Paenibacillus psychroresistens: EHS13_26350
Help
Entry
EHS13_26350 CDS
T06328
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ98154
UniProt:
A0A6B8RQS5
LinkDB
All DBs
Position
complement(5785659..5787962)
Genome browser
AA seq
767 aa
AA seq
DB search
MSIQNLIVNGGFETGTLAPWIPANTTITSLFSHSGTFSARLQGGPVTSYIGQFVPVTQGD
SFEILISLAKVGFLPAAPVIIQVFYFDSIFNLLGQGLFTNVPIDRIPTADNHTWLEIYQT
TTPAPLGSTQAFVLIDNLPQAGTADILVDDVALLAAGGSGSTGPTGATGATGDTGAMGVT
GATGAMGVAGATGAMGVTGVTGAMGVTGVTGVTGATGDTGATGTTGATGAMGVTGVTGAM
GVTGVTGVTGATGDTGATGTTGATGAMGVTGVTGAMGVTGVTGVTGATGDTGATGDTGDT
GAMGATGVTGVTGATGATGVTGATGDTGVTGATGDTGVTGATGDTGATGATGDTGAMGAT
GVTGVTGATGDTGVTGATGDTGVTGATGDTGVTGATGDTGVTGATGATGDTGAMGVTGAT
GAMGVTGATGAIGVTGATGTTGATGVAGDIGATGATGDTGATGATGSIGATGVTGVTGTT
GTTGATGITGATGVNGVTGAIGDTGATGDTGATGATGTTGATGATGAMGVTGATGVTGAT
GDTGVTGATGATGATGVTGTTGTTGVTGVTGATGVTGATGATGTTGTTGATGVTGVTGAT
GATGATGTTGATGVTGIRGVTGPTGPAPTFVDAFFNGNIQPQTIASGLNILNITPNQFTA
VTYNAVTSVFTIQNAGLYNITVVINLAAATLPGATIGLSLNNSTAFLAPAVTTSTSGQLV
LVQVEALAVGDTLQFRNISGFPISIANSLVIANSAGHVAISRFSAFF
NT seq
2304 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcattcaaaatttaatcgttaatggtggttttgaaacaggtaccctagcaccttgg
attccagctaatacaacaattaccagtctattttcacattcaggtacattttcagcaagg
ctacaaggtggtccagtaacctcatatattgggcaatttgttccggtaactcaaggagat
agttttgaaattcttatttcgttagccaaagtaggatttctgccagctgcgcctgtcata
atacaagttttttattttgatagtatatttaatttgttgggacaaggactttttacaaat
gttccaattgatcggattcctactgctgataatcacacatggcttgaaatctaccaaact
actactccagctcctttaggaagcacacaagcatttgttttaatagacaatcttccgcaa
gcaggaacggcagacattttagttgatgatgtagctttattagcagcaggaggatctgga
tcaacaggaccgactggagccactggcgctactggagatactggagctatgggtgtgact
ggagccactggagctatgggtgtggctggagccactggagctatgggtgtgactggagtc
actggagctatgggtgtgactggagtcactggagttacaggtgcgactggcgatactggc
gctactggaactacgggagccactggagctatgggtgtgactggagtcactggagctatg
ggtgtgactggagtcactggagttacaggtgcgactggcgatactggcgctactggaact
acgggagccactggcgctatgggtgtgactggcgttactggagctatgggtgtgactggc
gttactggagttacaggtgcgactggcgatactggagctactggcgatactggagatact
ggagctatgggtgcgactggcgttactggagttacaggtgcgactggcgctactggagtt
acaggtgcgactggcgatactggagttacaggtgcgactggcgatactggagttacaggt
gcgactggcgatactggagctactggcgctactggagatactggagctatgggtgcgact
ggcgttactggagttacaggtgcgactggcgatactggagttacaggtgcgactggcgat
actggagttacaggtgcgactggcgatactggagttacaggtgcgactggcgatactgga
gttacaggtgcgactggcgctactggagatactggagctatgggcgtgactggagccact
ggagctatgggcgtgactggagccactggagctattggagtgactggagctactggaact
acgggagccactggagttgctggcgatattggagctacgggtgcgactggcgacactgga
gctactggagctactggatccattggcgctactggagttactggcgttactggaactact
ggaactacgggagccactggaattactggtgcgactggcgttaatggagttacaggtgcg
attggcgacactggagctactggcgatactggagctactggcgctactggaactacggga
gccactggcgctactggagctatgggtgtgactggtgctactggagttacaggtgcgact
ggcgacactggagttacgggagctactggagctactggagctactggcgttactggaact
actggaactactggtgttactggtgttacgggagcaactggtgttacgggagcaactggc
gctactggaactacgggtacgactggtgcaactggtgttactggtgttacgggtgctact
ggagctactggagccacgggtaccacaggagcaacaggagtaactggaattaggggggta
acaggcccaacaggcccagcacctacgtttgtagacgcattctttaacggtaatattcaa
cctcagacaattgcttcgggattaaatattttaaatattactccaaaccaatttactgca
gttacttataacgcagtaacaagtgttttcacaatacaaaatgcgggtttgtacaacatt
actgttgtaataaatcttgcagctgccacactaccaggagcaacaatcgggttatcgcta
aataattctacagcatttctcgctcctgctgtaaccacatcaacaagtggtcaattggtt
ttagttcaagttgaggccttagctgttggagatacacttcaatttaggaatatatctggg
tttcctatttccattgctaattcactagtaattgctaacagcgcaggtcatgtagctatt
tcaagattctcagcattcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
