Poeciliopsis prolifica (blackstripe livebearer): 129374251
Help
Entry
129374251 CDS
T09758
Symbol
notch1a
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1 isoform X1
KO
K02599
Notch 1
Organism
pprl
Poeciliopsis prolifica (blackstripe livebearer)
Pathway
pprl04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pprl00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
129374251 (notch1a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_3
cEGF
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129374251
NCBI-ProteinID:
XP_054908542
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2478 aa
AA seq
DB search
MYRFLVKLTFLIPAIVFSQGLKCSLPTETCLNGGRCEATTNGNGECKCPSDYVGDRCQHP
SPCSPSPCRNGGECHAVSHGNTFDFHCVCRLGFTDRLCLTPRNHACMSSPCRNGGTCDLI
SLSSFRCRCPPGWSGKTCQTPNPCASNPCANGGQCSSLDSNFKCTCPANFQGQTCKQDIN
ECAINPSPCLNGGFCVNEVGSYHCRCPQEFTGQHCETLYSPCSPSPCQNGGTCVQKGETT
YDCSCLLGFTGQHCEHNIDDCPGHSCQNGGVCVDGVNTYNCQCPPHYTGQYCTENVDECE
LMPNACQNGGTCHDTHGSYHCVCVNGWTGDDCSENIDDCASAACYNGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYAGSACNLDIDECSLGA
NPCEHGGRCLNTLGSFQCKCLQGYEGPRCEMDINECISNPCQNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHINTDECASQPCLNNGKCIDKINSFHCECPKGFSGNLCQVDIDECASTPCKNG
AKCTDGPNKYTCDCAEGYTGQHCEIDINECYSDPCHYGTCEDGLASFTCYCHPGYTGRLC
ETNINECLSQPCKNGGTCQDRENSYFCSCPKGTAGSNCEVNLDDCKSQPCDYGRCIDKIN
GYECACEPGYTGTMCNINIDDCVINPCHNGGTCIDGVNSFTCICPEGYHDVTCLSEVNEC
ASNPCIHGRCQDLINGYKCTCDSGWSGHNCNINNNECESNPCMNGGICKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCETLQAPCSPRPCKN
KGICKEAEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKSPCRNGAVCLNTMGGFQCKCQPGYT
GQRCETDIDDCKPNPCSNGGLCRDSVNKFTCTCLPGFRGSRCEHDINECESNPCKNGANC
TDCVNSYTCTCPPGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINTFTCLCLTGFTGSYCQY
DINECDSKPCLNGGTCLDGYGTYKCTCPHGYTGVNCQSLVRWCDSSPCKNGGSCWQQGAS
YTCQCQTEFTGLYCDIPSVSCEVAAKRQGVEVSQLCRNSGQCLDAGNTHYCRCQAGYTGS
YCQEQVDECSPNPCQNGATCNDYLGGYSCECVPGYHGVNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEINLDDCNPPSDPLTNEPKCFNNGKCVDRIGGYQCLCPPGYV
GERCEGDVNECLSNPCDPRGSYNCIQLPNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGRPCRNGG
TCAVASNTPHGFICKCPPGFTGSSCEYDSRSCGSLSCRNGGTCVSGHLGPRCLCPSTFTG
PECLTPTDSLCISNPCYNGGTCQITPDAPFFQCSCPSNFNGLLCHILDYSFVGGFGRDIT
PPPEVEVSCEIPQCDEWAGNHICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCSAALQCWRYF
NNGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNMPEKLADGHLVLVIQIPPELLKNRSSAFLRELSNVLHTNVVFRRDAKGEPMIFPYY
GNEQDLVKHNVLKRSAEGWPEWTSVPSNVLGQVKESVSPMVSQRKRRELDPMQVKGSIVY
LEIDNRQCYQQSTECFQSATDVAAFLGALATSGNLNVPYIEAVTSVKPTPTTTEYFSMYL
VFLVLAILGLICLGVIVLQKRRREHGQLWMPEGFKVSEPSKKKRREPLGEDSVGLKPMKN
SDSNLIDDNQTEWGDDDPECRHFRYEEQAMLDLSDHTDQRKWTQQHLDAADLRITSIAPT
PPQGEIENDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLDTGNSEEEEDPSAEIITDFIYHGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSANANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADANATDDSGKSALHWAAAVNN
MEAAVVLLKNGANKDMQDNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSATLSTSTLSPPLCSPNDYISNLKPTPSGKKARKP
SSGGKGGKDGGKDIRVKKKKPMDGKSNLLDTTAVLSPVESLESPHGYLSDVASPPMPSPF
QQSPPMSLNHLQGNGDSHTGQISIGKDMSCMSFDPPRLTHLPVSSPSSQATTSVGGSRGG
HCDWLTRMHPGVSQQGSFTQGPPITHNMMGALHGVSTATLSQIMGYQNLPTSHLGSTVHM
MQQPRSRQLQHQNSNSTTVSQSMSQSFPNVELNGADMQPNGGSGRSVPIHTVLPQETQML
GTQFPTPPSQHSYTGPMDNTPNHQLQVPDHPFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNLSDWSEGIS
SPPTSIHSQMNLIPDQFK
NT seq
7437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcgtttcttagtgaaactgacatttctaattccagcaatcgtcttctcacaaggt
ttaaaatgctccctgcctactgagacgtgcctaaatggaggaagatgtgaagccaccaca
aatggaaatggagagtgcaagtgtcccagtgactacgtaggggatcggtgccaacaccca
agcccctgcagcccgtccccctgtcgcaacggcggcgaatgccacgctgtctcccatggc
aacacgtttgatttccactgcgtatgccgcctgggtttcaccgatagactgtgtctgact
cccaggaaccatgcttgcatgagctccccctgtcgcaatggaggaacgtgtgaccttatc
agcctcagcagtttccgctgccgctgcccgccaggatggtcaggtaaaacctgccagact
ccaaacccatgtgcttccaatccatgtgcaaatggtggccagtgctcttctttagattcc
aacttcaagtgcacctgccctgccaacttccaaggtcaaacctgcaagcaggacattaac
gagtgtgccatcaatccctctccatgcctcaatggcggcttctgtgtcaacgaagttggc
tcttaccactgccgctgtcctcaggagtttactggtcaacactgtgagaccctttactcc
ccctgcagcccctcaccatgccagaatggagggacatgtgtccagaagggagaaaccacc
tatgactgtagctgtctcctaggctttacaggccagcactgtgagcacaatattgatgac
tgcccgggacacagctgtcagaacggcggtgtgtgtgtggatggagtcaacacctacaac
tgccagtgcccacctcattacacaggtcagtattgtactgaaaacgtggatgagtgtgaa
ctgatgcccaatgcctgccaaaatggaggaacatgccacgacacgcacggcagctaccac
tgtgtgtgcgtcaacggctggacgggtgacgactgcagcgagaacattgatgactgtgcc
agcgcagcctgctacaacggcgccacctgccatgaccgcgtggcctccttcttctgcgag
tgtccacatgggcgcacaggtttgctgtgccaccttgatgacgcctgcatcagcaatcct
tgtcaaaagggctctaattgtgacaccaacccggtaaatggcaaggcgatatgcacctgt
cccccaggttacgcaggatcagcctgcaacctggacatagatgaatgctccctcggtgcc
aacccttgtgagcatggcggccgctgcctcaacacattaggctctttccagtgcaagtgt
cttcaaggatatgagggacctcgatgtgagatggatattaacgagtgcatatctaatccc
tgccaaaatgatgccacctgtctagaccagattggaggttttcactgcatctgtatgcca
ggatatgagggtgtgttttgccacattaacacggatgaatgtgccagccagccttgtctt
aacaatggaaaatgcatagacaagatcaactcattccactgcgagtgtcccaaaggattt
tctggaaatctgtgtcaggtggatattgacgagtgtgccagcacaccctgcaaaaatgga
gccaaatgtactgatggacccaataagtacacatgtgattgtgccgaaggttacacaggg
cagcactgtgagattgacatcaacgagtgctactctgatccttgccactatggcacatgt
gaagatggcctggcctccttcacctgctattgccaccctggctacactggccgcctgtgc
gaaaccaacatcaacgagtgtctcagccagccatgtaagaatggaggcacttgccaggac
agggaaaactcatacttctgttcctgccccaaaggcactgctgggtccaactgcgaggtg
aacctggatgactgcaagagtcagccctgcgactatgggaggtgcattgacaagatcaat
ggctacgagtgtgcgtgtgagccgggttacacaggcacaatgtgcaacatcaacatagac
gactgtgtcatcaacccctgtcacaatggtgggacgtgcattgatggcgtcaacagcttc
