Paenibacillus psychroresistens: EHS13_29580
Help
Entry
EHS13_29580 CDS
T06328
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 16 protein
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BgaA-like_CBM
Glyco_hydro_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ98735
UniProt:
A0A6B8RT27
LinkDB
All DBs
Position
complement(6547051..6551181)
Genome browser
AA seq
1376 aa
AA seq
DB search
MIMLKHFYVKWLPLVLTFAIVVSFLSGIPATAAIDSSGTVTASYTYHGDNVSQVNDGILS
YDDSPKNRWTSYESPNSTDWVQTEFTEAVTKNTVGIYIFDDGGGIKAPSSYDVQYWSGTT
WLSASNQVKSPAIPAGNELNTVVFSLVSATKFRVLFTHQGAKSGVTEILYVDSNMEAPPT
TPAVPLGIASASYTFHLDQVNQINDGIISYDSSPQNRWTSYESPNATDWVQTNFETDKLK
DTVGIYIYADGGGVKAPSAYDIQYLNESDVWVSAAGQIKSPSIPLGNALNIVSFTPVVAA
KFRILFTHSDAKTGITEIVYVDSTTQSIPAPPSLGIATASYANSGDPATKINDEIISFND
FPQNRWTAYGSPNSTDWVQTEYESGRSKNTVGIYIYDDGGGVKAPSAYDVQYWNGTSWVS
AANQIKSPAVPTGSVLNLVTFHTVIATKYRILFTHLPGAKTGVSEIAYVDSNMEPIPVAP
PVIIVEPIINIISPDYGSTVSGMVTIQFKAPGMKNLWARAWHQPDATHTDPNGYDSRFQN
VIPDAEGNGTITFPADQFPHGPTTIILNSWNAPEGDASFTKTADSYLQLYNQGGVTWNQG
IPAAPPQAAGMQMLYQDDFNSALSISKTGAGTRYASLKPDWPNGAEFGEAIFADPIDSVN
PFSILGDDYLRIRVSKAPEGYVDPQGWNRKFVGGLLSSVRLDGTGISATNGYFEARILMP
AGKGAWPAFWLMSKESTGPNHTASTAEIDTVEAYGHNPSGACQAKHWWSGSPESHQTNCS
STNFAYGDNASTWHTYGTKITPTEIIYYIDNVEVWRHSSFAQANTPMYFMLNLALGGGWP
IDLAKYNNQIDMFVDYVRVFEPVLGGSPTPTPTATPTPTATATPTPTPTPLPVGTASASY
TFRMDNVDQVNDGIISYIDTPHNRWTAYESPNATDWVQTDFGSSITRNKANLYIYDDGGG
IKAPSSYDVQFWNGTSWISTANQVKSPLSPVGSQLNSVSFTSVSATKFRVVFTHPAGAKS
GLTEISYESTGGTTPTPTPIPAIFQNNIVFGSAGTGTAEIANPASGNTLDPNFATDFNSY
FNQQFSAQPLSLAIVTPSSVTAGNKSVSQNSSNMALPRQLYAGTVSISNAYGTMSIGDAS
TIGTTVLYGGSSCTIGATSNLTIYGDIVCNGPLTFTGNITGLTIHGNVIAAGGITFKSSV
GSFTVDQTMSAQGSIVFQGSNIAAGIIGGDLIGAGISFKGFTSLSVAGNVSSTQDFMPSS
GNYTSFIIGKSLFVTGKSQFSTFNKVLIQGSYYGKGNIDMHNQISSNGLTVGKSMLSNGS
IDFHGIGAPVNIGNYLGALIKLNFNNNISGNVHLGGIAAGQINISNNFAPANIFIN
NT seq
4131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataatgctgaagcacttttatgtaaaatggttgccgcttgtcttaacatttgctatc
gtggtgagttttctctcaggaattcccgcaacggctgccatcgattcctcaggaacagtt
actgcttcgtacacttaccacggtgataatgtgagccaagtaaatgatgggattttgtcg
tatgatgactcacctaaaaaccgttggacctcctatgaatcacctaattctacggattgg
gtacaaactgaattcacagaagcagtaacgaaaaatacagtaggtatttatatatttgat
gatgggggaggaataaaagctccaagttcttacgatgtccaatattggagtggaactact
tggcttagtgcttcgaaccaggttaaatctcctgcaattcccgcaggaaacgaactgaat
acagttgtatttagcttggtatctgcaactaaatttcgtgttctgtttacacaccaaggc
gcgaaaagtggcgtgacggaaattctttatgtggattcaaacatggaggctccaccaaca
acgccagcagttcccttaggcattgcatctgcctcctacacctttcatcttgatcaagtt
aaccaaattaatgatggaattatatcgtatgacagctcgcctcaaaaccgctggacttcc
tatgaatcacctaatgcaacagactgggtgcagacgaatttcgaaacggataagcttaag
gatacggtaggtatttatatttatgcagatgggggaggggtaaaggcgccaagtgcatac
gatatccaatacttgaatgaaagtgatgtttgggttagtgctgccggacagatcaaatca
ccatcaatcccgctaggcaatgctttaaatatagtttcattcacaccagttgtggctgct
aagttccgtatcttatttacacactccgatgcgaagacgggtataaccgagattgtttat
gtggattcaacgactcaatctatccctgcacctccgtcattagggattgcaacggcatcc
tatgctaattctggtgatccggcaaccaaaatcaatgatgagatcatctcgtttaatgat
tttccacagaaccgatggacagcatatggctcccccaactctacggattgggtacagaca
gaatatgaaagcggcagatcgaagaacacggtaggcatttatatttatgacgatggggga
