Planktothrix pseudagardhii: NO713_02253
Help
Entry
NO713_02253 CDS
T08299
Symbol
MTR4
Name
(GenBank) DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH9
Organism
ppsu
Planktothrix pseudagardhii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DSHCT
DEAD
ResIII
Helicase_C
DEXQc_Suv3
AAA_22
DUF3516
nSTAND3
ATPase_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAD5946253
UniProt:
A0A9W4G5M1
LinkDB
All DBs
Position
I:2664613..2667306
Genome browser
AA seq
897 aa
AA seq
DB search
MSYSTQNDPQLDLNKLFPFPLDDFQYNAIAALNEGKSVVVCAPTGSGKTLVGEYAIHRAL
AGNRRVFYTTPLKALSNQKYRDFKDLLGPENVGLLTGDISVNRDAAVVVMTTEIFRNMLY
GTPIGEVGTSMEAVEAVVLDECHYMNDRQRGTVWEESIIYCPREIQLVALSATVANSEQL
TDWISRVHGPTELIYSDFRPVPLQYHFCNTKGLFPLLDNSLKKINPRLKERKGPPQRGRN
RNDVPNLTAVISHLQERDMLPAIYFIFSRKGCDRSVAEVRHLSLVTEAEAALLKKHIDAF
VAASPEGIRPDQLEVLYRGIAAHHAGLLPTWKGLVEELFQQGLIKVVFATETLAAGINMP
ARTTVISSLSKRTDDGHRLLKPSEFLQMSGRAGRRGMDIEGYVVTVQTPFEGAKEAAYLA
TSKPDPLVSQFTPSYGMVLNLLQRHTLEEAKELIERSFGQYLSTINLIPAQREIEIMQAE
LALIEAQFGFRGEQNMAILEETLASFEKIYERLREERRLLKLLQRQAEDSRMHQMALAMD
STSLGTIVGLRGKHVPTARSFEADPIPAVLVAKTPSSGQAPYFLCLGRDNRWYVVSSADI
VILQPQSQRLNVDYVDIPNIPFKLGQCRKGDELTVAIVQQIPNLMLPEPPPEVITQQEQV
ERLELELDAHPIHEWGKPNKLLKRWQRWAELDEIIQERRTELEEDLARHWQEFLALISIL
QYCEALDELKPTDLGQATAALRGDNELWLGLALKSGIFDDLDPHHLAAACAALVTEVYRP
DSWTRYHLSDDVENALGRLRGIRQELFKQQRRYRVALPIWLERDLTGLIEQWALETDWLE
LVANTSLDEGDIVRMFRRTLDFLSQIPHVPHLSESLKQNAIRARHLIDRFPINEAVD
NT seq
2694 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtcctactctacccaaaacgatccccaactggatctcaacaagctgtttccgtttccc
ctggatgactttcagtacaacgccattgctgcgttgaatgaaggaaaatccgttgtcgtc
tgtgcaccaacggggtcgggaaaaacgttagtgggggaatatgctatccatcgggcgtta
gcgggtaataggcgggtcttctacacaacacccctaaaagctttatctaatcagaagtat
agggactttaaagatctactagggccagaaaatgtggggttactgacgggggatatttcc
gttaaccgggatgcggcggtggtggtgatgacaacagagatcttccgcaatatgctttat
ggtacaccgattggcgaggtgggaacctctatggaagcagtggaggcggtggttttagat
gaatgccattatatgaatgatcgccaacgggggacggtttgggaagagtcaattatttat
tgtccccgtgaaattcaattagtggctttatctgcaaccgtcgctaatagtgaacaatta
acagactggatttctagggttcatggcccaacggagttaatttattctgactttcgacct
gtaccgttgcaatatcatttttgcaataccaaagggctatttccgttattagataattct
ttaaaaaaaattaatccccgcctcaaagaacgtaaaggccctcctcaacggggtagaaat
cgcaatgatgttcccaatttaacggcggttatttcccatctgcaagaacgggatatgtta
cctgctatttattttatctttagtcgcaaaggatgcgatcgctctgtagcagaagtgcgt
catttatccttagttacagaagccgaagctgccctgttaaaaaaacacattgatgccttt
gttgctgctagtccagaaggcattcgtcccgaccaattagaagtattatatcgaggtatt
gccgcccaccatgcgggattattacccacttggaaagggttagttgaggagttatttcaa
caaggattaattaaagtagtgtttgccacagaaaccctggctgctggcattaatatgccc
gctagaacaacggtgatttcgagtttatcgaaacgaaccgatgatggtcatcgcttatta
aaaccctcggaattcttgcaaatgtcgggacgggctggacgacggggtatggatattgaa
gggtatgttgtcacggtacaaaccccttttgaaggggcaaaagaagccgcttatttagca
acgtctaaacctgacccgttagtgagtcaatttacgcctagttatggcatggttttgaat
ttattacaacgccatactttagaagaagcgaaagaattaattgaacggagtttcggacaa
tatttatcaacgattaatttaattcccgcccaacgagaaatcgaaattatgcaagcggaa
ttagcgttaattgaagcccaatttggctttcgaggcgaacaaaatatggcaattttggag
gaaaccttagccagttttgaaaaaatttatgaacgtttgcgagaggaacgccgtttatta
aagttattacagcgccaagccgaagacagtcgaatgcaccagatggctttagcgatggac
tcaacgtcattaggaacgattgtcgggttacgcggaaaacacgtccccaccgcccggagt
tttgaggctgaccccattccggcggtattagtcgcaaaaacccccagttcgggacaagcc
ccctatttcctgtgtttaggacgggataatcgttggtatgtggtgagttcggcggatatc
gtgattttacaaccccagtctcaacggttaaatgtggattatgtcgatattcctaatatt
ccgtttaaattagggcaatgtcgcaaaggggatgagttaacggtggcgattgtgcaacaa
attcccaatttaatgttacctgaacctccgccagaagtgattacccaacaagaacaagtg
gaacgattagagttagaattagatgcccatccgattcatgaatggggtaaacccaataaa
ctgttaaaacggtggcaacggtgggcggaattggatgaaattattcaagaacgacgcacg
gaattagaagaagatttagcccgtcattggcaagaatttttagctttaatttcgattttg
caatattgtgaagccttagatgaattaaaaccaacggatttaggtcaagcaacggctgcc
ttacgcggtgataatgaattgtggttagggttagccttaaaatcagggatttttgatgat
cttgacccccatcatttagcggcggcttgtgcggcgttagttacggaggtttatcgtccc
gatagttggactcgctatcacttatctgatgatgtggaaaatgctctcggacggttgcgg
ggtattcgtcaggagttatttaagcagcagcgacgctatcgtgtggcgttaccgatttgg
ctagaacgggatttaacgggtttaattgaacaatgggctttagaaaccgattggttagag
ttagtcgctaataccagtttagatgagggggacattgtgcgaatgttccggcgcacgtta
gattttctttcacaaatccctcatgttcctcatttaagcgagtcactaaaacaaaatgcc
attcgtgcccgccatttaattgatcgattcccgattaatgaagcggtggattag
DBGET
integrated database retrieval system
