Paludibacter propionicigenes: Palpr_0866
Help
Entry
Palpr_0866 CDS
T01362
Name
(GenBank) cytochrome c assembly protein
Organism
ppn
Paludibacter propionicigenes
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
CcmC
SctB2
DUF4806
dsRBD2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ79018
UniProt:
E4T2S4
LinkDB
All DBs
Position
1049273..1052599
Genome browser
AA seq
1108 aa
AA seq
DB search
MKKLNNIFFSMVTSVILLVIFGASIGYATFAENSSGTEYAKSIVYNAKWFEILLFLLVIN
LLGSVVRYKIVNKRKFSVLLFHMAFICILIGAAVTRFFGYEGVMHIRQGETSNEITSDKP
SVAITAEYKGEKAEKTTHTSFTENGSENYAENLQIADKTIKVEKDLFIPNSVETIVSDEQ
GEAGISLFVMDQNNQGTDFILLNGETNNLGDISFSLNDSTRKAQVAFSVVDNQLYFKSTL
PMAKMGMMEKEEAMIMPGQLNPAEQKTIYKTGSLIFVLKTYLPKAKKSLTQMTPDMNKSG
VIRQGKNAIIFRVSDGNTTKTVNVLSSENQSSQLASCMLNGVKVTVDYGMLKRKLPFSIT
LREFQLDRYPGSNSPSSYASEITVTDKEMKTVQPFRIFMNNILNYRGYRFFQSSYDSDEK
GTILSVNHDYWGTLITYAGYLFMLIGMVLTLFNKNSRFRYILRLSNELQKKRKAAKTAAL
VAILILSGSMSAFAGETSKKTHIDALNSLLIQDEVQGRIEPISTYASDLVRKVTKKTTFN
GQSALEVLLRMCTDPSHWVNEPIIKVAHEGLAKELGAINDYITFNQLFDSENNGQYKLAD
KVEAAYQKDPSARNQYEKELINMDERVNICNRIFSGEILTIFPVQGHESNKWIAVSGLEP
TATAADSKMSGMSGMPAGVCPVSGKSGKTSMPATMPENGTKNSSDSTSASKCPMAGMTGT
TGTSMADMAMTSTENESGTPAKLLSAYFSAVLSAEKSGDWTEANSALLNLKNYQLLNGGA
QLPAKEKVQFEVLYNKLSIFLSLAILYGLLGIILISLHVINILKYNPKVDKYLDKSIYVF
AIMFVFYTAGLIMRWYISGHAPWSNGYESMIFVGWAASLSGLVFANRSPITLAITSLLSA
IALSVAGMSWMNPEITNLVPVLKSYWLVIHVAVITSSYGFFAMSALLGVFNLGLMIARTN
KNRIRLNESIQEFSYIIELSLIVGLFMLTVGTFLGGVWANESWGRYWGWDSKETWALVSI
LLYSSVIHLRNIPKANNVLVLNTLSVISFGSIVMTFFGVNYYLSGMHSYGQGTPPPIPVG
IYIAMVLLIALIGGAYYSEKKGSIKLIR
NT seq
3327 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacttaataatatcttcttctcgatggtcaccagcgttatcctgctggttatt
ttcggagccagcattggctatgctacttttgccgaaaacagttcaggcacagaatatgca
aaatcgattgtttataacgccaaatggttcgaaattctactgtttctactcgtaataaat
ctgctaggaagtgtcgtcagatacaaaattgtaaacaaacgtaagttcagcgttctgctt
tttcacatggcctttatttgtatattaatcggagctgccgtaacacggtttttcggctac
gaaggtgtgatgcacattcgtcagggtgaaacttccaacgaaattacctccgataaacca
tcagtagccataacagccgaatataaaggagaaaaagccgaaaaaacaacgcacacttcg
tttacagaaaacggctcggagaattacgctgaaaacctacaaatagccgataaaacaatc
aaggttgagaaagacttgtttattccaaattcggtagaaacaatcgtttccgatgagcaa
ggtgaagccggaatttcgttgtttgtgatggatcaaaataatcagggaacagattttata
ctgctcaatggcgaaacaaacaatctcggtgatatctcattctcgctcaacgattccacc
cgaaaagctcaggttgcgttttcggtagttgataatcaactctattttaaaagcacatta
cccatggctaaaatggggatgatggaaaaagaagaagcgatgatcatgcccggacaactg
aacccggcagaacaaaaaaccatttacaaaaccgggagtttaatattcgtcttaaaaaca
tacctcccaaaagcaaaaaagagtttgacgcaaatgacaccggatatgaacaaatcgggt
