Paenibacillus psychroresistens: EHS13_30620
Help
Entry
EHS13_30620 CDS
T06328
Name
(GenBank) glycoside hydrolase
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_42
Cellulase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ98922
UniProt:
A0A6B8RT47
LinkDB
All DBs
Position
complement(6817545..6820703)
Genome browser
AA seq
1052 aa
AA seq
DB search
MKKIVIFYDPAFPYAGARPSEADVEKLQELFTVTRAADLSSALEAADGYIHLHGPYFPKE
SWPAILKHLRSGKGMLAIGGAPFKIPVYLEGTEWVQETAQTAYHQQLHIHEALHADEGPI
KRLVYNPDIPLFLGYEKLFTIEPTFGLILHVTRAADVPHESGSAGPMDAHLYPLLLGVGV
EPLEREYAAPAVLLEHTKGEFAGGRWIFINQQLRQLFWQQEGIEALKRWAGFITKGVTEM
WLKPNYAMYEADERAVLNLQVQSLAPSQYASAITWSFHLKISKSLSSEVQTPEPKYNYSN
EHWSEIWQTECLLKVDKELRFERIRLPFSLEAGFYIAECEAVSELGEKRMLRQGFWGMDT
HLLRAGEPLACGRDYFIKDGKPFPVVGMTYMTSDVARKFLFLPNVAVWDRDMAQMKRAGI
NLIRTGIWTAWRQVMFADGHAYEETLRAIDAFILTAKRYELEVTFNFFAFTPESWEGVNP
YLDPRSVEAQKRFIASIVSRHVETTNVHWDLINEPSMFDPKRIFKGPRTVSDRYEREAYI
AWLRERHGAIRLLQERWNMTPEELPSFEAALPPEQDDISFNTTEMLSKKGGQWLDYSLFT
MDMHNRWAEQLIATIRSYQPKQLVTVGQDEGLAAQRPSPFFYAEAVDYTTVHTWWKMDDL
VWDSVFGKAPEKPTLIQETGIMYVETPDGRAKRSEHELRNILERKYAYAFANGGAGAVQW
IWNVNYYMNNVNESNIGALRADGTEKPEASVSYDFGAFIGRIRDLFKDRELEDTVVVFPY
SNDFSNRPLAYKATTKSVRTLTYRMNTPLRGLGEYHLESLQAYVPKLIIVPSAHNFSDEA
MQQLVKHIEVYGGTLLITGPIGLDAYWHPTTTRLNESLGAGDVVNLLREETLRIENVEWP
VSYGEMRIADSCKQLIAESSGGVSKLVEAKLGEGQLLWCPLPIELNEDPAVIIALYQYAI
QRANVSVELEWLSGEGLRGVYGRKLLLSGGSLFVFVSEYSSDTELAVRDPRTGASYSFKL
ESERSVMFATDTKGQLLDVYRPLEVHITVSLA
NT seq
3159 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatagttattttttatgatcctgcatttccttatgccggagcaagaccaagt
gaagctgatgtagagaaattgcaagagctatttactgtaacaagagcggcggatctgtcg
agcgcattagaagcggcagatggatatattcatttgcatggcccttacttccctaaggaa
agctggcctgcaatccttaagcatctccgttcagggaaagggatgcttgcgattggcgga
gctccatttaagattccggtatatctggaaggcactgagtgggtgcaggaaacggcacaa
accgcttatcatcagcagctgcatattcatgaggcgctgcatgcagatgagggacccatt
aaacggttggtttataatccggacattcctttgtttctgggctacgagaagctgttcact
atcgaaccgacatttggtttgatcctgcatgtgacacgagcggcagatgttccccatgaa
tctggctcggctggtccaatggatgcgcatttatatcccttgctcctaggagtcggagtt
gagccgcttgagcgagagtatgcagctccggcagttttattggaacacacgaagggcgag
tttgccggcgggcgctggattttcattaatcagcagcttcgtcagctattctggcagcag
gaaggcattgaggcgcttaagcgttgggcaggctttattaccaaaggtgtaacggaaatg
tggctgaaaccgaattatgccatgtatgaagcggatgaacgggctgtattaaacttgcaa
gtccaatctctcgcacctagtcagtatgcgtcagcaataacttggtcatttcatctgaag
atttcgaagtccttgtcatcggaggtgcaaactccagagcccaaatacaactattcaaat
