Poeciliopsis prolifica (blackstripe livebearer): 129363207
Help
Entry
129363207 CDS
T09758
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
pprl
Poeciliopsis prolifica (blackstripe livebearer)
Pathway
pprl04330
Notch signaling pathway
pprl04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pprl00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
129363207 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
129363207 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
NODP
NOD
EGF_3
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129363207
NCBI-ProteinID:
XP_054891125
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2470 aa
AA seq
DB search
MEGNMQWIIFSLLLCFHVGEGFRCVDKNRPCQNGATCIDSPSRCICRPGFIGPFCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSDVVNDIPQYKCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGYQGKNCRSDIDECRKPGACLNGGLCRNSVGSFRCQCPLGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGLCVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGEDCSENIDDCAKAI
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTFCEIDIDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDVDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGRLCDINVNNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCSCDPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDRVNKYLCQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCIDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCREDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCSPSPCQ
NAGTCIDKLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNNNECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCFPNPCANHAVCTHTPDYLGYQCNCQPGWQGQLCNIDMNECISNPCKNRGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLTCETDINDCFPNPCLSGGSCTDGVNSFHCSCLPGFTGPRCA
LEINECQSFPCKNGGTCTDYVNSYTCSCPPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYACTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGTCQDALQSFRCSCSKGFEGTRCQTPVDWC
RRMSLCQNGGRCRQKDAFFSCDCPNGWSGRYCDIPNMSCETAARKRGIQTDELCHHGGHC
VNSGNTHICKCPADYTGSYCEIQVDQCEDKPCRNGATCRSYVGGYQCDCMPGYTGQTCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPPLRLRGAPLKCLNNG
TCVDRVGGHRCNCPPGFTGDRCEGDINECLSNPCSSTNSLDCIQLSNDYLCVCKPGFTGR
RCQNRFSVCESQPCHNGGACSVTSSAPLGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCQELSCYNGGSC
ALTKRGTRCVCLTGYGGPQCQHRSNDGCSSKPCQNGGLCTEETSLPFFHCQCPSGFMGTR
CEKSKSELPSLSCPRADCQNKANDGLCDKECNTLPCRWDGGDCSLAVNPWAHCTDPRCWR
AFNNSQCEEFCNNPQCLYDNFDCRSKEKICNPIYASYCDAHFADGQCDQGCNTEECGWDG
LDCADTVPENLANGVLVLVVLLPPDQLLLTGKAFLQKLSAILHTSVRFRLDKNGDAMILP
YTRREARIKRELGHQHEVVGSIVYLEIDNRLCIQDSEDCFPTATSAAEYLGALSATEMLD
FPYPLQEVRGEKVPIDPSFGGWSKLLTQWMVPCLVFIFVLVILVIGMLITRRKREHSTLW
FPEGFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGLKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDSDCPEAKRLKV
EEPSMLSDSEDAVDCRQWTQHHLVAADIRVPPTIALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTP
LMLASFCGGGLEPEVTEEEESEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARA
DAAKRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALIL
AARLAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKE
ETPLFLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIALERMHHDIVQLLDEYNTVRS
PQSHGAAGHQLAGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQSKKNRRPGAKGSSLGAQHAANLKE
SVKARNKKLTLDMQSALLDSSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHS
SMSVPSTPMVRSSMLEGGGPFAVSLAQINDIGAGAMSMQGRVSMASDVNHGYVLSSGQLG
VNMGMVSPVSVPFDWHNRMPPSSQCGQQVVNIVQSSQAGMHVQSPAMQQQNMLMHQQQLY
RSPMLQPTPVNSTPTISPVKLSSIAEQQQLINHNITNQPSMGPMGTSTPPTPQTSQPPPS
FFQQHQQQLPQQSSQPPVQPTQGAAAAAQPAQVLSSQPSGSTAGNEDYPTPPSQHSYSST
LDATPKHFHNLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPPCVSDWSDSTPSPAVTVPNQTQITQIP
EANGKMQVFA
NT seq
7413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatatgcaatggattattttctcgcttttattgtgctttcatgttggtgaa
gggttccgctgtgtggataaaaacaggccctgtcaaaatggagcgacatgcatagattcc
ccttcgagatgcatatgtcgtcccggattcattggccctttctgtcaacacctggacccc
tgtcatcgatccccatgtctgaatggagcagcttgcaagagtgatgtggtcaatgatatt
ccacagtacaaatgtgtgtgccaaagaggtttcagaggtcaagactgctccctcattgat
gcttgtgccacaagtccatgtgctaacggggctcgctgtgtcaattggaataaccattac
aactgttcctgcccccctggctaccaggggaagaattgccgcagtgacattgatgagtgt
cgcaaacctggtgcttgtctcaatggtggcctgtgtcgtaactcagttgggtccttccgc
tgccagtgtccactagggtacagtggtcgtacatgtgaggtgtctaccttaccttgtgcc
ccatctcagtgtctcaatgggggcacctgtcgccagacaagtgaccattcctatgagtgt
gcttgcctaccaggatttgagggacacaactgtgagaacaatgtggatgactgtccaggt
cacaagtgcatgaatgggggattatgtgtggatggagtcaatacatacaactgccaatgt
ccaccagaatggacaggacaatactgtgctgaagatgtcaatgaatgcctcatgcaacct
aatgcatgccataatggaggcacttgcttcaacactatcggtggtcatacctgtgtctgt
gtcaatggttggactggagaagactgtagtgagaacatcgatgactgtgcaaaagctatt
tgcttcaatggtgccacatgccatgaccgtgtggcatccttcttctgcgagtgtccagtt
gggaagacaggtctgctttgtcatctggatgatgcatgtgtcagcaacccttgcaatgag
ggggccgtgtgtgataccaatccccttaatggtcgtgctatttgcacctgtcccgctggt
tttgttggtggtgcctgcaatcaggatatggatgagtgttccattggtgcaaacccttgt
gagcattttggaaaatgtgtaaacacagaaggctcctttcagtgtcagtgtggtcgtgga
tatgctggcccacgttgtgaaattgacatcaatgaatgcctttccatgccctgtcagaat
gatgccacctgcttggaccgcattggagagttcacttgcatatgcatgccaggttatatg
gggactttctgtgaaattgacattgatgactgtgagagcaacccatgtgtgaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaacggcttcacttgcacctgtcagccagggtttactggcacc
atgtgtcaaattgacgtagatgagtgtgctagcactccctgccagaatggagcaaaatgc
tatgatcggcccaatggatttgagtgccggtgcgctgaaggttatgaagggagactctgt
gatattaatgtcaacaactgtcaacctgacccatgccaccatggtacttgcatagatggc
attgctagctacacgtgtagttgtgatcccggatatacaggctatcgctgtgaaaaccaa
cttaatgagtgccatagcaatccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggaccgggtcaat
aagtacctctgtcagtgccagcatggaacatcaggtacaaactgtgagataaactttgat
gattgtgccagtaacccttgtgattatggcatctgcaaagatggcatcaaccgctacgat
tgtgtttgtaaacctggctttacaggtcctaaatgtaatgtggaaatagatgagtgtgca
