggatgattggtatatcgagtctttacaaaga
attcaatatctttttccaaaacctcatgctgctgcttatgttttaatggctttacgaata
gcttggtttaaggttcatgctcctttacttttttataaagggtatttttctactagagtg
tcgcaatttgattatgataatatgattttggcgtgtgataatttaaaaaaaattattgat
gaaaaatctaaaaaagaacttacattagttcaaaaagaaaaattgcatactttaaaaatt
gctaaagaaatgaaagatagaggttataattttttacctattgatttgaataaatccgaa
gctaatctatttgtgatggaattatcatccaattctttaattatgccttttattactatt
gatggtttaggtcaagtaggggccaataatattgtgaaagcacgtggtgaaaaattattt
acacaacaagattttgaaaaacgagttaaattgaataaaacaattttaaaaaaatttcat
gatttaaatttaattaaacaattacctttagaataa

DBGET integrated database retrieval system