Paenibacillus psychroresistens: EHS13_02805
Help
Entry
EHS13_02805 CDS
T06328
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ93908
UniProt:
A0A6B8REP5
LinkDB
All DBs
Position
565216..568506
Genome browser
AA seq
1096 aa
AA seq
DB search
MTIQNIIVNGGFETGTLIPWVPSNTTITSLFSHSGSFSARLQGGSTISYIGQYIHVNQGD
SFEVLVSLAKVGISPAAPVQIQVVYLDNLFNSLGNGLFINVPVDRIPTADNRTWLEIYQT
TTPAPQNTTQTYILINTLPQAGTADILVDDVALLSVGGTGATGATGATGATGRTGSTGST
GSTGSTGTAGTTGATGGTGITGATGTMGVTGRTGVTGATGTVGATGGTGVTGVTGTMGAT
GGTGVTGATGSTGATGGTGVTGATGSTGATGGTGVTGATGLTGATGGTGVTGATGTTGAI
GETGVTGVTGATGETGETGATGVTGATGETGETGTTGVTGSIGATGETGAAGVTGTTGAT
GETGATGVTGATGETGETGATGVTGATGETGETGTTGVTGSIGATGETGAAGVTGATGAT
GETGAAGVTGTTGETGETGAAGVTGTTGETGETGATGVTGATGETGETGAAGVTGATGET
GETGTTGVTGSIGETGETGAAGVTGATGATGGTGVTGVTGTTGKTGETGTTGVTGSIGAT
GETGAAGVTGATGATGETGAAGVTGTTGETGETGAAGVTGTTGETGETGATGVTGATGET
GETGATGVTGATGETGETGTTGVTGSIGATGETGAAGVTGTTGATGETGATGVTGTIGAT
GETGATGVTGSIGATGETGATGVTGSIGATGETGATGVTGATGETGETGATGVTGATGET
GETGTTGATGTTGETGETGATGVTGTTGVTGATGSTGTTGESGVTGMTGESGVTGMTGAT
GVTGATGVTGETGAMGVTGSTGATGETGFTGATGITGATGELGVTGVTGTTGETGETGVT
GMTGATGETGETGATGVTGSTGATGETGVKGETGSTGPTGETGATGVTGLTGATGESGVT
GMTGATGVTGEIGATGVTGSTGATGETGATGVTGSTGVTGTTGSTGATGASAVLSFADFY
AVMPPNNAATVAVGGDVDFPQNGPTSATGIFRTGVDTFNLSTIGIYEVLFQVSITEAGQL
VLTLNSGAGAVELAHTVFGRATGTSQIIGMALVQTTVINSIITVRNPASNPTALTITPLA
GGAAAVSAHLIITQIA
NT seq
3291 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccattcaaaatataatcgttaatggaggttttgaaacagggacactaataccttgg
gttccttctaatacaacaattactagcctattttcacattctggttcgttttcagcaagg
ctgcaaggcggttcaacaatctcttatattgggcaatatattcatgtgaatcaaggagat
agttttgaggttcttgtttcgttagctaaagtaggaatttcaccggctgctcctgttcaa
atacaagtcgtttatttagataatttgtttaattcacttggaaatggactgtttataaat
gtaccagttgatcgaattcctactgcggataatcgtacatggctagaaatctatcaaacc
acgacgccagccccgcaaaatactacacaaacctatatattgatcaatacactcccgcaa
gcgggaacagcagacattttagttgacgatgtagctttattatcagttgggggaactggt
gcaactggtgcaaccggtgcaacaggtgcaacgggtaggactggatctacaggttcgaca
ggttcaacaggatcgacgggaactgcaggaacaacaggtgctaccggaggaaccggaatt
acgggtgcgacaggaacgatgggtgtaacaggtagaactggagttacgggtgcgacagga
acggtgggtgcaacaggaggaaccggagttacgggtgtgacaggaacgatgggtgcaaca
ggaggaaccggagttacgggtgcgactggatcaactggtgcaacaggaggaaccggagtt
acgggtgcgactggatcaactggtgcaacaggaggaactggagttacgggtgcgacagga
ttgactggtgcaacaggaggaactggagttacgggtgcgacaggaacgacaggtgcaata
ggagaaactggagttacgggtgtgacaggagccacaggtgaaacaggcgaaactggagct
