Paludibacter propionicigenes: Palpr_2166
Help
Entry
Palpr_2166 CDS
T01362
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase
Organism
ppn
Paludibacter propionicigenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_9
PAS_8
PAS
PAS_4
HATPase_c
PAS_3
HisKA
HATPase_c_5
Sgf11_N
DUF4209
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ80302
UniProt:
E4T6F8
LinkDB
All DBs
Position
2633548..2636973
Genome browser
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MKKQMHANSITIAEANHDLLVNGILNSITNAFFSVDFEYRYTGYNELHVRRMKELYNVDV
KLGDKLSDYQTLQIDWLKAKSFIDKALAGETFTEYVYLGYSGSKQLYSEVSHSPILNRKN
EVIGVSIFSKDVTERKAIEDALKASELKYRGLVDNSPNAIAIYCDEKVVFVNNACFKLIG
ATTRNELIDKQVLDFIHPEFKELAASRMKEASINHKVLPLINERLIKLDGSYVDVGVKSI
PIEFDGKHAVQLIIHDLTELRQAEEKIRETEILFSQAFNASPAAMSIANQKNGSYIAVNE
SFLLIAELHREDVIGKTPEELNLIDKDTRQKLKAQLIENGILTDVEVQAKSASGKPLVLM
FSVQITELAGERCILSTMQDITERKKIEQALRESEEKFKKAFMTSPDCLNINRLDNGTYV
LANEGFTKILGYTENEIIGRTSLEMNIWLNPAERDNWIKILFEDRKVDNFVTQFRTKTGE
LIYALVSAAIIELDGIPHVLSLTRDITKQKLVENSLRSSEEKYRSLFENNTSVMLLINPE
TAEIVDANPTACEFYGWTYDEICTKKITDINILPSDEIFNVMKDAKLKGRKHFHFVHRKA
NGELRDIEAFSTPIKDGDKNFLFTIIHDITSRVRAQKALNESEEKFKKAFTTSPDSVSIN
RLEDGVYVSVNDGFTRIMGYDRDEILGQSSIDKNVWVDANDRKKMVNEVKEKGFIENLVA
QFRTKSGKLVYGMMSASIIELDGVKHVLNITRDIDKLKQAEKALQESEEKLSTLFSSMTE
MVAMHELVFDEDGNVINYQITDCNNAYCQIFGIKKEDVIGKLATEFYHCESAPYLELYSK
VGITGESYEFNTFYAPAGRHFLISAVSTKKNCFSTIASDITDIQRIQELITDKNKELENY
LYVASHDLRSPLINIQGFSQRLQKQSEDIKAILADSKSESEKKAEIDKITNEGMPKTVDF
ILSNVSKMDTLIKSLLQISRSGRLMLNVNKIDMNQLINKIIAAHNYQITELSAQVIIQNL
DYCYGDENQLNQLFSNIIDNALKYHDPNRLLKIEISSEVQYKKVRYAISDTGIGISSHSF
EKIWDVFYRVDAKSSQVGEGIGLSIAKRIASKHNGKIWVESVEGKGSTFFIELQKQDFLE
L
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacagatgcatgcaaactcaattactattgcagaagcaaaccatgacttatta
gtcaatggaattcttaatagtatcaccaatgcttttttctcggttgactttgaataccgt
tacaccggttataatgagttacatgtcaggcgcatgaaggagctatacaatgttgatgta
aagttaggagataaattatccgattatcaaaccctacagattgattggcttaaagcaaaa
tcatttattgacaaggctttagctggtgaaacatttacggagtatgtttatttaggatat
tcgggatcaaagcagctttattctgaagtttcgcacagtccgattctgaaccgtaagaat
gaagtgattggagtgtcgatattttccaaagatgtaactgaacgaaaagcaatagaagat
gcattaaaggcaagcgagctgaaatacagaggcttggtggataactctccgaatgctatt
gcaatttactgtgacgaaaaggttgtatttgtaaacaatgcatgtttcaaattaatagga
gctacaaccagaaatgagctgattgataaacaggtacttgattttatacatcctgaattt
aaagaactggccgcaagccgcatgaaagaggcatccataaaccataaggttttacctttg
ataaatgagaggcttataaaactggatggctcttatgtagatgtaggagtaaaatcgata
cccattgaatttgatggtaaacatgctgtacaattaataattcatgatcttacggagcta
agacaagctgaagaaaaaatcagggaaacggagattctgttttcacaggcatttaatgca
agtcctgcggcaatgagcattgctaaccaaaaaaatggatcttacattgctgtaaatgaa