tccagcccctgcagaaatgggggaacgtgtattgatgaagaaaatggatttcactgccag
tgtcctgaaggctttaaacccccttactgttactcccaagtggatgagtgtggcagcagt
ccatgtgtccatggctcctgcagagaggacataaacggataccgttgtgactgtgaacct
ggatgggttgggaaaaactgtgacctggacaggaatgactgttcaccaagtccttgtcaa
aatgctggaacttgcatagataaacttaatggttttacctgcaagtgtcgccaagggttc
agaggtaacctctgccaggtgaacaacaatgaatgtgcttccagcccctgtctaaataag
ggaacttgtgtggatggtgttgcaagtttcacatgtctgtgtgagctcccctacagtgga
cctacttgtgctgaggtcctcacaccttgcttcccgaacccttgcgccaatcatgcagtc
tgcacccacaccccagactacctgggttatcagtgtaactgccagccagggtggcaaggt
cagttgtgtaacatagatatgaatgaatgcatatctaatccctgcaaaaaccgtgggacc
tgcacaaacacgctaggaggctttgtgtgctcttgtagagcaggatttacagggctgact
tgtgaaacagatatcaatgactgttttcccaacccttgcttaagtggaggttcatgtaca
gatggtgtgaactcctttcactgtagttgcttgcctggcttcacaggccctagatgtgcc
ctggagatcaatgaatgtcaaagtttcccctgtaaaaacggaggcacctgtacagactat
gtcaactcttacacatgtagctgcccacctggctttactggcatccactgtgaaaccaac
attccagattgcactgaaagttcttgctttaatggagggacttgcacggacaaaatcaat
ggctatgcttgcacctgtcgctctggcttcactggctcccactgccagtatgaagtaaac
gagtgtgactctcagccatgtctaaacggaggcacctgtcaagatgccctgcagtccttc
cgctgttcctgttcaaagggttttgaaggcaccaggtgccagacaccagttgactggtgc
cgacgcatgtctctgtgccagaatggaggacgttgccgccaaaaggatgcatttttcagt
tgtgattgtcctaatggttggtctggacgttactgtgacatcccaaacatgtcttgtgaa
acagcagctcgcaagaggggaatccaaacagatgagctttgccaccatggtggtcactgc
gtcaactctggcaatacacacatttgtaaatgccctgctgactacactgggagctattgt
gaaatacaagtggaccaatgtgaagacaaaccttgccgcaatggtgccacctgcaggtca
tatgttggggggtaccagtgtgattgcatgcctggctatactggacagacctgcgagatt
gaaatcaatgagtgccagtctcatccatgccagaatgggggcacttgtattgatctagtt
ggacattatatctgctcctgtccccccggcacactgggtgttctctgtgagattaatgag
gatgactgtgcaccaccactgaggctgcgaggtgccccactcaagtgcctcaataacgga
acctgtgtagacagagttggtggtcatcgctgcaattgtccaccaggtttcacaggtgac
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctcaaacccttgcagttccaccaacagtctt
gactgcatccagttgtccaatgattacctgtgtgtctgcaagcctgggtttacaggacga
aggtgtcagaacaggttcagtgtctgtgaatctcagccttgtcataacggaggtgcctgt
tcagtaactagcagtgcccctctgggatacacctgtacatgtcaacttggttatgctggt
ccaaactgtgaaaggagcatgtcctgtcaggagttgtcttgctacaatgggggaagctgt
gcccttaccaagaggggaacacgctgcgtatgcctgacaggctatggtgggccccaatgt
cagcatcgcagtaatgatgggtgctcttccaagccatgccagaacggaggcctgtgcact
gaagaaaccagtttaccatttttccattgccagtgtccaagtggatttatgggaacacgg
tgtgaaaaaagcaaatctgagcttccgtctctctcctgccctagggcagactgtcaaaac
aaagccaatgatggtctttgtgacaaggaatgtaatacactcccttgtcgttgggatggt
ggtgactgctccctggcagtgaatccctgggctcattgcacagacccccgctgctggcgt
gccttcaacaatagccagtgtgaagaattctgtaacaaccctcagtgcctgtatgacaac
tttgactgcagaagcaaagagaaaatttgcaatccaatatatgcaagttactgcgacgcc
cattttgctgatggtcagtgtgaccagggctgcaacacagaagagtgtggttgggatggc
ttagattgtgcagacactgttccagagaatcttgccaatggtgttttggtgttggtcgtc
cttctgcctccagaccagcttcttctcactggcaaagcttttttgcagaaattaagtgct
attctgcacacttcagtgcgcttcagattggacaaaaatggagatgctatgatccttccc
