Persicobacter psychrovividus: PEPS_46200
Help
Entry
PEPS_46200 CDS
T09740
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
ppsv
Persicobacter psychrovividus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
Y_Y_Y
HTH_18
HisKA
HTH_AraC
SGL
XTBD
Isocitrate_DH_C_bact
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDD02340
UniProt:
A0ABN6LGQ6
LinkDB
All DBs
Position
pPP8:complement(111828..115994)
Genome browser
AA seq
1388 aa
AA seq
DB search
MIKHLLCLVVFTILSLHVFADFRHLSTKNGLSQNDINCVFQDSKGFVWVGTHDGLNRFDG
LSIEVFHPTDKPYSIKSNLPYTIIEDKRGYLWIGSSDLGISRYDPRSQQFVNFYNDKPRH
LLTSNRVTNLTFDKQGNLWVGTVDGLNKIEAESLYGEEKDLKIQQFYYNPHNPTSLHSSN
IKSIYCDKYGKIWVGSAAGLQRFIPNEQNGMGAFESFENIPNIEVLGIIEGNNRIIMFNN
SGVFWFDPNTDRPYEKISDLTGIRALIFSASKEIWVGTVNGLYQCTMNRQLGKLEVKEHF
KHDVFKQNSISTNVIRFLTEDQNGNIWVGTNGGGINFYNPHQKKFHQFTKNTNDKSLNIS
KVKSLYEDRNGNLWVGLDGMGIDFLERKYFLDNNYDHFIHLVEGEEVASQRVAYDICEWK
NKVYIGCGYPKKLMVFEKGIPTQKQLDQQQKRKDITNAIFCLKNDGDSILWMGSYDGGLY
RQTMQANGEIKIDNFVNGSKDKHQLASKIVRSIAVDKKGNLLIGTDLGLRILPKSEKLSD
QPKFEYVSMLPAKESHYILSTYVDSENNYWIGTLGKGLFKVQLGKGQSRGGKFEVSQIGK
NSLSNNVIKAIVEDNYGNIWVSTNKGLNSIDMESFDTRIFSYGEGLQDNEFSENAALKQA
NGRLMFGGVNGVNYFFPHEIVEDRTTAPIQFTNLYVNNTLIQPQKSYRGGVILQKSITYS
REITLNYYQNNFSIDFACLHFGSPENNVYKYFLEGFDDQWSKLQGQNRTIRYTNLPSGEY
TLRLKGANYDGIMQDEDRTLKITVLKPWWYSHWAVSVYIILGLIILWFASRFTIISAQKK
QQLIMDHFEREKLEELSQLKMMFFTNISHELRTPLTLIHGPLQKMLNMAKGNGQQVDDLQ
LISKNVNYLMRLINQLMDFRKVENGKMDLKVRVYDWHFVTHQALLSFQELADQKKISISF
HSDQKNILGWMDLDKYEKILYNLLSNAFKFTEASGQVKVTVGLKQHENIKGVCVQVTDTG
CGIPQDQQPLIFERFYQVNTLGNVKKRGTGIGLSFSKSLVELHHGTIDLESKIGEGSTFV
LWFPLEKEAYDEDEIIATLDQDQKDEYYLAEEENEEIGYVETRGRKRKIPKVLIVEDNPD
IRKFIVESLKENHYLYEAENGKEALEVIKTSNPDIIISDIMMPEMDGYELVKAVRNDIDY
CHLPIILLTAKTEVKDQIHGFENGADAFVSKPFNPEVLIARIHSLVNGRQVMQKKFRKGV
DVSPSEVTTTSMDEKFLSRLMSILEEHISNSEFTVEMLAREYGASTISINQKLKALSGQT
AKSFIRTVRLKRAAQLLELDRFSVSEVTYEVGFNDLKYFRNCFKKEFGICPSQYGKKEDI
PQHEEIDS
NT seq
4167 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaacatttactctgtctggtggtattcaccattttatctcttcatgtttttgct
gattttaggcatttatctactaaaaatggattatcccaaaatgatattaattgtgttttt
caggatagtaaaggcttcgtgtgggtaggaacgcatgatggcttaaacagatttgatggt
ttatcaatagaagtgtttcacccaaccgataagccctattcgatcaagtcaaatttacca
tatacaattattgaggacaaaaggggttatttatggattggttcaagcgatttgggtatt
tccaggtatgatccaagatcacagcaattcgttaatttttataatgataagccaaggcat
ttgttaaccagtaatagagttaccaaccttacatttgataagcaaggtaacttatgggtt
ggtactgttgatggcttaaataaaattgaagctgaatctctttatggggaggagaaggac
cttaaaatccaacaattttattataacccgcacaatccaacaagtttacattcctcgaat
attaaaagtatttattgtgacaaatatggcaaaatttgggtaggttctgctgcagggcta
caacgatttattcctaatgaacaaaacggaatgggagcattcgaatcctttgagaatatc
cccaatattgaagtattaggaataattgaaggaaataatagaattatcatgtttaataat
tcaggagttttttggtttgaccctaatacagataggccttatgaaaaaatctcggatctt
acgggcataagagcgcttattttctcagcgagtaaggagatctgggtagggacggtcaat
ggtttatatcaatgcacgatgaaccgacagctgggaaaacttgaggtaaaggaacacttt
aagcatgatgtttttaaacaaaacagtatcagcacgaatgttattcgatttttgaccgaa
gaccagaatggaaatatttgggtaggaaccaatggcggaggtataaatttttataaccct
catcaaaagaaatttcatcaattcacgaaaaacacaaatgataaatcgctaaatatcagt
aaagtaaaaagtttgtacgaggataggaatgggaatttatgggttgggcttgatggaatg
