KEGG   Candidatus Phytoplasma asiaticum: H7686_0000585
Entry
H7686_0000585     CDS       T09446                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
pphy  Candidatus Phytoplasma asiaticum
Pathway
pphy03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pphy00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    H7686_0000585 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pphy03021]
    H7686_0000585 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pphy03400]
    H7686_0000585 (rpoC)
Enzymes [BR:pphy01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     H7686_0000585 (rpoC)
Transcription machinery [BR:pphy03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     H7686_0000585 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:pphy03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      H7686_0000585 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 RNA_pol_A_CTD
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQV27317
UniProt: A0AAX3B9F5
LinkDB
Position
138324..142457
AA seq 1377 aa
MLNMKIEDFTLTKRTLKNLKSIGINSLNDINNYHLNELVSLLNEESFKEFVVILKKYGLP
ESLNNLNLNQEVLDILCQNNIFNCFSLLTTDKDVLLKLFSYNHSHQDLVMNILNLYNGSK
NNLNQKIDNSVADIEDIVVKNENNENESASSWIIDKAIFANNSNREYDYFKIRLSSPHEI
RQKSYGEVVNYETINYRTAKPEKGGLFCPIIFGPVQDLQCICSKKQTLKKGQICSKCGVE
ITEQLVRRERMGHIDLAAPVVHTWFLNSLPSRLAILLGMKAKELAEIVYYVSYIVINPGN
SDLTKYSIISELEYGQYLERCDNNFVALTGAEAVKTMLKELNMEETIQSLRLELKQASKQ
KRDLIVKRLELMESFYQSDNKPEWIVLEAINVIPPSLRPIVALEQGVRFASADINDLYRR
ILNRNNRLKRQLKQNAPRLIIKNEKRMLQEAVDALFDNAKSSKKSTSNIERNKPLKSLSE
MLRGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIIVGPDLKLHQCGIPRQMAIVLFKPFVLNKLQESK
GIDKKSANILYEKMNEHVWKLLEEVVQEHPVLLNRAPTLHRQGLQGFQVKLIDGKAIRLH
PLVTLAFNADFDGDQMAVYVPLSVEAQAEARLLMLSSYNILDPKNGSPVLSPSQDMVLGN
YYLTIEETRKRIIKGYNSDSRNEQHRYKHRNEGKVFNDLQEAELAFYNKQIALHTRILVR
VSNISSYFNDNQKNKYLVTTLGKLIFNSILPNDFPYLQEPTIFNLEIKTPDVYFIPKGVH
LNEYLNNIPTPEPFKKRFLSLIIDRVFKRSNISETSKMLDDIKNLGFKYSTMSGVTISHA
DINVYSKKDELIAQVENKIIEIEQWHDKGFLTTSEKKSLIIQEWKNVRNVIQEGLMQEFN
QDNHLFMISDSGARGNVSNFAQLSGMRGLMHSPTNNQLEIPVKSSFKEGLNVHEFFISTH
GARKVSTDTALKTAESGYLTRRLVDVAQDVIIMLNDCGSDKGVYVTSLEQDGKEIISLQQ
RLFGRYIAQSIVDPFNKQVIVNFGELITREIAENIVNIGCLSVKIRSVLTCNSDYGICAK
CYGLNLATNKAVEIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVLSVSDITQGLPRIQELF
EARKPKGKALISEYDGVIKEIKSSNLYSSDIVIVSAINPQQEYIYTVDSNVDILVNDGMA
IKAGQRLTSGSIDLRELLRISSVVNTQKYILEEVQQVYQSQSVYISDKHIEIIIRQMFKQ
ILVISEGDSNLLPGSEVSIKEFKRINMQLIKQNKKLAAGRPIVLGITRSSLKSDSLLSAA
SFQETTKILIDATIKGQKDFLLGLKENVILGGLIPAGTGILNHSLFEYPLTEEDKNK
NT seq 4134 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaatatgaaaattgaagattttactttaactaaaagaactttaaaaaatttaaaa
tctataggtattaatagtttaaatgatattaataattatcatttaaatgaattagtttct
ttattaaacgaagaatcttttaaagaatttgtagttattttaaaaaaatatggtcttcct
gaatctttaaataatttaaatttaaatcaagaggttttagatattttatgtcaaaataat
attttcaattgtttctctttattaacaactgataaagatgttttgcttaagttatttagt
tataatcattctcatcaggatcttgtaatgaatattttaaatttatataatggttcgaaa
aataatttgaatcagaaaattgataattctgttgcggatatagaagatatcgttgtgaaa
aatgagaataatgaaaatgaatctgcatcttcatggataattgataaggccatttttgca
aataatagcaatcgagaatatgattattttaagattcgtttatcttctcctcatgaaatt
cgtcaaaaatcttatggtgaagttgtaaattatgaaactattaattatcgtacggctaaa
ccggaaaaaggaggattattttgccccattatttttggtcctgttcaagatttacaatgt
atatgttctaaaaaacaaactttaaaaaaaggtcaaatttgttctaaatgtggtgtagaa
attacagaacaattagttagacgggaaagaatgggtcatattgatttagctgctcctgta
gttcacacatggtttttgaatagtttacctagtcgcttagctattttattaggaatgaaa