tacacccgtcgagaggcacgcatcaaacgagaacttggacatcaacatgaagttgttggg
tccatagtctatctagagatagacaaccgtttgtgcattcaggattcagaagactgtttc
ccgacagctacaagtgcagcagagtatcttggagctctatctgcaacagaaatgctcgac
ttcccttatcctcttcaagaagtcagaggagaaaaggtccccattgatccatcatttggt
ggatggtcgaagctacttacccaatggatggtgccatgtttagtgtttatttttgttttg
gtcatccttgtgattggcatgttgataactcgtcggaagcgtgaacacagcaccctttgg
ttccctgaaggattctttcttaagaaagaacccagcagtaacaaaaaccgcagggaacct
gtgggtcaagatgctctcggactgaaacacatgccaaaaacagttgaggaatctctcctt
ggtgatcacagtgatcagtggatggactcagattgcccagaagccaaacgactcaaggtt
gaggagccgagcatgctctcagacagcgaagatgcagtggactgcagacagtggacccag
caccatcttgtagctgcagacatccgtgtaccacccacgatagccctcacgccacctcaa
ggagaatttgaaagtgactgcatggacgttaatgtccgaggtccagatggttttacacct
ctaatgctggcatcattctgtggaggtggcctagaacctgaggtgacagaggaggaggag
agtgaggagtgctctgccaacattatctctgacttaatctaccagggtgcatcgcttgct
gcacaaacagaccgtaccggtgagacagcactccacttggctgctcgctatgcacgtgct
gatgctgcaaagcggctgctggatgccggagcagacgccaatgctcaagacaacacagga
cgaacaccgctgcatgctgctgtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattttgatt
cgaaatcgtgccactgatctggactcccgtatgtacgatggctctactgctctgatcctg
gcagcacgactggcagtggaaggcatggttgaggaactcattacatgccatgcagatgtt
aatgcagtcgatgaattgggtaaatctgctttgcattgggctgcagctgtaaacaatgta
gatgcaactattgctctgctgaaaaatggcgctaacaaagatatgcaagatctgaaggag
gagacccctctgttccttgctgcccgtgaaggaagttgtgaggcagtgaaggtgctgcta
gctcacttcgcgaacagagaaattacagaccacatggacaggctgccaagagacattgct
ctagagcgtatgcaccatgatattgtacaacttcttgatgaatacaacacagtaaggagt
ccccagagtcatggagcagctggacaccaactcgcaggaggccacactctatctcctctc
atgtgtcctcccagtgcctttctccctagtctgaagaacaccccacagagcaagaagaac
cgccggcctggggccaaaggttccagccttggagcccagcatgctgcaaatctgaaggag
tcagtaaaggctcgcaataagaagctaactctggacatgcagagtgccttattggatagt
tcggttactctgtccccggtggactccctagactcaccccatgggggagctagcaatgct
ggctacatcaccaatccaacgtcacctgttgccatgcagtcaccaggtcttttccattcc
tccatgtctgttccaagcaccccaatggttcgcagtagcatgttggaaggagggggccca
tttgcagtatctcttgcacaaattaatgacattggagcgggagcaatgtccatgcagggc
cgtgtctctatggcctcagatgtcaaccatggctatgtgctgagttctggccagctgggg
gtcaacatgggcatggtcagtcctgtcagtgtgccatttgactggcacaatcgcatgcct
ccatcctctcagtgtggtcagcaggttgtgaatattgtgcaaagcagtcaagcaggcatg
catgtccagagcccagccatgcagcagcagaacatgctgatgcaccaacagcagctctac
cgcagtccaatgctgcagcccacaccagttaactccacaccgaccatcagccccgtgaag
ctgtcttccattgcagagcaacagcagctcattaatcacaacatcaccaaccagccaagc
atgggtccaatgggaacgtctaccccacctaccccacaaacctcgcagcctccaccatca
ttcttccagcagcatcagcagcagctgcctcagcagtcctctcagcctcctgttcagccc
acccaaggagcagcagcagcagcccagccagctcaggtcctttcctcccagcccagtggt
agtactgcagggaacgaggattatccaacacctccttcccaacacagttattcatccaca
ttagatgccacacccaagcatttccacaatttgcccagtgagcacccctatctgacaccc
tctccagagtctccagagcactggtccagtccctctcccccctgcgtctctgattggtca
gattccacaccaagcccagctgtcactgtccccaaccagacccaaattactcaaatccca
gaggccaatggcaaaatgcaggtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system