acgggtgtgacaggagccacaggtgaaacaggcgaaactggaactacgggtgtgacagga
tcgatcggtgcaacaggagaaactggagctgcgggtgtgacaggaacgacaggtgcaaca
ggagaaactggagctacgggtgtgacaggagccacaggtgaaacaggagaaactggagct
acgggtgtgacaggagccacaggtgaaacaggcgaaactggaactacgggtgtgacagga
tcgatcggtgcaacaggagaaactggagctgcgggtgtgacaggagccacaggtgcaaca
ggagaaactggagctgcgggtgtgacaggaaccacaggtgaaacaggagaaactggagct
gcgggtgtgacaggaaccacaggtgaaacaggagaaactggagctacgggtgtgacagga
gccacaggtgaaacaggagaaactggagctgcgggtgtgacaggagccacaggtgaaaca
ggcgaaactggaactacgggtgtgacaggatcgatcggtgaaacaggagaaactggagct
gcgggtgtgacaggagccacaggtgcaacaggaggaactggagttacgggtgtgacagga
accacaggtaaaacaggcgaaactggaactacgggtgtgacgggatcgatcggtgcaaca
ggagaaactggagctgcgggtgtgacaggagccacaggtgcaacaggagaaactggagct
gcgggtgtgacaggaaccacaggtgaaacaggagaaactggagctgcgggtgtgacagga
accacaggtgaaacaggagaaactggagctacgggtgtgacaggagccacaggtgaaaca
ggagaaactggagctacgggtgtgacaggagccacaggtgaaacaggcgaaactggaact
acgggtgtgacaggatcgatcggtgcaacaggagaaactggagctgcgggtgtgacagga
acgacaggtgcaacaggagaaactggagctacgggtgtgacaggaacgatcggtgcaaca
ggagaaactggagctacgggcgtgacaggatcgatcggtgcaacaggagaaactggagct
acgggcgtgacaggatcgatcggtgcaacaggagaaactggagctacgggtgtgacagga
gccacgggtgaaacaggagaaactggagctacgggtgtgacaggagccacaggtgaaaca
ggagaaactggaactacgggtgcgacaggaaccacgggtgaaacgggagaaactggagct
acaggtgtaacaggaacaactggagttacaggcgcgactggatcgactggtacaacagga
gaatctggggttacgggtatgacaggagaatctggggttacgggtatgacaggagccaca
ggtgtaacaggagccacaggtgtaacaggagaaactggagctatgggagtgacaggctcg
acgggtgcaacaggagaaactgggtttacgggtgcgactggaatcacaggtgcaactgga
gaacttggggttacaggtgtgacaggaaccacgggtgaaacaggagaaactggggttacg
ggtatgacaggagccacaggtgaaacaggagaaactggagctacgggagtgacaggatcg
acaggtgcaacaggagaaactggggttaagggtgagactggttcgacgggtccaacagga
gaaactggagctacgggagtgacaggattgactggtgcaacaggagaatctggggttacg
ggtatgacaggagccacaggtgtaactggagaaattggagctacgggagttacaggatcg
accggtgcaacaggagaaactggagctacgggtgtgacaggatcgacaggtgtaacagga
acaaccggatctacgggtgcaactggagcatcagcagtattaagttttgcagatttttat
gcagtgatgcctccaaataatgcagcaacagttgctgtcggtggagatgtagatttcccg
caaaatgggccaacaagtgcgacagggattttccgcactggagttgatacttttaacttg
tccacaataggcatttatgaggtcttgtttcaggtgagtattaccgaagcaggtcagttg
gttttaactctaaattcaggagcaggagcagttgaattagcccatacggtatttggtcga
gcaactggtacttctcagattataggaatggctcttgtacaaacaactgtcatcaattcg
ataattacagtacgaaatccagctagtaatcccaccgcacttacgattactcctctcgct
ggcggtgcagccgctgtttctgcacaccttatcatcacacaaattgcatag
DBGET
integrated database retrieval system
