Photobacterium profundum: PBPRB1024
Help
Entry
PBPRB1024 CDS
T00173
Symbol
BB3850
Name
(GenBank) putative transporter, BCCT family
KO
K03451
betaine/carnitine transporter, BCCT family
Organism
ppr
Photobacterium profundum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ppr00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
PBPRB1024 (BB3850)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAG22896
UniProt:
Q6LII4
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1167279..1168883)
Genome browser
AA seq
534 aa
AA seq
DB search
MGFKSKKYSIDSTDYQVGQDNISKWGMDVHNTVFVASLGLSILFIVTLLALPPADAKAAI
DSIKGAVLSNFDFLFMWGANILLIFAIIIAFSPLGKIRLGGEGATPDYSKASWISMLFAA
GMGIGLIFWGVAEPTAFFTNWFGTPLNVEPFTEAGRELALGATVFHWGLHAWAIYGMTAL
CLAYFVYNKGLPLSMRSVFYPLLGDRVWGKTGDVIDILTVLVTLFGLATSLGLGGTQAAS
GISHVFGMENNIYLQQSIIVLIMGLAIISVLRGMDGGVKFLSNLNMVIAFIFLGLIAVLN
FTTVLDSLVTAVTGYVKNIIPLSQTSGRDDTTWLHGWTVFYWAWWVAYAPFFGMFVARIS
RGRTVREFLLCVMLIPTMVTTAWMSIFGGVAIQQVIDKVGKLGVDQGITDVSLSLFHMLD
AYPFGDILSFIAVALIIVFFVTTLDSGSIVIDGMTAGGKLEVPVKQKVVWAVISGVIAMV
MLWIGGTQSIQALQSITIIAAMPFTIILLLGSVSLFKGLLTEVNKPQVSTNQVK
NT seq
1605 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttttaaatcaaaaaagtacagtattgattctactgattatcaagttggtcaagat
aacatcagtaaatggggcatggatgtccataacacagttttcgtagcctcactcggctta
tctattctcttcattgtcacccttctcgcattaccgccagcagatgcaaaagcagctatt
gattccattaaaggcgctgtattgtcaaattttgacttcctctttatgtggggagccaac
atattattaatctttgccattattatagcgttttcacctttaggtaaaattcgcttaggc
ggggaaggagcgactcctgattattcgaaagcctcttggatttcaatgttattcgctgca
ggtatgggcattggacttattttttggggtgttgctgaaccaaccgcgttctttactaac
tggtttggaactccgcttaatgtagaaccttttacagaggctgggcgtgaactggcatta
ggcgcaaccgtcttccattggggcttacatgcatgggctatctatggcatgacagcactt
tgccttgcctattttgtttacaataaagggttgccactctcaatgcgctctgtgttttac
ccattattaggcgatcgagtttgggggaaaacaggtgatgtgattgatatcttaacggta
ttggttactttgtttggtctagcaacgtctcttggtttagggggcacacaggcggctagt
ggtatcagccatgttttcggaatggaaaataatatctaccttcaacagtccattatcgta
ttgattatgggcttagccattatttctgttctgcgtggtatggatggcggggttaagttt
ctaagcaacctaaatatggttatcgcatttatattccttggccttattgctgttttgaat
ttcactacagtattggattccttagtaaccgctgtaacgggttatgtaaaaaacattatt
ccgttaagccaaacctcgggtcgtgatgatacaacgtggttgcatggttggactgtgttc
tattgggcgtggtgggttgcgtatgcacctttctttggtatgtttgtagctcgtatatct
agaggacgcaccgttcgcgaattccttctttgtgtaatgcttattcctacaatggtaaca
acggcttggatgtcaatcttcggtggcgttgctattcaacaagtaatagataaagttggg
aagttaggtgtagatcaagggattaccgatgtctctctaagcttgttccatatgctagat
gcttacccgttcggggatattctatcctttattgctgtagcactgattatcgttttcttt
gtgacaacattagattcgggttctattgttattgatggcatgactgcgggtggtaagtta
gaagtacccgttaagcagaaagtagtttgggctgttatctctggtgttatcgcaatggtt
atgttgtggattggtggcactcaatctattcaagctctgcaatcaatcaccattattgca
gcaatgccgtttactattattcttctgttgggcagtgtgagcctgtttaaagggctgttg
acggaagttaataaacctcaggtatcgactaaccaagttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system