acatgcatctgccctgagggctaccatgatgtcacctgtttgtcagaggtgaatgagtgc
gccagtaacccttgcatccacggccgatgtcaggacctcattaatggctataaatgtacc
tgcgactcgggctggagcggccacaactgcaatattaataacaacgagtgcgagtccaac
ccctgcatgaacggaggaatatgcaaggacatgaccagcgggtaccactgcacatgcaga
gttggcttcaccggacctaattgccaaactaacatcaatgagtgtgcttccaatccctgc
ctcaaccagggaacctgcattgatgatgtggctggatacaagtgcaactgtttactgcct
tatactggtgaaaattgtgagactctccaggccccttgcagccccaggccatgtaaaaac
aaaggaatatgtaaggaggctgaagactatcagagcttttcttgcatctgccctgaagga
tggcaaggtcagacttgtgaaattgacatcaatgaatgcgtgaagagcccttgccgtaac
ggtgctgtgtgcctcaacaccatgggtggctttcagtgcaagtgccagccaggttacacc
ggtcaacggtgtgagacggatattgacgactgcaaaccaaatccatgcagtaatggaggg
ctttgccgcgatagtgtcaacaagtttacttgtacctgcctgcccgggtttcgtggcagc
cggtgtgagcatgacataaacgagtgtgagagcaacccttgtaaaaacggggctaattgc
acagactgtgttaatagctacacctgcacctgcccaccgggcttcagtggcatcaattgt
gagatcaacaccaatgactgcaccgacagctcttgcttcaatggtggaacttgtgtggat
gggattaacaccttcacctgtctgtgtctaactggattcactggaagctactgccaatac
gacatcaatgagtgtgactccaaaccatgcctcaatggaggcacctgtcttgatggttac
gggacttacaagtgcacgtgtcctcatggctacacgggagtcaattgtcagagtcttgtg
cgctggtgtgactcctccccttgtaaaaatggaggttcttgctggcagcagggagcctcg
tatacctgccagtgtcagactgaatttactggcctctactgtgatatcccaagtgtgtca
tgtgaagttgctgccaaacggcaaggtgtggaggtgtctcaactgtgtaggaactcgggc
cagtgtctggatgctggaaacacacattactgccgctgccaggctggctacactgggagt
tactgccaggaacaggtggatgaatgttcacctaatccttgccagaatggagcaacctgc
aatgattatcttggaggttacagttgtgagtgtgtccctggttaccatggtgtgaactgt
tcaaaagaaatcaatgaatgtcagtctcaaccctgccagaatggagggacctgcatcgat
ctcattaacacctacaaatgctcctgtcctagagggacacaaggtgtccactgtgagatt
aatttggatgactgcaaccctcccagcgacccactgacgaatgagcccaaatgcttcaac
aacggaaagtgtgtagatcgcattggtggctaccagtgcttgtgtccgccaggttatgta
ggggaacgctgtgagggggacgtcaatgaatgcctgtctaacccttgtgacccccgaggg
tcatacaactgcatccagcttcccaacagctaccgctgtgaatgtagaaccggatataca
gggcaacgctgtgacaaggtatttgatggctgcaagggaagaccctgcaggaatggagga
acatgtgctgttgccagtaacacgcctcatggatttatctgtaaatgtccacctggcttc
actggatcttcttgcgagtatgattctcgctcctgtggcagtctgagttgcaggaatggt
ggtacatgtgtgtccggccacctgggtccacgttgcttgtgtccctcaaccttcaccggg
cctgagtgtctgactcctaccgacagcctctgcatctcaaatccctgctacaatggaggc
acctgccagatcacccctgatgctccctttttccagtgcagttgtcccagtaacttcaat
ggcctactttgccacatactggactactcctttgttggggggtttggccgggacatcaca
ccacctccagaagtggaggtgagctgtgagattcctcagtgtgatgagtgggctggtaac
cacatctgtgactcgctgtgtaacaaccatgcctgtggctgggacggaggtgactgctcg
ctcaattttgacgatccctggcaaaactgctcggctgctctgcagtgctggcgatatttc
aacaatggcaagtgtgatggtcaatgtaacagcccagggtgtctctatgatggctttgat
tgtcaaggacaggaagggcagtgcaaccctctttatgatcagtattgtaaggatcactat
gctgatggccattgtgaccaaggttgcaacaatgcagaatgcgagtgggacggcctggac
tgtgctaacaacatgccagagaagctagcagatggacatttagttctggtcatccaaatt
cccccagagctgcttaagaaccgctcttcagccttccttagagagctgagcaatgttctc