ggcattgactttttggagcgaaaatattttttagacaataattatgatcatttcattcac
ctggtcgagggtgaggaagttgcctcgcagagggttgcctatgatatctgtgaatggaag
aacaaagtgtatataggctgtgggtatccaaagaaattgatggtttttgagaaaggtatc
ccaactcaaaaacagctcgatcaacaacaaaagcggaaggacatcaccaacgctattttt
tgcctaaagaatgatggcgattcaattttgtggatggggagttatgatggtggtttgtat
cgacaaaccatgcaagcaaatggtgaaatcaaaatagataattttgtcaatggctctaaa
gataagcatcagttagcatcaaaaattgttcgatcgatagccgttgataaaaagggtaat
ctgttaattggaaccgatctgggcttaagaattttgcccaaaagtgagaaacttagtgat
cagccaaagtttgagtatgtgtcgatgctgcctgccaaagaaagccactatatcttaagt
acttatgttgattcagagaataattattggattggcaccttaggaaaagggctttttaaa
gttcagcttggaaaggggcaaagtaggggtggaaaatttgaggttagccaaattgggaaa
aattcactgtcgaataatgtcattaaagccatagtagaagataactacggaaatatttgg
gtgagtacaaacaaaggcctgaatagtattgatatggaatcgtttgacactcggatattt
tcttacggtgaaggcctacaagataacgaattctctgaaaatgcagcccttaagcaggct
aatggtaggctaatgttcggaggagttaatggtgtgaactatttttttccacatgaaatt
gtagaggatagaaccaccgctccgatacagtttactaatttatatgtaaataatacttta
attcaacctcaaaaaagttatagaggaggagtgattttacaaaaatctattacctactct
cgagagatcacccttaactactatcaaaataacttttctattgattttgcttgtttacat
tttggatctccggaaaacaacgtctataagtattttcttgaaggctttgacgatcaatgg
tcaaaacttcaaggacaaaacagaaccattaggtacaccaatttaccttctggggaatat
acccttaggttgaaaggggcaaattacgatgggatcatgcaggatgaggatcgaacactt
aaaattaccgtactgaagccgtggtggtacagtcattgggcagttagtgtttacattatt
ctgggactgatcatcttatggtttgcctcccgttttaccattatttcggcacagaagaag
caacaattaatcatggatcattttgagcgagaaaaattggaggaattgagtcagcttaaa
atgatgttttttaccaatatatcgcatgagttgcgaacgcctctgacgctgattcatgga
ccattgcaaaagatgctaaatatggctaagggcaatggtcagcaggtcgatgacctgcag
cttatctccaaaaatgtcaattacttgatgcgtctaattaatcagctgatggatttccgt
aaggttgaaaatgggaaaatggatttgaaggttcgggtttatgattggcactttgttacg
catcaagccttgttgtcatttcaggaattagctgatcaaaaaaagataagcatcagtttt
cattcagaccaaaaaaatatcttaggatggatggatctggataaatatgaaaagattctt
tataacttattatcgaacgcttttaaatttaccgaagcatctggtcaggttaaggtaacg
gttggattgaagcaacacgaaaatataaaaggtgtttgtgtacaggttacagatacaggt
tgtggtattccacaagaccagcaaccattaatttttgagcgtttttatcaggtcaatacc
ctgggaaatgtaaagaagcgaggaacaggtattggcttatctttcagtaaatcattggtg
gaattgcatcatggtacaattgatcttgagagtaaaatcggggagggaagtacctttgtc
ttatggtttcctttagaaaaagaagcctatgatgaggacgaaattatcgccacccttgat
caagatcagaaggacgagtactatctggctgaggaggaaaatgaggaaattgggtatgtg
gaaacccgtggtagaaagcgtaaaatccccaaggtacttatcgtagaagataatcccgat
attcgtaaatttatcgtggaaagcttaaaagaaaaccattatctttatgaggctgaaaat
ggtaaagaagcccttgaggtcataaaaacctcgaatcctgatattattatttcagacatc
atgatgccagagatggatggctatgaattggtgaaagctgttcgaaatgatatagattat
tgtcatttgccgattatattattgaccgccaaaacagaggtcaaagatcagattcatggt
ttcgaaaatggtgctgatgcctttgtgtccaaaccgtttaatccagaggtattaatcgca
aggattcattctttggtgaatggccgccaagtgatgcaaaagaaattccgaaagggggtt
gatgtttcaccaagtgaagtaacgacaacctcgatggatgagaaattcttgtcaaggcta
atgagtattttggaagaacatatttctaattcggaatttacagtggaaatgttagcacgt
gaatacggtgcttcgaccatcagcattaatcaaaaactgaaagctttaagtgggcagacg
gccaaaagtttcattagaactgttcgcttaaaaagagcggcgcaactactggaattggat
cgattctcagtttcagaagtcacctatgaggtaggctttaatgacctaaaatattttaga
aactgtttcaaaaaagagtttggcatttgcccatctcaatatgggaagaaggaagatatt
ccgcagcacgaggagatagatagttga
DBGET
integrated database retrieval system