Candidatus Phytoplasma asiaticum: H7686_0000200
Help
Entry
H7686_0000200 CDS
T09446
Symbol
thrS
Name
(GenBank) threonine--tRNA ligase
KO
K01868
threonyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.3
]
Organism
pphy
Candidatus Phytoplasma asiaticum
Pathway
pphy00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pphy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
H7686_0000200 (thrS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
pphy01007
]
H7686_0000200 (thrS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pphy03016
]
H7686_0000200 (thrS)
Enzymes [BR:
pphy01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.3 threonine---tRNA ligase
H7686_0000200 (thrS)
Amino acid related enzymes [BR:
pphy01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (C/G)
H7686_0000200 (thrS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
pphy03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
H7686_0000200 (thrS)
Prokaryotic type
H7686_0000200 (thrS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_2b
HGTP_anticodon
TGS
HGTP_anticodon2
DUF4639
tRNA_SAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQV27253
UniProt:
A0AAX3BA29
LinkDB
All DBs
Position
51414..53360
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MIEIEYQQNHQKKIFPNNITVSKIIISENLEFLNNSEKLPIAAYFNNKLVNLDKPLNEDG
VLNIITISDSIAWSILNNNTALIMAQAICRVYPNSLLVDKYINSEGFCYDIDPVNNIISE
KDFGIIEKTMINIMQEKLPITETELSVSEIRSLFKFNYYKIDSLQKIESSQKLFLYKKGN
FLDFCTEDQYLPNINLNRYFKILKISGVYWKGNKQNKVLTRIYGVAFFRKQDLANYLKTL
DERKKRDHKFINKEQNFFMFSSVVGTGLPFWLSKGATIRRIIERYIVDKEISYGYQHVYT
PVVANISLYKTSGHLQLYNEDMFPIMQLPDGEQLILRPMNCPHHMEIFRQKIHSYKDLPI
KIAELGLLHRYEPSGAVSGLQRVRAMSLNDAHIFIAPEQIKQEFVEIINLIKEVYQDFQI
RDYYFNLSTRDPNNKNKYFDDPDMWLNSEKILRDILNELDLKYQEKIGDAAFYGPKVDVQ
VLTALHHEITLSTIQLDFLLPKRFNLSYIDCNNQTKTPVVIHRAITSTIERFTAYLMEQH
KGFFPVWIAPVQVVIIPVNNELHLDYVKHLRKEMLRNHIRVELNNKDHTFNSKIRSAYQD
KIPFQVIIGEREIQNNTLHVRQYNKLEKRNMSMNEFLQMFQHAIKNKI
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaattgaatatcaacaaaatcatcaaaaaaaaatatttccaaataatattact
gttagtaaaattattatttctgaaaatttggaatttttaaataattctgaaaaattacca
atagcagcttattttaataataaattagtgaatctggataagcctttaaatgaagatggt
gtattaaatattatcacaatatccgatagtatagcttggtctattttaaataacaatact
gctttaattatggctcaggctatttgtcgtgtttatccaaattcattgttagtggataag
tatataaattcagaaggtttttgttatgatattgatccagttaataatataatttcagaa
aaagattttggtattattgaaaaaactatgattaatatcatgcaagaaaaattacctatt
actgaaacagaattatctgtttctgaaattcgaagtttatttaaatttaattattataaa
atagattctttgcaaaaaattgagtcttcgcaaaagttatttttatataaaaaaggtaat
tttttagatttttgcacagaagatcaatatttacctaatattaatcttaatcgttatttt
aaaattttaaaaatatctggagtttattggaaaggcaataaacaaaataaggttttaact
cgtatttatggggtagctttttttcgaaaacaggatttagctaattatttaaaaacttta
gatgaaagaaaaaaacgagatcataaatttattaataaagaacaaaatttttttatgttt
tcgtcagttgttggaactggattacctttttggttatctaaaggagcaaccattcgtcgt
attattgaaagatatattgttgataaagaaatatcatatggatatcaacacgtttatact
ccggttgtagctaatatctctttatataaaacatctggtcatttgcaattatacaatgaa
gatatgtttcccattatgcaattgccagatggggaacaattaattttacgacctatgaat
tgtcctcatcatatggaaatttttcgtcaaaaaatacatagttataaagatttgcctata
aaaatagctgaattaggtcttttgcatcgttatgaaccttctggagctgtgtcaggattg
caaagagtacgagctatgtctttaaatgatgcccatatttttattgcaccggaacaaatt
aaacaagaatttgttgaaattattaatttaattaaagaggtttatcaagattttcaaatt
cgagattattattttaatttaagtactcgtgatcctaataataaaaataaatattttgat
gatcccgatatgtggttaaattctgaaaaaattttaagagatattttaaacgaattagat
cttaaatatcaggaaaaaatcggtgatgctgctttttatggtcctaaagttgatgtgcaa
gttctaactgctttacatcatgaaatcactttatcaactattcaattagattttttattg
cctaaaagatttaatttatcttacatagattgtaataatcaaactaaaactcctgtagtt
attcatagagctatcacatctactatagaaagatttaccgcttatttaatggaacagcac
aagggctttttccctgtatggattgcacctgtacaagttgttattatcccggttaataat
gaattacaccttgattatgttaaacatttacgaaaagaaatgttacgaaatcatataaga
gtggaattaaataataaagatcacacctttaattctaaaattcgttctgcttatcaagac
aaaattccttttcaagttattattggtgaacgtgaaattcaaaataatactttacatgtt
cgtcaatataataaacttgaaaaacgtaatatgtctatgaatgagtttttacaaatgttt
caacatgcgattaaaaataaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