cacactaatgtagtgttccgccgtgatgcaaaaggagaaccaatgatctttccttactat
ggcaatgaacaagacctggtgaaacacaatgtgctgaaacgctctgcagaaggttggcct
gagtggacttcagtgccatccaatgttttgggtcaggtgaaggaaagtgtgtcccccatg
gtcagtcagcggaaacggagagagctggatccaatgcaagtcaaaggatcgattgtatat
ctggagatagacaatcgtcagtgctaccagcagtctactgaatgcttccagagcgcaaca
gatgtggctgcctttctcggagcactggctacgagtgggaacctcaatgttccttatatt
gaagctgtaacaagtgtgaaacctactcctactactacagagtatttctccatgtatttg
gtattcctggtgttggctattttgggtttgatatgcctcggtgtgatagtgcttcagaag
cggcgtcgagagcatggccagctctggatgcctgagggatttaaagtatcggagcccagc
aaaaagaaacgcagggagccattgggagaggactctgttgggctgaaacctatgaagaac
tcagacagcaaccttatagatgacaatcaaactgaatggggagatgatgatccagaatgc
aggcacttcaggtacgaggagcaggcaatgttggatttaagtgatcatacagaccagagg
aaatggacccagcaacacctggatgcagctgacctccggataacatccattgcacccaca
cctcctcagggagaaattgagaatgactgcatggatgtcaatgttagaggaccagatggt
ttcacgcccctgatgattgcctcctgcagtggtggaggactggataccggcaacagtgaa
gaggaagaggatccgtcagcagaaataatcacagacttcatttaccatggagccaacctc
cataaccagactgatcgcacgggtgaaaccgccctccacttggccgcccgttatgcccgc
tcagacgccgccaagcgcctcctggagtccagtgcaaacgccaatgtacaagacaacatg
ggccgcaccccactgcacgctgccgtggctgcagatgcgcagggagtttttcagatttta
atccgaaatcgagccaccgatcttgatgcccgcatgcatgacggaacaacacctctgatt
ctggccgcacgattggctgttgagggcatggtcgaagaacttatcaactgtcatgctgat
gctaatgccactgatgattctggaaaatctgccttgcactgggctgccgctgtaaacaac
atggaggctgctgtggtgctactgaaaaatggtgccaacaaagacatgcaggacaacaag
gaggagacgccgctgtttctcgccgcccgtgaaggcagttatgagacagctaaagttctt
ctggagcactttgccaaccgtgaaatcactgaccacctcgaccaactgccacgagacatc
gcccaagagcgcatgcatcacgacatagtccgcctgctagatgagtacaacgtggttcgg
agtcctgggctgcatagcgccaccttgagcacctctaccctctcccctcctctctgctcc
cccaatgactacatcagcaacctcaagccaaccccctctgggaaaaaagctcgaaagccg
agctctggtgggaaaggagggaaggatggaggtaaagatataagggtaaagaagaagaag
ccaatggatgggaagagtaacttattagacacaacagctgttctgtctcctgttgagtca
cttgagtcaccccatggctacctgtccgatgtggcctctcctcctatgccatcacctttc
cagcagtcgccgcctatgtccttaaatcacctacaaggcaacggggactcccacacaggc
cagattagcataggtaaggatatgagttgcatgtcatttgatcccccccgcctcacccac
ttgcctgtgtccagccccagtagccaggccacaacgtctgtgggtggcagcagaggaggc
cactgcgactggctgaccaggatgcacccgggtgtgagccagcagggaagcttcacccag
gggccgccgattacacacaacatgatgggtgccctgcatggtgtcagtactgccactttg
tcgcagatcatgggttaccagaatttaccaaccagccatctgggctcaaccgtgcacatg
atgcagcaacctcgctccaggcagctgcagcaccagaactccaactccaccaccgtcagt
caaagcatgagccagagcttcccgaacgttgagctgaatggggctgacatgcagccaaac
ggtggctctggccgctcggttcccatccacaccgtgttgccgcaggaaacacagatgctc
ggcacccagtttccaactcctccctcccaacatagctatacaggacctatggacaacaca
cctaaccaccagcttcaggtgcccgaccacccatttctaaccccttcccctgggtcccct
gaccagtggtccagttcatccccacattccaacttgtccgactggtcagagggcatctcg
agcccaccaacaagtattcactctcaaatgaacctaattccagaccaatttaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