gaacattggtcggaaatttggcagacggagtgtttgctgaaggtagacaaggaattgcga
tttgaacggattcgcttgcccttttcgctggaagcaggcttctatatagcggagtgtgag
gctgtttcagaattaggagaaaaacgcatgctgcggcaaggcttttggggtatggatacc
catttgcttagagcgggtgaaccgctagcttgtggccgagattatttcattaaggacggc
aagccatttccagttgtaggcatgacttatatgacaagtgatgtagcgcgtaaatttctc
ttcctgccgaatgtagccgtatgggatcgcgatatggcgcagatgaagcgggcgggaatc
aacttgattcgcactggaatatggacagcttggcgtcaggttatgtttgcagacggccat
gcatatgaagaaaccctgcgggcaatcgatgcttttatattgacggcaaaacgctatgaa
ttagaggtaacctttaacttctttgcgtttactccggaaagctgggagggggttaatccg
tatctcgatccacggagtgtggaggcgcaaaagcgctttattgcttccattgtatccagg
catgtggaaacaacgaatgtgcattgggacttgatcaatgaaccgtcgatgttcgatccg
aagcggatcttcaaaggaccgcggacggtaagcgatcgttatgaacgcgaagcttatatt
gcctggctgagagagcgccatggtgcgattcgcttgctgcaagagcggtggaatatgact
cctgaggagctgccttcctttgaagcagccctgccacctgaacaggatgatattagcttc
aatacaacagaaatgctctccaaaaaaggtggacagtggttggactattctctgtttacg
atggatatgcataatcgttgggcggagcaattgatagctacgattcgcagctatcagcct
aagcagctggttaccgttgggcaggatgaagggcttgcagcgcaaaggccttcaccattc
ttttacgcggaagccgtggattatacgacagtccatacctggtggaaaatggatgatctt
gtatgggacagtgtattcggcaaagcaccagaaaagccgacccttattcaagaaacaggg
ataatgtatgttgaaacaccggatggtcgagctaagcgaagtgagcatgagctgcgcaat
atattggagcgcaaatatgcttatgccttcgcgaatggtggtgctggagctgtacaatgg
atttggaacgttaactactatatgaacaatgtgaacgaatcgaatattggcgcattgcgt
gcagatggaacggagaaaccggaagcatctgtttcctatgattttggggcgtttatcggc
cgaattcgcgatttgtttaaggatcgggagctcgaggatacagtcgttgtttttccgtat
tcgaatgacttttctaaccgtccgttagcctataaagcaacgacaaagtcggttcgaacg
ttaacttatcggatgaacacaccacttcgcggcttaggtgaataccatttggagtcgctg
caggcttatgtgccaaagctgataattgtgcctagtgcccataacttcagtgatgaagcc
atgcaacagctggtcaagcatattgaagtgtacggcggcactttattaataaccggtccg
attggattggatgcttattggcatccgacaaccacgcgtctgaatgagagcttaggggca
ggcgatgtagtcaatttattgcgggaagaaacactgagaattgaaaatgtggaatggccg
gtttcctatggagaaatgcgcattgcagatagctgcaagcagctcattgcggaatcaagc
ggaggtgtatccaaattagtggaggctaagcttggcgaaggccaattactctggtgtccc
ttgcctattgaattaaacgaggatccggcagtgataattgctttatatcaatatgctata
cagcgggcgaacgtttcagttgagctggaatggttatctggcgaaggcttgcgcggggta
tatggccgtaagctgctattatccggcggcagcttgttcgttttcgtatccgagtatagc
agcgacaccgagcttgctgtgcgagatccgcgtacaggagccagttactcatttaaactg
gaaagtgagcgttctgttatgtttgctactgatacaaaaggacagcttcttgacgtatat
cgcccgctggaagttcatattacagtgagcttggcctag
DBGET
integrated database retrieval system