gtaattcgtcaggggaaaaatgctattatattcagggttagcgatggaaatacaactaaa
accgtaaatgtattaagctccgaaaatcaaagttcacaacttgcctcgtgcatgctaaac
ggtgtaaaagtgacagttgactacggaatgcttaaacgtaaacttcctttcagcattaca
cttcgtgaatttcagttagatcgttatccaggttctaacagtccatcgtcgtatgccagc
gaaatcaccgttaccgacaaagaaatgaaaaccgtacagcctttcagaattttcatgaat
aacattctaaactacagaggatatcgtttcttccaatcgtcttacgactctgacgagaaa
ggaaccattctttccgtcaaccacgattattggggaacgttaattacatacgccggctat
ttgtttatgcttataggtatggtgctgacattattcaacaaaaacagcagattcagatac
attctcagacttagcaacgaattgcagaaaaaacgtaaagccgcaaaaacagccgctttg
gttgcaatacttatcttatcgggttctatgtcggcttttgccggagagacctctaaaaaa
actcatatcgatgcattaaacagcttactcattcaggatgaagttcagggtcggattgaa
ccaatcagcacctacgcttcggatttggtacggaaggttacgaaaaaaacgacattcaat
ggtcagtcggcactggaagtgcttttgaggatgtgcaccgacccatcgcactgggtgaat
gagccgattataaaagtggctcatgaaggactggcaaaggagcttggagccattaatgat
tatattacatttaatcaactttttgattctgaaaacaacgggcaatacaagcttgccgat
aaagtagaagctgcctatcagaaagacccttcagcacgaaatcagtatgaaaaagaactg
attaatatggatgaacgggtaaatatatgcaaccggattttctcgggtgaaatactgact
attttcccggtgcagggacatgaaagtaataaatggatagctgtttccggattagagcca
actgctactgctgctgactctaaaatgtcgggaatgtcaggaatgcctgccggtgtttgc
cccgtgagtggaaaatcgggcaaaacatctatgcctgccactatgcctgaaaatggaact
aaaaattcatcggattcaacctctgcatcaaaatgtcctatggccgggatgaccggtaca
accggaacttcgatggcagatatggccatgacctcaaccgaaaatgaatcgggcacaccg
gctaaattactgtctgcgtatttcagtgctgtgttgtcagccgaaaaatcaggagattgg
actgaagcaaacagtgcgttactgaatctgaagaactatcagttattaaacggtggcgcg
caacttcctgcgaaagaaaaggttcagtttgaagtgttatacaacaagcttagtatcttc
ttatcgctggccatactgtatggcttgcttggaataattctgatttcgcttcacgttatc
aatatattgaaatacaatcctaaagttgataaatacctcgacaagagcatatacgtattt
gccattatgtttgtattttatactgccggattgattatgcgatggtacatttccggtcat
gcgccctggagcaacggttatgaatccatgatttttgtaggatgggctgcgtcgctttct
ggacttgtgtttgctaaccgatcgccgattacactggctataacatctttactatcggcc
atagcattatcggtagcaggtatgagctggatgaatcctgaaataactaatctggttccg
gtactgaagtcttattggctggtaatacacgtggctgttatcacctccagttacggattc
tttgccatgtctgctctgttgggagtatttaatttaggcttgatgatagcccgcacaaac
aaaaaccgaatcaggctgaatgaaagtattcaggagtttagttatatcattgaactatca
ctcattgtcggactatttatgcttactgtgggtacattcctcgggggtgtttgggccaac
gaatcgtggggaagatactggggctgggactcaaaagaaacatgggctttggtcagcata
ttgctgtattcgtctgtaatacatttacgcaacatccctaaagcaaataatgttctggta
ttaaacacgctctccgtaataagctttggaagtattgttatgacgttctttggggtcaac
tactatctgtcgggcatgcactcttacggacaaggtaccccacctcctattccggtagga
atctacattgcaatggtgcttctcattgctttaataggtggtgcttattattccgaaaaa
aagggaagcataaaattaattagataa
DBGET
integrated database retrieval system