agtttccttcttattgcggaattacatagagaggatgtaatcgggaaaacccccgaagaa
cttaatttaattgacaaagataccagacaaaagttgaaagctcagttgatagagaatggt
atattaaccgatgttgaggttcaggcgaaatcggcatcagggaagccactggtactaatg
ttttctgtacaaattacagaactagccggagaacgttgcatcttatcaactatgcaagat
attactgagcgaaagaagatagaacaggctttgcgtgagagtgaagaaaaatttaaaaag
gcatttatgacaagtccggactgtttgaatatcaacaggctggataatggaacatacgtt
ttggctaatgaaggatttacaaagattttaggatatacagaaaatgaaatcataggtagg
acttctttagaaatgaatatttggctcaatccagcagagagggacaattggattaaaata
ttatttgaagataggaaagtggataactttgtgactcaatttaggactaagaccggggaa
ttaatttatgcgctggtatcagctgctatcattgagttggacggaattcctcatgtactt
agccttacacgagatattacgaaacaaaaacttgtagaaaatagtcttcgttccagtgaa
gaaaagtatcgctcattgttcgaaaataatacttcagtcatgttgttgataaatccagaa
acagcagaaattgtagatgcaaatcctacggcctgtgagttttacggctggacttatgat
gagatctgtacgaaaaagataaccgatataaatatacttccttccgatgaaatttttaat
gtaatgaaagatgcgaagttgaaaggacggaaacattttcactttgttcatcgaaaagct
aatggggaactacgtgatatagaagctttttctacaccaataaaggatggagataaaaat
tttctgtttacgataatacatgatattaccagtcgggtcagagcgcaaaaggctctgaat
gaaagcgaagagaaatttaagaaggcatttacaacaagtccggattcagtaagtattaat
cgattggaagatggtgtttatgtttcagtaaatgatggatttacgcgcatcatgggatat
gatagagatgaaatactgggacaatcatctatcgataagaatgtatgggtggatgctaat
gaccgtaaaaaaatggtcaatgaagtaaaagaaaaggggtttattgaaaatcttgtagcg
cagttcagaacaaaaagcggtaaacttgtgtacggtatgatgtctgcttctattatagaa
ttagatggagttaaacatgttctaaacatcacacgagatattgataaactaaagcaagcc
gaaaaggccctgcaagaaagcgaagaaaaactcagtacgctttttagctctatgacagaa
atggtggctatgcacgaacttgtatttgatgaggatggaaatgtaattaattaccagata
acagattgtaataatgcttactgccaaatttttggaataaaaaaagaagatgtaatcgga
aaactggcaacggagttttatcattgcgaatcggcaccatatctggaactatacagtaag
gttggaatcacgggcgagtcgtatgaattcaatactttctatgctcctgcagggaggcat
ttcttaatctcagcggtctcaacaaagaaaaactgtttttctaccattgcatcagacata
actgatattcaaagaattcaggagctgattaccgataagaataaggagcttgaaaactac
ctttatgtggcttcgcacgatttaagatctccattgataaatatacaaggatttagccag
cgattacaaaagcaatctgaagatataaaagccatactggcggactcaaaatcagaatcg
gaaaagaaggccgaaatcgataaaataacaaatgaaggaatgcccaaaacagtggacttt
atattgtctaatgtttctaaaatggatacgctcattaagagcctgttgcagatatcgagg
agtggacggctaatgctgaatgtgaataaaatagatatgaatcagctaattaataaaatt
attgctgctcataactatcaaatcacagaactttcggcccaagttattattcagaacctt
gactattgctatggagatgaaaatcaattgaatcagcttttttcaaatattattgataat
gctctgaaatatcacgatccgaacagactgttgaaaattgaaatatcgtcagaggttcaa
tacaaaaaagttcgatatgcaatttctgataccgggattggaataagctctcacagtttt
gaaaaaatctgggatgttttttaccgtgttgatgcaaagtcttctcaagtgggtgaagga
attggattgagtattgctaaaagaattgccagtaaacacaatggcaagatttgggtagaa
tctgttgaaggaaaaggtagtacattctttatagaattgcaaaaacaagatttcttagaa
ctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
