Paenibacillus psychroresistens: EHS13_35880
Help
Entry
EHS13_35880 CDS
T06328
Name
(GenBank) LPXTG cell wall anchor domain-containing protein
Organism
ppsc
Paenibacillus psychroresistens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_bind
SpaA
Big_9
Big_8
Gram_pos_anchor
Cadherin_5
SdrD_B
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGQ99867
UniProt:
A0A6B8RVA5
LinkDB
All DBs
Position
complement(8076352..8080017)
Genome browser
AA seq
1221 aa
AA seq
DB search
MLKKKVSILIIAALLIVQFANGLGFNKQANAIGNILTGVHLTVKDSDGHTVSNAVYAQGA
DVTLEYTWALPNGHGYTVGSQFTFTLPQKFFLNTSIPSTPLIAGLEIGSFTIDKATHLVT
MTFAGDIADYDEIQGTIIVNTKFDSSEFITSTEQEISFPEIDSSTSIHLQFRPSNSSIIE
KRGYPQGYNAKSVKWEVDVNKTLDTIENGVVTDTIPTGLAVPVSVAVYNLGVSLTGVTTK
LTELASGDYDFTTTGSEIEVKFKGAAATINTAYRIEFETAIINTSSSTFQNTATLAGNHL
AEKTASASVSVQRGSHLIKTAGTYTAADGKLAWQVKYNYDEKTIVQASASLNDYFDDSQT
LDAASIEVRRISLDTAGAESPTLLTLNTDYFINTIPHANGKNGFTLSFPGDITSAYKIDY
KTVKAARYENDNTNVTNTVYAASENKSATKGIQQVVINKSVDSYDYISKTITWKITINGD
KYTMNPVKITDTFNAAEQTFLPGTLEIKDGSTSLSDITDYTVNTSLSAPDNGFSILFTNA
VSNTYTIIYKTQFNTDWLDSNNQYTNHGEIKWTDAITPFNHIKQVTTTFTPNNKAIYNGY
KLGEYNAVTKEITWTVGVNYNRETLLDAVMIDNLLQNQKLIQDSVKVYEMTINANGNVDK
GASVVDTVYELTKADNLLKVKIKGINSSPYIIEFKTSLAGQLLDDAVISNTANLVVGISP
ESKNLTASVTVHKAGEYVNKTGVQDDNKINWKIFINRGQSEVINAKIIDKPSENQNLIQE
SFHLFKTVIEEDGDVSKALGAGSELVKGNDYTLEFKTDIDGNQSFELKLAGTIKTAFLLE
YQSTIAAESGAHVTNAVDFSANNVVLVTKQTIGDVIAAVSSASGTGSGVRGILTVTKVDA
ANTSTVLSGATFALYRLPARALINTITTDMDGKAVFKKLLSGNYVLVETAAPAGYLLDST
DIPVLVNTQNTIINKQVTNVKTATPTPTPSDEPTPTPTPSDEPTPTPTPSEEPTPSPTPS
EEPTPSPTAWHPSTTSSPTPTPTPTATPTETPTPTPTPLEAITTPAPTPTPLAPTATPTP
VVKPTPTPVGEKEVTKQDVPKTGTVEVPEGSTPSIGKDPEHGTVTVTPDGKWVYTPKPGF
IGKDKFSVIITDKDGNEEEIFIDIDVEEVPLGVTPAEGTLPTTGESSHLNMELAGLALIL
LGVGLSRRFAKRREDREFPSS
NT seq
3666 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaagaaaaaagtaagtattctaattattgcggctttactgattgtgcaatttgct
aatggtttggggtttaataagcaggctaatgcgattggaaatattctcacgggtgttcat
ttaactgtaaaagatagtgatggtcatactgtgtcgaatgcggtatatgcccaaggagct
gatgtaacactcgaatatacgtgggctttaccaaatggccatggttatacagttggaagt
caatttacttttacattaccgcaaaagttcttcttaaataccagtatcccatcaaccccg
cttatcgctggattagagataggtagttttacaatagataaagccactcatttagtgact
atgacttttgctggtgatattgcagattatgatgaaatacaaggaacaattatagtaaat
actaagtttgatagcagcgagttcattacatcaacagaacaggaaatttcatttccggag
atagattccagcacatctatccatttacaattcaggccaagtaattcctctataattgag
aaaaggggatacccgcaaggttataatgccaaaagtgttaaatgggaagtggatgttaat
aaaacattggacactattgaaaatggagtcgtaacagatacgattccaacgggactagct
gttccggttagcgtcgctgtttataatctaggtgtcagtctgacaggggtgacaaccaaa
ctaacagaacttgcctccggcgactatgattttacaacaacggggagtgaaatcgaggta
aaatttaaaggtgctgccgccacaattaatacggcatatcgcattgaatttgaaacagca
ataattaacacgagcagttctacctttcaaaatacggctactctagccggaaaccattta
gctgaaaaaactgcaagtgcatcagttagtgttcaacggggtagtcacctaattaaaact