ggggtaaaggctccaagtgcatacgatgtccaatactggaatggaacttcatgggttagt
gctgctaatcagatcaaatcacccgctgtacctaccggcagtgtattaaacctggttact
tttcatactgtaattgcgacaaagtatcgtattctgtttacgcatctgcctggggcaaag
acaggagtttcggaaatagcttatgtggattcaaatatggagccaattccagtagcacca
ccggtgataatagtggaaccgattataaatataatatctcctgactatggttcaacggtc
tcgggtatggtaactatccaatttaaagcgcctggaatgaagaatctttgggcaagagct
tggcatcagcccgatgcaacgcacacggatcccaatggatatgattccagatttcagaat
gtgatcccagatgctgaagggaatggcacgattactttcccagcggatcaattcccgcat
ggtccaacaacgataatattaaacagctggaatgcgccagagggagatgcttctttcact
aaaaccgctgacagctaccttcaattgtataatcaaggtggagtcacatggaatcaagga
attccagctgcaccgccacaagctgcgggtatgcaaatgctgtatcaagatgacttcaac
tcagcgttgtctatttccaaaacaggcgctggcactaggtatgcttcgcttaaaccggat
tggcctaatggagccgaatttggtgaagccatttttgcggatccgatcgatagtgttaat
ccattctccattcttggagatgattatctgcgtattcgggtaagtaaagctcctgaagga
tacgtagatccacagggctggaatcgtaaattcgtcggtggtctgctctcctccgtccgg
cttgacggtacaggtatttcagctacaaatggttacttcgaagcgcgaattctgatgccc
gccggtaaaggtgcttggccagcattctggttgatgtccaaggaatctacaggacctaat
catacagcatcaactgctgaaatcgatacagtagaagcatatggacataatcctagcgga
gcatgtcaagccaaacattggtggtcgggcagcccagaatcccatcaaaccaattgctca
tctacaaattttgcttatggggataatgcttccacatggcatacttacggtactaaaatt
acaccaacagaaatcatctattacatcgataatgttgaggtttggagacattcgtctttt
gcccaagccaatacaccgatgtatttcatgcttaacctcgctcttggcggtggatggccg
attgaccttgcaaagtataacaatcaaatcgatatgtttgttgattatgtaagagttttc
gagcctgtattaggtggaagtccaacaccaacaccgactgcaacaccaacaccaacagca
acagcaacgccaacaccaacaccaacaccgctcccagtcggaacagcctctgcatcatac
acttttagaatggataacgtagatcaggtcaatgacggcatcatttcttatatcgatact
cctcataatagatggactgcttatgaatcaccgaatgcaacggattgggttcagacggat
tttggcagcagcattactaggaataaagcaaacctctacatttatgatgacggaggcggt
attaaggctcctagcagctatgacgtacaattttggaatggaacgagctggattagtaca
gccaatcaagttaaatcaccgctatcgccagttggaagccagttgaatagtgttagcttt
acttcggtatctgcaaccaagtttcgtgttgtgtttacccatccagcaggggcgaagtca
ggcttaacagaaatttcttatgaaagcacaggtggaacaacacccacaccaacaccaatt
ccggcaatttttcagaataatattgtttttggaagcgcaggtacagggacagcagaaata
gctaatcctgcaagtgggaacacattggatcctaattttgcaacagacttcaatagctac
tttaatcaacaatttagtgcacagccgttgtcacttgccattgttactccaagttcggtt
acagcgggaaataaatctgtttcgcaaaacagcagtaacatggctttgccacggcagctt
tatgccggcactgtttcgatttcaaacgcatatgggacgatgtccataggtgacgcttca
actattgggactacagtactctatggcggaagttcctgcaccataggagcgacatctaac
ttgaccatatatggggatatcgtgtgcaacggaccgcttacctttactggaaatatcact
ggattgacgatccatggaaatgtaattgcagcaggcggcatcacttttaaatcaagtgta
ggatcatttacggttgatcaaactatgagtgcacagggaagcattgtcttccaaggaagt
aacattgcagcgggtattataggtggtgatttaattggggccggaattagttttaaaggc
ttcacttccctatctgtagcgggaaatgtgagtagtacgcaggactttatgccgagcagt
gggaactatacaagctttattatcggcaaatccttgtttgttaccggcaaatcccaattt
tcaaccttcaataaagtactaatccaaggatcttattacggaaaaggtaatatcgatatg
cataatcaaatatcctcaaatggtcttaccgtgggtaaatctatgctttctaatggatct
atcgattttcacggtattggtgccccagtaaatataggcaattatctaggtgccttaatt
aagctgaattttaataataatatttctggcaatgttcatctcggcggtatagcagcaggg
caaataaacatatccaataattttgctccagctaatatttttatcaattag
DBGET
integrated database retrieval system
