Candidatus Phytoplasma asiaticum: H7686_0000465
Help
Entry
H7686_0000465 CDS
T09446
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
KO
K05592
ATP-dependent RNA helicase DeaD [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pphy
Candidatus Phytoplasma asiaticum
Pathway
pphy03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pphy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
H7686_0000465
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pphy03019
]
H7686_0000465
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pphy03009
]
H7686_0000465
Enzymes [BR:
pphy01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
H7686_0000465
Messenger RNA biogenesis [BR:
pphy03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
H7686_0000465
Ribosome biogenesis [BR:
pphy03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
H7686_0000465
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
DbpA
Cas3-like_C_2
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQV27296
UniProt:
A0AAX3B9E2
LinkDB
All DBs
Position
106055..107746
Genome browser
AA seq
563 aa
AA seq
DB search
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KKPHIIVATPGRILDLLKQQKIDLSHVKLLVLDEADEMLKMGFQEDVEDILKNIPSERQT
ALFSATMPDFIKKIAAKYQKNSQTLEISNKNIAVKSIKQFYFIVSDINKNLVLERLLDYQ
NPDSVIIFANTKKNVDNITDYLQTRNFLVDALHGDLKQNQRQYVLNNFRNKKIKILVATD
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ENKLIIISDDLGNYSNVNNKYKN
NT seq
1692 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tataagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