gcgggtacttatacagcggcagatggtaaacttgcttggcaggttaaatataattatgat
gagaaaactattgtacaagcaagtgcttcgttaaacgattattttgatgattcccagaca
ctcgatgctgcttcaattgaggtaagaagaatctcattagatacagctggagcggaatcc
cccacattattaactttgaatacggattatttcataaatacaattccacatgcgaatggt
aagaatggttttacgctatcattcccaggtgacataacatcggcatacaaaattgattat
aaaacagtaaaagcggctcgttacgaaaatgataacactaacgtaactaatacggtttat
gcagcttctgagaataaatcggcaactaaagggattcagcaagtggttattaataaatcc
gtggatagttatgactatataagtaaaacgataacatggaaaattacgattaacggcgat
aagtacacaatgaaccctgtgaaaattacagataccttcaatgcagcggaacaaaccttc
ttgcctggaacacttgagatcaaggatggtagtacaagcttgagtgacataacggattat
accgtgaatacctcactatctgcaccagacaatggatttagcattttgtttactaatgca
gtttctaatacgtatacaataatttataaaactcaattcaatacggactggcttgacagt
aataatcagtatacaaaccatggggaaattaaatggacagatgcaatcactccatttaac
catattaaacaagtaacaactaccttcactcctaataataaggctatctataatggctac
aaattaggagaatataatgcagtaactaaggaaattacttggacggtcggagttaactat
aacagagaaactcttttagacgcggtgatgatagataatctattgcaaaatcaaaagcta
atacaagattctgttaaagtatatgaaatgacaattaatgcaaatggtaatgtagataag
ggagcatctgtggttgatacagtttatgagttaaccaaagctgataatctattaaaagtt
aaaataaaaggaattaacagctctccgtacatcattgaatttaaaacgagtttggctgga
cagctactagatgatgcagtcatctcaaatactgctaatttagttgttggaatttctccg
gaatctaagaacttaaccgcttcagtaactgtgcataaagctggagagtacgttaacaaa
actggagtacaggacgataataagattaattggaaaatatttattaatcgtggacaatcc
gaagttatcaatgcaaaaataatagataaaccaagtgaaaatcaaaatttaattcaggaa
tcatttcatttatttaaaacagtgatcgaagaagatggagatgtatcgaaggcgcttgga
gcaggatcggaattagttaaagggaatgactacacgctagaatttaaaacagatatagat
ggtaatcagtcatttgaattaaaattagcgggtacaattaagacagcttttctcttagag
tatcagtcaactattgccgccgaaagtggagcccatgttacaaatgcagttgattttagc
gctaataatgttgtgcttgtaactaaacaaacaatcggtgatgttattgcagcagtatct
tctgcttctggaacaggaagtggtgttagaggtattctgactgtaacaaaagtcgatgcg
gctaatacatccacagtacttagcggagcaacatttgcattatatcgactacccgctcga
gcattaattaataccattactacagatatggacggtaaagctgtatttaagaagctgctt
tctggtaattatgttttagttgaaacagctgctccagcagggtatttacttgattcaact
gacattccagtcttggttaatactcaaaatacaataattaataagcaagttacaaatgta
aaaacagcaacaccgacaccaacgccgtcagatgagccgacaccgacaccaacgccgtca
gatgagccgacaccaacaccgacgccatcagaagaaccaacgccgtcaccaacaccatca
gaagagccgacgccatcaccaacggcttggcatccaagtacaacgtcatcaccaacaccg
acgccaacgccgactgcaacaccaacggaaacaccgacgccaacaccaacaccgttggaa
gcaataacaacgccagcgccgacaccaacgccacttgcaccaacagcaacaccaacacct
gttgtaaaaccgacaccaaccccggttggcgaaaaggaagttactaagcaggatgttcct
aaaacaggaacagttgaagttccagaaggaagcacaccatcaattggtaaggatccagag
catggaacggttacagttactccagatggcaagtgggtttatacaccgaagcctggtttt
atcggtaaggataaattctccgttattattacagataaagatggtaatgaggaggaaatt
tttatcgacattgatgttgaagaagtacctttaggtgttacaccagccgaaggaactctg
ccgacaacgggagaatccagtcatttgaatatggagttagctggtttagcattaatatta
cttggagtaggattaagcagaagatttgcaaaacgtagagaagatagagaattccctagt
tcataa
DBGET
integrated database retrieval system