gctaaagaattggcagaaattgtttattatgtatcatatatagtgattaatcctggtaat
agtgatttaactaaatatagtattatatctgagttagaatatggtcaatatttggaacgt
tgtgataataattttgtcgctttaactggtgctgaagctgttaaaactatgttaaaagaa
ttgaatatggaagaaactattcagtcattaaggttagaattaaaacaagcatctaagcaa
aaaagagatttgattgttaaaagattagaattaatggaatctttttatcagtccgataat
aaaccagaatggattgttttagaagctattaatgtcattcctcctagtttaagacctata
gttgctttagaacaaggtgtacgttttgcttctgctgacattaatgatttatatcgcaga
attttaaatcgtaataatcgtttaaaaagacaattaaaacaaaatgctcctagattaatt
attaaaaatgaaaaaagaatgttacaagaagctgtagatgctttatttgataatgctaaa
tctagtaaaaaaagcacttctaatattgaacgtaataaacctttaaaatctttatcagaa
atgttaagaggtaaacaaggacgttttcgtcaaaatttattaggaaaaagggtagattat
tctggtcgttctgttattatcgtaggacctgatttaaaattacatcaatgcggtattcct
cggcaaatggctattgttttgtttaaacccttcgtattaaataaattacaagaatctaaa
ggtattgataaaaaaagtgctaatattttatacgaaaaaatgaacgaacatgtgtggaaa
ttattagaagaagttgtccaagaacatcctgttttattaaatagagcacctactttacat
cgtcaaggattgcaaggttttcaagttaaattaatcgatggtaaagctattagattacat
cctttagttactttagcttttaatgcagattttgatggagatcaaatggctgtttatgtt
cctctttctgtagaagctcaagctgaagctcgtttattaatgttatcttcttataatata
ttggatcctaaaaatggtagtccggttttatctccttctcaagatatggttttgggaaat
tattatttaactattgaagaaacacgcaaacgtattataaaaggttataattctgatagt
agaaacgaacaacatcgttataaacatcgtaatgaaggtaaagtttttaatgatttacaa
gaagctgaattagctttttataataaacaaatagctttacatactcgtattttagtgcgt
gtttctaatatttcttcttattttaatgataatcaaaaaaataaatatttagttactaca
ttaggtaaattgatttttaatagtattttgcctaatgattttccttatttgcaagaacct
actatatttaatttagaaataaaaacaccagatgtttattttatacctaaaggcgttcat
ttgaatgaatatttgaataatattcctactccggaaccttttaaaaaacgttttttgtcg
cttataattgatcgtgtttttaaaagaagtaatatttcggaaacatctaaaatgttagat
gatattaaaaatttaggttttaaatattcaactatgtcaggtgtaactatttctcacgca
gatattaatgtttattctaaaaaagatgaattaatagctcaagtagaaaataaaattata
gaaattgagcaatggcacgacaaaggatttttgaccactagcgaaaaaaaaagtttaatt
attcaagaatggaaaaatgttcgtaatgttatccaagaaggtttgatgcaagaatttaat
caagataatcatttatttatgataagtgatagtggtgctcgtggtaatgtttctaatttt
gcacaattatccggtatgagaggtttaatgcatagtcctactaataatcaattagaaatc
cctgttaaatcttcttttaaagaaggtttaaatgttcatgaattttttatttcgacgcat
ggagctagaaaggtttctactgatacagctttaaaaacggctgaatcaggatatttaact
cgtcgtttagttgatgttgctcaagatgtgattattatgttaaatgattgcggcagtgat
aaaggtgtttatgtaacttctttagagcaagatggtaaagagattatttcgttacaacaa
cgtttatttggtcgttatatagcgcaaagtattgtagatcctttcaataagcaagttata
gttaattttggtgaattgattactcgtgaaatagcggaaaatattgtaaacattggatgt
ttatcggtgaaaattagaagtgttttaacatgtaattctgattatggtatttgcgctaaa
tgttatggtttaaatttagccactaataaagcagttgagatcggagaagctgttggtatt
attgctgcccaatctattggcgaacctggtactcagttaactatgagaacatttcacaca
ggaggagttttatcggtttctgatattactcaaggattgccgcgtattcaagaattattt
gaagctcgtaagcccaaaggtaaagctttaataagcgaatatgatggtgtaattaaagaa
attaaatctagtaatctttattcatcagatattgttatagtttcagcaattaatcctcaa
caagaatatatttatactgtagattctaatgtagatattttagttaatgatggcatggct
ataaaagccggacaacgtttaacttctggttcaatagatttaagggaattattacgtatt
agttctgtagtaaatacacaaaaatatattttggaagaagtacagcaagtatatcaatct
caaagtgtttacattagtgataaacatattgaaattattattcgccaaatgtttaaacaa
attttagttatttctgaaggggatagtaatttattaccggggtctgaagtttctattaaa
gaatttaaaagaataaatatgcaattaattaaacaaaataaaaaattagcagctggacgt
cctatagttttgggtattacgagatcttctttaaaaagcgattctttattatctgcggca
tcttttcaagaaactactaaaattttaattgatgctacaattaaaggtcaaaaagatttt
ttattaggtttaaaagagaatgttattttaggcggtttaatacctgccggaaccggaatt
ttaaatcattctttattcgaatatcctttaacagaagaagataaaaataaataa

DBGET integrated database retrieval system